MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 1024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020992	TAAT	2	8	1932	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020992	TATT	2	8	8988	8995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020992	TTGT	2	8	9114	9121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020992	TTTC	2	8	11020	11027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020992	TTCT	2	8	14497	14504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020992	TTAT	2	8	14584	14591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020992	TTTA	2	8	14642	14649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020992	TAAT	2	8	14888	14895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020992	CATT	2	8	19191	19198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020992	GATA	2	8	23647	23654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020992	TAAA	2	8	23980	23987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020992	AAAG	2	8	24092	24099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020992	ATAA	2	8	24201	24208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020992	ATTA	2	8	24674	24681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020992	TTTA	2	8	26669	26676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020992	ATTA	2	8	27822	27829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020992	CTAA	2	8	30467	30474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020992	CTTA	2	8	30890	30897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020992	ATAA	2	8	31781	31788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020992	AATT	2	8	33601	33608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020992	AAGT	2	8	35603	35610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020992	AGTA	2	8	41625	41632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020992	TAAT	2	8	41716	41723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020992	TATT	2	8	41818	41825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020992	TATT	2	8	41888	41895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020992	TAAA	2	8	42469	42476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020992	TCAC	2	8	45627	45634	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020992	ATCT	2	8	48443	48450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020992	TGCT	2	8	49958	49965	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020992	TTTA	2	8	50021	50028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020992	TTTG	2	8	50069	50076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020992	AGTT	2	8	52367	52374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020992	GTAA	2	8	52414	52421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020992	TCAT	2	8	52543	52550	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020992	AGTA	2	8	52675	52682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020992	TAAG	2	8	52712	52719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020992	TTAC	2	8	59096	59103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020992	TGAC	2	8	59134	59141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020992	TTAC	2	8	67491	67498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020992	TTTA	2	8	70800	70807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020992	TATG	2	8	71776	71783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020992	AAAT	2	8	72773	72780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020992	AATA	2	8	72898	72905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020992	TTAT	2	8	73567	73574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020992	AAAT	2	8	73930	73937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020992	TTAA	2	8	74190	74197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020992	TACT	2	8	74262	74269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020992	TAGT	2	8	74356	74363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020992	ATTG	2	8	77818	77825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020992	TGAT	2	8	77852	77859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020992	ACTT	2	8	78093	78100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020992	TAAA	2	8	80809	80816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020992	AGAA	2	8	84454	84461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020992	TAAT	2	8	84707	84714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020992	TTAG	2	8	84999	85006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020992	TTTA	2	8	86463	86470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020992	ACAT	2	8	87651	87658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020992	TTAC	2	8	87674	87681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020992	AAAG	2	8	87846	87853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020992	AGTA	2	8	89521	89528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020992	CAAG	2	8	89691	89698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020992	AATA	2	8	89852	89859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020992	ATTA	2	8	90354	90361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020992	GTAA	2	8	90478	90485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020992	ACAA	2	8	90512	90519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020992	TAAT	2	8	90633	90640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020992	TTTA	2	8	90889	90896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_020992	ATTT	2	8	91068	91075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020992	GAAA	2	8	91133	91140	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020992	AATA	2	8	91143	91150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020992	TTAT	2	8	95001	95008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020992	GAAA	2	8	95982	95989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020992	CGTT	2	8	96008	96015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020992	TAAA	2	8	99222	99229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020992	TACT	2	8	99264	99271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020992	TTTA	2	8	104245	104252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020992	TTAA	2	8	104433	104440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020992	ATAA	2	8	106137	106144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020992	TTGA	2	8	108446	108453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020992	GCAA	2	8	112930	112937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020992	TAGA	2	8	113127	113134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020992	ATTT	2	8	113404	113411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020992	ATTA	2	8	113936	113943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020992	TATT	2	8	124759	124766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_020992	AATA	2	8	125495	125502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020992	TAAT	2	8	125585	125592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020992	AGAA	2	8	125997	126004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_020992	ATTA	2	8	131242	131249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020992	AAAC	2	8	139264	139271	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020992	TAAA	2	8	139439	139446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020992	CTTA	2	8	139656	139663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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99	NC_020992	ATAA	2	8	145669	145676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020992	TTAA	2	8	145735	145742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020992	ACAT	2	8	146001	146008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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103	NC_020992	ATAA	2	8	146207	146214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020992	AATA	2	8	146270	146277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_020992	ACGA	2	8	147954	147961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020992	AAAT	2	8	151334	151341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020992	ATTT	2	8	151436	151443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020992	AGAA	2	8	152197	152204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020992	AAAT	2	8	152239	152246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020992	CAAA	2	8	152565	152572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020992	CTAT	2	8	152655	152662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020992	TAAT	2	8	152794	152801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020992	CAAA	2	8	153004	153011	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020992	ATAA	2	8	154256	154263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020992	ATAA	2	8	154287	154294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020992	TATT	2	8	154325	154332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020992	TGTA	2	8	155130	155137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020992	AAAT	3	12	155268	155279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020992	AAGA	2	8	159007	159014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020992	ATTA	2	8	161622	161629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020992	TAAT	2	8	162889	162896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020992	TGTT	2	8	162934	162941	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020992	TGAT	2	8	163295	163302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020992	TAAT	2	8	163857	163864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020992	ATCT	2	8	163959	163966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020992	TATT	2	8	164005	164012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020992	TTAC	2	8	164196	164203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020992	TTGA	2	8	164365	164372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020992	ATAA	2	8	164397	164404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020992	ACTT	2	8	164473	164480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020992	AATA	2	8	164649	164656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020992	TCTT	2	8	169184	169191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020992	TAAT	2	8	169254	169261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020992	ACTT	2	8	169274	169281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020992	TAAA	2	8	175072	175079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020992	AAAT	2	8	175120	175127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020992	AATA	2	8	176479	176486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020992	ATTT	2	8	177816	177823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_020992	GAAT	2	8	190358	190365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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