MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 2481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020992	CAAA	2	8	330	337	75 %	0 %	0 %	25 %	478692435
2	NC_020992	ATTT	2	8	1712	1719	25 %	75 %	0 %	0 %	478692436
3	NC_020992	TAAA	2	8	2245	2252	75 %	25 %	0 %	0 %	478692437
4	NC_020992	ATAA	2	8	2301	2308	75 %	25 %	0 %	0 %	478692437
5	NC_020992	AATG	2	8	3093	3100	50 %	25 %	25 %	0 %	478692437
6	NC_020992	TCTT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	478692438
7	NC_020992	TAAA	2	8	3861	3868	75 %	25 %	0 %	0 %	478692438
8	NC_020992	TAAT	2	8	4326	4333	50 %	50 %	0 %	0 %	478692438
9	NC_020992	ATTA	3	12	5310	5321	50 %	50 %	0 %	0 %	478692440
10	NC_020992	TGCT	2	8	5564	5571	0 %	50 %	25 %	25 %	478692440
11	NC_020992	TAAA	2	8	5741	5748	75 %	25 %	0 %	0 %	478692440
12	NC_020992	GAAT	2	8	6276	6283	50 %	25 %	25 %	0 %	478692441
13	NC_020992	CTTT	2	8	6384	6391	0 %	75 %	0 %	25 %	478692441
14	NC_020992	TCTT	2	8	6535	6542	0 %	75 %	0 %	25 %	478692441
15	NC_020992	TGTA	2	8	7575	7582	25 %	50 %	25 %	0 %	478692442
16	NC_020992	TCAA	2	8	7834	7841	50 %	25 %	0 %	25 %	478692442
17	NC_020992	AAAG	2	8	8005	8012	75 %	0 %	25 %	0 %	478692442
18	NC_020992	AAGA	2	8	8382	8389	75 %	0 %	25 %	0 %	478692442
19	NC_020992	TAAA	2	8	8794	8801	75 %	25 %	0 %	0 %	478692443
20	NC_020992	AACA	2	8	8862	8869	75 %	0 %	0 %	25 %	478692444
21	NC_020992	CAAA	2	8	8880	8887	75 %	0 %	0 %	25 %	478692444
22	NC_020992	ACAA	2	8	9550	9557	75 %	0 %	0 %	25 %	478692445
23	NC_020992	AGTG	2	8	9574	9581	25 %	25 %	50 %	0 %	478692445
24	NC_020992	TAAA	2	8	10221	10228	75 %	25 %	0 %	0 %	478692445
25	NC_020992	CCTG	2	8	11288	11295	0 %	25 %	25 %	50 %	478692446
26	NC_020992	ATTC	2	8	11338	11345	25 %	50 %	0 %	25 %	478692446
27	NC_020992	TTTA	2	8	11838	11845	25 %	75 %	0 %	0 %	478692447
28	NC_020992	ATCA	2	8	12090	12097	50 %	25 %	0 %	25 %	478692447
29	NC_020992	TATT	2	8	12143	12150	25 %	75 %	0 %	0 %	478692447
30	NC_020992	TTTA	2	8	12390	12397	25 %	75 %	0 %	0 %	478692447
31	NC_020992	ATTA	2	8	12498	12505	50 %	50 %	0 %	0 %	478692448
32	NC_020992	TTCT	2	8	13389	13396	0 %	75 %	0 %	25 %	478692448
33	NC_020992	AATT	2	8	13468	13475	50 %	50 %	0 %	0 %	478692448
34	NC_020992	AATT	2	8	13876	13883	50 %	50 %	0 %	0 %	478692448
35	NC_020992	TTTA	2	8	14034	14041	25 %	75 %	0 %	0 %	478692449
36	NC_020992	AAAT	2	8	15174	15181	75 %	25 %	0 %	0 %	478692450
37	NC_020992	ATTT	2	8	15268	15275	25 %	75 %	0 %	0 %	478692450
38	NC_020992	CTAT	2	8	15290	15297	25 %	50 %	0 %	25 %	478692450
39	NC_020992	GTAA	2	8	15831	15838	50 %	25 %	25 %	0 %	478692450
40	NC_020992	CCTT	2	8	16832	16839	0 %	50 %	0 %	50 %	478692450
41	NC_020992	ATTT	2	8	16969	16976	25 %	75 %	0 %	0 %	478692450
42	NC_020992	AGCA	2	8	17217	17224	50 %	0 %	25 %	25 %	478692450
43	NC_020992	AATA	2	8	17964	17971	75 %	25 %	0 %	0 %	478692450
44	NC_020992	ATTA	2	8	18289	18296	50 %	50 %	0 %	0 %	478692450
45	NC_020992	GAAG	2	8	18749	18756	50 %	0 %	50 %	0 %	478692450
46	NC_020992	TAAT	2	8	18977	18984	50 %	50 %	0 %	0 %	478692450
