MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 plasmid pSotonF3

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020988	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478474761
2	NC_020988	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478474762
3	NC_020988	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478474762
4	NC_020988	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478474762
5	NC_020988	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478474762
6	NC_020988	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478474763
7	NC_020988	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478474763
8	NC_020988	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478474763
9	NC_020988	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478474764
10	NC_020988	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478474764
11	NC_020988	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478474764
12	NC_020988	ATTA	2	8	4620	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	478474764
13	NC_020988	ATTT	2	8	4654	4661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020988	CAAA	2	8	5470	5477	75 %	0 %	0 %	25 %	478474765
15	NC_020988	ATCA	2	8	6102	6109	50 %	25 %	0 %	25 %	478474767
16	NC_020988	AATT	2	8	6317	6324	50 %	50 %	0 %	0 %	478474767
17	NC_020988	TCGG	2	8	6388	6395	0 %	25 %	50 %	25 %	478474767
18	NC_020988	AGTT	2	8	7018	7025	25 %	50 %	25 %	0 %	478474768
19	NC_020988	CCAA	2	8	7087	7094	50 %	0 %	0 %	50 %	478474768
20	NC_020988	CTTC	2	8	7242	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	478474768
21	NC_020988	GATA	2	8	7277	7284	50 %	25 %	25 %	0 %	478474768

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.