MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 plasmid pSotonIa3

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020989	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478475665
2	NC_020989	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478475666
3	NC_020989	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478475666
4	NC_020989	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478475666
5	NC_020989	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478475666
6	NC_020989	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478475667
7	NC_020989	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478475667
8	NC_020989	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478475667
9	NC_020989	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478475668
10	NC_020989	ACTG	2	8	3758	3765	25 %	25 %	25 %	25 %	478475668
11	NC_020989	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478475668
12	NC_020989	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478475668
13	NC_020989	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478475669
14	NC_020989	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478475671
15	NC_020989	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478475671
16	NC_020989	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478475671
17	NC_020989	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478475672
18	NC_020989	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478475672
19	NC_020989	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478475672
20	NC_020989	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478475672
21	NC_020989	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478475672

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.