MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 plasmid pSotonE4

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020987	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478473859
2	NC_020987	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478473860
3	NC_020987	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478473860
4	NC_020987	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478473860
5	NC_020987	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478473860
6	NC_020987	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478473861
7	NC_020987	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478473861
8	NC_020987	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478473861
9	NC_020987	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478473862
10	NC_020987	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478473862
11	NC_020987	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478473862
12	NC_020987	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478473862
13	NC_020987	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478473863
14	NC_020987	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478473865
15	NC_020987	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478473865
16	NC_020987	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478473865
17	NC_020987	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478473866
18	NC_020987	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478473866
19	NC_020987	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478473866
20	NC_020987	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478473866

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.