MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 13894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020992	AGA	2	6	127	132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692435
2	NC_020992	TAT	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692435
3	NC_020992	AAG	2	6	378	383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692435
4	NC_020992	GTT	2	6	407	412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478692435
5	NC_020992	AAT	2	6	414	419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692435
6	NC_020992	AGC	2	6	588	593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692436
7	NC_020992	GGC	2	6	760	765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478692436
8	NC_020992	GTT	2	6	824	829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478692436
9	NC_020992	ATG	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692436
10	NC_020992	ATA	2	6	866	871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692436
11	NC_020992	GGT	2	6	898	903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692436
12	NC_020992	GCA	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692436
13	NC_020992	GCT	2	6	937	942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692436
14	NC_020992	TGG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692436
15	NC_020992	AGT	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692436
16	NC_020992	ATG	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692436
17	NC_020992	GGT	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692436
18	NC_020992	ATT	2	6	1246	1251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692436
19	NC_020992	TAG	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692436
20	NC_020992	TTA	2	6	1359	1364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692436
21	NC_020992	GCT	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692436
22	NC_020992	TGA	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692436
23	NC_020992	GAA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692436
24	NC_020992	TAT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692436
25	NC_020992	ATC	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692436
26	NC_020992	TAT	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692436
27	NC_020992	TAA	2	6	1605	1610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692436
28	NC_020992	TTA	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692436
29	NC_020992	GCA	2	6	1657	1662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692436
30	NC_020992	TAT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692436
31	NC_020992	ATT	2	6	1804	1809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692436
32	NC_020992	CAG	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692436
33	NC_020992	TAA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692436
34	NC_020992	GCA	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692437
35	NC_020992	GCA	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692437
36	NC_020992	ATT	2	6	2332	2337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692437
37	NC_020992	GAA	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692437
38	NC_020992	CAT	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692437
39	NC_020992	AAT	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692437
40	NC_020992	AGA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692437
41	NC_020992	TTA	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692437
42	NC_020992	TTA	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692437
43	NC_020992	TGA	2	6	2942	2947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692437
44	NC_020992	TAA	2	6	2950	2955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692437
45	NC_020992	ATG	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692437
46	NC_020992	AAT	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692437
47	NC_020992	AGC	2	6	3086	3091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692437
48	NC_020992	TAA	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692437
49	NC_020992	TAG	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692437
50	NC_020992	ATA	2	6	3337	3342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692437
51	NC_020992	ATT	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692437
52	NC_020992	CAA	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692437
53	NC_020992	CTG	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692438
54	NC_020992	TCC	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478692438
55	NC_020992	TTA	2	6	3873	3878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692438
56	NC_020992	GCA	2	6	3908	3913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692438
57	NC_020992	GCA	2	6	3944	3949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692438
58	NC_020992	ATA	2	6	4019	4024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692438
59	NC_020992	ATA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692438
60	NC_020992	TAG	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692438
61	NC_020992	GAA	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692438
62	NC_020992	TAT	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692438
63	NC_020992	AGA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692438
64	NC_020992	TAA	2	6	4378	4383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692438
65	NC_020992	TAT	2	6	4461	4466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692439
66	NC_020992	AAC	2	6	4480	4485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692439
67	NC_020992	ATT	2	6	4545	4550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692439
68	NC_020992	GTA	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692439
69	NC_020992	TAA	2	6	4668	4673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692439
70	NC_020992	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692439
71	NC_020992	TAA	2	6	4721	4726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692439
72	NC_020992	ATG	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692439
73	NC_020992	TAA	2	6	4752	4757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692439
74	NC_020992	CTT	2	6	4763	4768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692439
75	NC_020992	TAA	2	6	4805	4810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692439
76	NC_020992	AAT	2	6	4825	4830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692439
77	NC_020992	TAT	2	6	4841	4846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692439
78	NC_020992	CTT	2	6	4870	4875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692439
79	NC_020992	ATA	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692440
80	NC_020992	TAA	2	6	5229	5234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692440
81	NC_020992	TCA	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692440
82	NC_020992	ATA	2	6	5333	5338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692440
83	NC_020992	ACA	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692440
84	NC_020992	AGC	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692440
85	NC_020992	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692440
86	NC_020992	ATG	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692440
87	NC_020992	CAT	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692440
88	NC_020992	TAA	2	6	5529	5534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692440
89	NC_020992	CAA	2	6	5573	5578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692440
90	NC_020992	ATA	2	6	5618	5623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692440
91	NC_020992	TTC	2	6	5652	5657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692440
92	NC_020992	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692440
93	NC_020992	ATG	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692440
94	NC_020992	ACT	2	6	6056	6061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692441
95	NC_020992	TGA	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692441
96	NC_020992	AAG	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692441
97	NC_020992	TTA	2	6	6140	6145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692441
98	NC_020992	AGC	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692441
99	NC_020992	TAT	2	6	6220	6225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692441
100	NC_020992	ATT	2	6	6301	6306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692441
101	NC_020992	TTA	2	6	6492	6497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692441
102	NC_020992	TAG	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692441
103	NC_020992	GCA	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692441
104	NC_020992	AGA	2	6	6731	6736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692441
105	NC_020992	ATT	2	6	6874	6879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692442
106	NC_020992	ACA	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692442
107	NC_020992	AGC	2	6	6922	6927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692442
108	NC_020992	CAA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692442
109	NC_020992	TAC	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692442
110	NC_020992	GCT	2	6	7037	7042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692442
111	NC_020992	ACA	2	6	7070	7075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692442
112	NC_020992	ATA	2	6	7076	7081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692442
113	NC_020992	AAT	2	6	7123	7128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692442
114	NC_020992	GAA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692442
115	NC_020992	ATA	2	6	7232	7237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692442
116	NC_020992	CAA	2	6	7295	7300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692442
117	NC_020992	GAG	2	6	7310	7315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478692442
118	NC_020992	CAG	2	6	7329	7334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692442
119	NC_020992	TGC	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692442
120	NC_020992	TTA	2	6	7511	7516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692442
121	NC_020992	AAG	2	6	7533	7538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692442
122	NC_020992	AAC	2	6	7557	7562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692442
123	NC_020992	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692442
124	NC_020992	TGA	2	6	7996	8001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692442
125	NC_020992	TGA	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692442
126	NC_020992	ATT	2	6	8105	8110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692442
127	NC_020992	AAG	2	6	8118	8123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692442
128	NC_020992	TGG	2	6	8182	8187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692442
129	NC_020992	ACT	2	6	8227	8232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692442
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131	NC_020992	CAG	2	6	8469	8474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692442
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256	NC_020992	TCA	2	6	17022	17027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692450
257	NC_020992	ACT	2	6	17069	17074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692450
258	NC_020992	TTA	2	6	17075	17080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692450
259	NC_020992	TTG	2	6	17116	17121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478692450
260	NC_020992	ATC	2	6	17188	17193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692450
261	NC_020992	TAA	2	6	17340	17345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692450
262	NC_020992	TAA	2	6	17374	17379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692450
263	NC_020992	GTA	2	6	17405	17410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692450
264	NC_020992	TAT	2	6	17493	17498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692450
265	NC_020992	CAT	2	6	17533	17538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692450
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281	NC_020992	ATT	2	6	18280	18285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692450
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383	NC_020992	CTT	2	6	26316	26321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692455
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