MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 4269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020992	AAC	2	6	46	51	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020992	ATA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020992	ATT	2	6	3677	3682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020992	TAG	2	6	5006	5011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020992	TAT	2	6	5104	5109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020992	ATA	2	6	5880	5885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020992	AGA	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020992	TAT	2	6	5999	6004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020992	TAA	2	6	6749	6754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020992	TCA	2	6	9184	9189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020992	ATT	2	6	11048	11053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020992	TTA	2	6	12462	12467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020992	ACT	2	6	14205	14210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020992	TTA	2	6	14239	14244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020992	TAA	2	6	14265	14270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020992	ATT	2	6	14314	14319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020992	ACT	2	6	14381	14386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020992	ATT	2	6	14569	14574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020992	TAT	2	6	14604	14609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020992	ATT	2	6	14715	14720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020992	GTA	2	6	14828	14833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020992	ATT	2	6	14873	14878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020992	TTC	2	6	14964	14969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020992	ACA	2	6	19232	19237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020992	ACA	2	6	19251	19256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020992	TAA	2	6	23453	23458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020992	ATT	2	6	23613	23618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020992	TAA	2	6	23684	23689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020992	GTT	2	6	23759	23764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020992	TAA	2	6	23864	23869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020992	ATT	3	9	23899	23907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020992	AAT	2	6	23949	23954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020992	AAT	2	6	23971	23976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020992	AAG	2	6	24035	24040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020992	TAA	2	6	24113	24118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020992	ACT	2	6	24152	24157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020992	CAA	2	6	24159	24164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020992	ATT	2	6	24169	24174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020992	TAC	2	6	24692	24697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020992	AAT	2	6	24723	24728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020992	ATT	2	6	24774	24779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020992	CTT	2	6	25333	25338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020992	TAA	2	6	26594	26599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020992	AAG	2	6	26628	26633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020992	TTA	2	6	26682	26687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020992	AAT	2	6	27543	27548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020992	TAA	3	9	27721	27729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020992	TAT	2	6	27750	27755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020992	TCT	2	6	27830	27835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020992	ATT	2	6	31003	31008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020992	ATT	2	6	31691	31696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020992	GCA	2	6	31730	31735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020992	TTG	2	6	31761	31766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020992	AAT	2	6	31789	31794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020992	ATT	2	6	33656	33661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020992	AAT	2	6	33678	33683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020992	CTG	2	6	33713	33718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020992	ATT	2	6	34151	34156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020992	TTA	2	6	34161	34166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020992	ATA	2	6	34660	34665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020992	ATT	2	6	34728	34733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020992	ATG	2	6	34768	34773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020992	GAC	2	6	37184	37189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020992	TTA	2	6	38071	38076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020992	AAG	2	6	38107	38112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020992	ATG	2	6	38162	38167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020992	GTA	2	6	38176	38181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020992	ATT	2	6	39251	39256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020992	GAA	2	6	41497	41502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020992	TAC	2	6	41548	41553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020992	AGA	2	6	41589	41594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020992	AAG	2	6	41673	41678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020992	TAG	2	6	41688	41693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020992	GAA	2	6	41770	41775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020992	ATT	2	6	41876	41881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020992	TAT	2	6	41926	41931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020992	TCT	2	6	42215	42220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020992	TTA	2	6	42312	42317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020992	ATT	2	6	42347	42352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020992	TTA	2	6	42366	42371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020992	AGT	2	6	42443	42448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020992	TCT	2	6	42489	42494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020992	ATT	2	6	42597	42602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020992	TTG	2	6	42605	42610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020992	ATT	2	6	45541	45546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020992	TAT	2	6	45547	45552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020992	AAT	2	6	45597	45602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020992	TAA	2	6	46992	46997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020992	TAT	2	6	48104	48109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020992	TTA	3	9	48383	48391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020992	AGA	2	6	48392	48397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020992	ATC	2	6	48452	48457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020992	TAA	2	6	48536	48541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020992	TAG	2	6	49743	49748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020992	ATT	2	6	49783	49788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020992	AGC	3	9	49823	49831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020992	AAC	2	6	49909	49914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020992	GTC	2	6	50040	50045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020992	ATA	2	6	52357	52362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020992	TAA	2	6	52402	52407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020992	GTA	2	6	52422	52427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020992	ATC	2	6	52451	52456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020992	TAA	2	6	52472	52477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020992	AGA	2	6	52498	52503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020992	CTT	2	6	52581	52586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020992	TAT	2	6	52612	52617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020992	TTA	2	6	52648	52653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020992	AGA	2	6	52693	52698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020992	GAA	2	6	59075	59080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020992	ATT	2	6	59123	59128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020992	ATG	2	6	59161	59166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020992	TAA	2	6	64090	64095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020992	AGA	2	6	67538	67543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020992	CTA	2	6	67569	67574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020992	ATA	2	6	67587	67592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020992	TTA	2	6	70107	70112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020992	TCC	2	6	70113	70118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020992	TTA	2	6	70169	70174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020992	ATT	2	6	70590	70595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020992	TTA	2	6	70641	70646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020992	TAA	2	6	70663	70668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020992	ATA	2	6	70740	70745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020992	AAT	2	6	70763	70768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020992	CAT	2	6	70824	70829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020992	TAA	2	6	70884	70889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020992	ATT	2	6	70894	70899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020992	TAG	2	6	70909	70914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020992	ACT	2	6	71056	71061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020992	TAT	2	6	71957	71962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020992	ACT	2	6	71987	71992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020992	TAT	2	6	72123	72128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020992	TAG	2	6	72137	72142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020992	ACT	2	6	72153	72158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020992	TAA	2	6	72807	72812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020992	ATA	2	6	72917	72922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020992	CTA	2	6	72923	72928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020992	TTA	2	6	72984	72989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020992	AAT	2	6	73025	73030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020992	ATC	2	6	73078	73083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_020992	ATC	2	6	73168	73173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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414	NC_020992	ATA	2	6	151444	151449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_020992	ATT	2	6	151547	151552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_020992	ATT	2	6	152430	152435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_020992	ATT	2	6	154162	154167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_020992	ATT	2	6	154799	154804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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