47	NC_020992	TTTA	2	8	19266	19273	25 %	75 %	0 %	0 %	478692451
48	NC_020992	AATT	2	8	19666	19673	50 %	50 %	0 %	0 %	478692451
49	NC_020992	TACT	2	8	19773	19780	25 %	50 %	0 %	25 %	478692451
50	NC_020992	TAAT	2	8	19826	19833	50 %	50 %	0 %	0 %	478692451
51	NC_020992	AATA	2	8	20140	20147	75 %	25 %	0 %	0 %	478692451
52	NC_020992	TCAT	2	8	20273	20280	25 %	50 %	0 %	25 %	478692451
53	NC_020992	GACC	2	8	21018	21025	25 %	0 %	25 %	50 %	478692451
54	NC_020992	TTAA	2	8	21257	21264	50 %	50 %	0 %	0 %	478692451
55	NC_020992	TTGC	2	8	21483	21490	0 %	50 %	25 %	25 %	478692451
56	NC_020992	TTTA	2	8	21592	21599	25 %	75 %	0 %	0 %	478692451
57	NC_020992	TTTG	2	8	21785	21792	0 %	75 %	25 %	0 %	478692451
58	NC_020992	GATT	2	8	22320	22327	25 %	50 %	25 %	0 %	478692451
59	NC_020992	AGAT	2	8	22444	22451	50 %	25 %	25 %	0 %	478692451
60	NC_020992	ATAA	2	8	22762	22769	75 %	25 %	0 %	0 %	478692451
61	NC_020992	TCAA	2	8	23282	23289	50 %	25 %	0 %	25 %	478692451
62	NC_020992	TTCT	2	8	23327	23334	0 %	75 %	0 %	25 %	478692451
63	NC_020992	ACTT	2	8	24280	24287	25 %	50 %	0 %	25 %	478692452
64	NC_020992	AAAT	2	8	25099	25106	75 %	25 %	0 %	0 %	478692453
65	NC_020992	TACA	2	8	25758	25765	50 %	25 %	0 %	25 %	478692454
66	NC_020992	AATT	2	8	25770	25777	50 %	50 %	0 %	0 %	478692454
67	NC_020992	TAAT	2	8	26124	26131	50 %	50 %	0 %	0 %	478692454
68	NC_020992	ACCA	2	8	26262	26269	50 %	0 %	0 %	50 %	478692455
69	NC_020992	ATCA	2	8	28244	28251	50 %	25 %	0 %	25 %	478692458
70	NC_020992	TTCT	2	8	28753	28760	0 %	75 %	0 %	25 %	478692458
71	NC_020992	GCAT	2	8	28875	28882	25 %	25 %	25 %	25 %	478692458
72	NC_020992	TCAT	2	8	28998	29005	25 %	50 %	0 %	25 %	478692458
73	NC_020992	TACT	2	8	29071	29078	25 %	50 %	0 %	25 %	478692458
74	NC_020992	CTGC	2	8	29584	29591	0 %	25 %	25 %	50 %	478692458
75	NC_020992	ATTA	2	8	29720	29727	50 %	50 %	0 %	0 %	478692458
76	NC_020992	TCCA	2	8	29793	29800	25 %	25 %	0 %	50 %	478692458
77	NC_020992	TTTA	2	8	29936	29943	25 %	75 %	0 %	0 %	478692458
78	NC_020992	ATCA	2	8	30094	30101	50 %	25 %	0 %	25 %	478692459
79	NC_020992	CTTT	2	8	30339	30346	0 %	75 %	0 %	25 %	478692459
80	NC_020992	ATTT	2	8	30446	30453	25 %	75 %	0 %	0 %	478692459
81	NC_020992	ATTT	2	8	30479	30486	25 %	75 %	0 %	0 %	478692460
82	NC_020992	TTAA	2	8	31032	31039	50 %	50 %	0 %	0 %	478692461
83	NC_020992	AAAT	2	8	31462	31469	75 %	25 %	0 %	0 %	478692461
84	NC_020992	ATTA	2	8	31803	31810	50 %	50 %	0 %	0 %	478692462
85	NC_020992	CTTT	2	8	31983	31990	0 %	75 %	0 %	25 %	478692462
86	NC_020992	CATA	2	8	33376	33383	50 %	25 %	0 %	25 %	478692462
87	NC_020992	TAAT	2	8	33893	33900	50 %	50 %	0 %	0 %	478692463
88	NC_020992	CTAT	2	8	34780	34787	25 %	50 %	0 %	25 %	478692465
89	NC_020992	ATTT	2	8	35290	35297	25 %	75 %	0 %	0 %	478692465
90	NC_020992	TAGC	2	8	35397	35404	25 %	25 %	25 %	25 %	478692465
91	NC_020992	TCAT	2	8	35516	35523	25 %	50 %	0 %	25 %	478692465
92	NC_020992	ATTA	2	8	35814	35821	50 %	50 %	0 %	0 %	478692466
93	NC_020992	ATAG	2	8	35908	35915	50 %	25 %	25 %	0 %	478692466
