MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Breinl

Total Repeats: 18149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020993	ATA	2	6	44	49	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693374
2	NC_020993	GGA	2	6	70	75	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478693374
3	NC_020993	ATA	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693374
4	NC_020993	AGA	3	9	145	153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693374
5	NC_020993	GTA	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693374
6	NC_020993	GCA	2	6	249	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020993	TTC	2	6	290	295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020993	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
9	NC_020993	ATT	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693375
10	NC_020993	TTC	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693375
11	NC_020993	AAT	3	9	412	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
12	NC_020993	AAT	2	6	460	465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
13	NC_020993	AAG	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693375
14	NC_020993	ATT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020993	ACG	2	6	740	745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693376
16	NC_020993	TCT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693376
17	NC_020993	ATT	2	6	843	848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693376
18	NC_020993	CAT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693377
19	NC_020993	CCG	2	6	1123	1128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478693377
20	NC_020993	ACG	3	9	1444	1452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693378
21	NC_020993	CAG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693378
22	NC_020993	ATA	2	6	1642	1647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020993	TGA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020993	AAG	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
25	NC_020993	TTA	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
26	NC_020993	TAG	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693379
27	NC_020993	TAA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
28	NC_020993	TGG	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693379
29	NC_020993	ATT	2	6	2030	2035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
30	NC_020993	TTA	2	6	2046	2051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
31	NC_020993	AAG	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
32	NC_020993	TAA	2	6	2156	2161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
33	NC_020993	AGA	2	6	2168	2173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
34	NC_020993	TAT	2	6	2204	2209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
35	NC_020993	TTG	2	6	2221	2226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693379
36	NC_020993	CAT	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693379
37	NC_020993	TAA	2	6	2312	2317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
38	NC_020993	AAT	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
39	NC_020993	GTG	2	6	2356	2361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693379
40	NC_020993	TAT	2	6	2594	2599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020993	TCT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020993	AAT	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693380
43	NC_020993	GCA	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693380
44	NC_020993	AAG	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
45	NC_020993	TAT	2	6	2722	2727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
46	NC_020993	AGA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
47	NC_020993	TAT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
48	NC_020993	TAA	2	6	3043	3048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693380
49	NC_020993	ATC	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693380
50	NC_020993	TAT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
51	NC_020993	AAG	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
52	NC_020993	ATA	2	6	3256	3261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020993	TTA	2	6	3335	3340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020993	TAC	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020993	GTG	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020993	ATT	2	6	3403	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020993	CTT	2	6	3414	3419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020993	TTC	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020993	ATA	2	6	3526	3531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
60	NC_020993	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693381
61	NC_020993	ACT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693381
62	NC_020993	GAT	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693381
63	NC_020993	TGG	3	9	3785	3793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693381
64	NC_020993	TGG	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693381
65	NC_020993	ATG	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693381
66	NC_020993	TAA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
67	NC_020993	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
68	NC_020993	ATT	2	6	4030	4035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020993	GAT	2	6	4040	4045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020993	ATA	2	6	4133	4138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693382
71	NC_020993	TTA	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693382
72	NC_020993	TTA	2	6	4297	4302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020993	AAG	3	9	4312	4320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020993	TTA	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020993	TTG	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
76	NC_020993	GTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
77	NC_020993	TGA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693383
78	NC_020993	CAA	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478693383
79	NC_020993	TTG	2	6	4610	4615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
80	NC_020993	TAA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693383
81	NC_020993	GTT	2	6	4715	4720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
82	NC_020993	ATT	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693383
83	NC_020993	TTC	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693383
84	NC_020993	AGA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
85	NC_020993	AGA	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
86	NC_020993	AAG	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
87	NC_020993	AAG	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
88	NC_020993	CTG	4	12	5309	5320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478693383
89	NC_020993	TAT	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693383
90	NC_020993	TTA	2	6	5351	5356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693383
91	NC_020993	ATG	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020993	CAG	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020993	ATG	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020993	TTA	2	6	5775	5780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020993	GTT	2	6	5787	5792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020993	ATT	2	6	5909	5914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020993	TTA	2	6	5936	5941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020993	ATA	2	6	6080	6085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020993	TAA	2	6	6119	6124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020993	AAT	2	6	6169	6174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020993	ATT	2	6	6183	6188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020993	TGT	2	6	6194	6199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020993	AAT	2	6	6200	6205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020993	ATG	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020993	TAA	2	6	6303	6308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020993	TAA	3	9	6312	6320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020993	ATA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020993	TAA	2	6	6452	6457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020993	ATT	2	6	6469	6474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
110	NC_020993	TAT	2	6	6638	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
111	NC_020993	GAA	2	6	6671	6676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693384
112	NC_020993	ATT	2	6	6721	6726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
113	NC_020993	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693384
114	NC_020993	TAT	2	6	6881	6886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
115	NC_020993	TAT	2	6	6980	6985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
116	NC_020993	TAT	2	6	6994	6999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
117	NC_020993	ATT	2	6	7019	7024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
118	NC_020993	AGT	2	6	7042	7047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693384
119	NC_020993	ATT	2	6	7072	7077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
120	NC_020993	AGG	2	6	7251	7256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478693384
121	NC_020993	TAA	2	6	7262	7267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693384
122	NC_020993	TAT	2	6	7334	7339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
123	NC_020993	GAT	3	9	7413	7421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693384
124	NC_020993	CTG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478693384
125	NC_020993	TAT	2	6	7598	7603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
126	NC_020993	CTA	2	6	7651	7656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693384
127	NC_020993	ATT	3	9	7672	7680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693384
128	NC_020993	TTA	2	6	7695	7700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020993	AAC	2	6	7763	7768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020993	ATT	2	6	7782	7787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020993	CAT	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693385
132	NC_020993	TTC	2	6	7939	7944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693385
133	NC_020993	TAC	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693385
134	NC_020993	ACT	2	6	7987	7992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693385
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