94	NC_020992	ATCT	2	8	36110	36117	25 %	50 %	0 %	25 %	478692466
95	NC_020992	TACT	2	8	36275	36282	25 %	50 %	0 %	25 %	478692466
96	NC_020992	CTAT	2	8	36640	36647	25 %	50 %	0 %	25 %	478692466
97	NC_020992	ATTC	2	8	37058	37065	25 %	50 %	0 %	25 %	478692466
98	NC_020992	CTTT	2	8	37265	37272	0 %	75 %	0 %	25 %	478692467
99	NC_020992	CTTT	2	8	37423	37430	0 %	75 %	0 %	25 %	478692467
100	NC_020992	TAAA	2	8	39542	39549	75 %	25 %	0 %	0 %	478692469
101	NC_020992	TGCT	2	8	41083	41090	0 %	50 %	25 %	25 %	478692470
102	NC_020992	TACC	2	8	42809	42816	25 %	25 %	0 %	50 %	478692471
103	NC_020992	CCCA	2	8	43047	43054	25 %	0 %	0 %	75 %	478692471
104	NC_020992	ATGC	2	8	43225	43232	25 %	25 %	25 %	25 %	478692472
105	NC_020992	AACA	2	8	43238	43245	75 %	0 %	0 %	25 %	478692472
106	NC_020992	TGTT	2	8	44134	44141	0 %	75 %	25 %	0 %	478692473
107	NC_020992	TAAA	2	8	44556	44563	75 %	25 %	0 %	0 %	478692473
108	NC_020992	TAAT	2	8	44571	44578	50 %	50 %	0 %	0 %	478692473
109	NC_020992	AAAT	2	8	44873	44880	75 %	25 %	0 %	0 %	478692474
110	NC_020992	TATC	2	8	45010	45017	25 %	50 %	0 %	25 %	478692474
111	NC_020992	CAAT	2	8	45179	45186	50 %	25 %	0 %	25 %	478692474
112	NC_020992	TTTC	2	8	45822	45829	0 %	75 %	0 %	25 %	478692475
113	NC_020992	ATAA	2	8	45982	45989	75 %	25 %	0 %	0 %	478692475
114	NC_020992	TCAA	2	8	46172	46179	50 %	25 %	0 %	25 %	478692475
115	NC_020992	TAAA	2	8	46483	46490	75 %	25 %	0 %	0 %	478692475
116	NC_020992	ATCA	2	8	46861	46868	50 %	25 %	0 %	25 %	478692475
117	NC_020992	AAGA	2	8	47616	47623	75 %	0 %	25 %	0 %	478692476
118	NC_020992	ACTT	2	8	47999	48006	25 %	50 %	0 %	25 %	478692476
119	NC_020992	TTAA	2	8	49242	49249	50 %	50 %	0 %	0 %	478692479
120	NC_020992	CAAT	2	8	50326	50333	50 %	25 %	0 %	25 %	478692480
121	NC_020992	TTGA	2	8	51126	51133	25 %	50 %	25 %	0 %	478692480
122	NC_020992	CTTG	2	8	51281	51288	0 %	50 %	25 %	25 %	478692481
123	NC_020992	ATTA	2	8	51998	52005	50 %	50 %	0 %	0 %	478692481
124	NC_020992	CTTC	2	8	52804	52811	0 %	50 %	0 %	50 %	478692482
125	NC_020992	TTCA	2	8	52890	52897	25 %	50 %	0 %	25 %	478692482
126	NC_020992	GCTT	2	8	52903	52910	0 %	50 %	25 %	25 %	478692482
127	NC_020992	TATC	2	8	53216	53223	25 %	50 %	0 %	25 %	478692482
128	NC_020992	ATTT	2	8	53921	53928	25 %	75 %	0 %	0 %	478692482
129	NC_020992	ATTC	2	8	53987	53994	25 %	50 %	0 %	25 %	478692482
130	NC_020992	CATT	2	8	54050	54057	25 %	50 %	0 %	25 %	478692482
131	NC_020992	TTTG	2	8	54111	54118	0 %	75 %	25 %	0 %	478692482
132	NC_020992	TAAA	2	8	54390	54397	75 %	25 %	0 %	0 %	478692482
133	NC_020992	AACG	2	8	54880	54887	50 %	0 %	25 %	25 %	478692482
134	NC_020992	AAAT	2	8	54911	54918	75 %	25 %	0 %	0 %	478692482
135	NC_020992	ATTA	2	8	55146	55153	50 %	50 %	0 %	0 %	478692482
136	NC_020992	AATA	2	8	55192	55199	75 %	25 %	0 %	0 %	478692482
137	NC_020992	AAGT	2	8	55673	55680	50 %	25 %	25 %	0 %	478692482
138	NC_020992	TCCT	2	8	56367	56374	0 %	50 %	0 %	50 %	478692483
139	NC_020992	ATTT	2	8	56408	56415	25 %	75 %	0 %	0 %	478692483
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