MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 plasmid pSotonD1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020986	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478472956
2	NC_020986	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478472957
3	NC_020986	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478472957
4	NC_020986	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478472957
5	NC_020986	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478472957
6	NC_020986	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478472958
7	NC_020986	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478472958
8	NC_020986	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478472958
9	NC_020986	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478472959
10	NC_020986	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478472959
11	NC_020986	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478472959
12	NC_020986	ATTA	2	8	4620	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	478472959
13	NC_020986	CAAA	2	8	5470	5477	75 %	0 %	0 %	25 %	478472960
14	NC_020986	ATCA	2	8	6102	6109	50 %	25 %	0 %	25 %	478472962
15	NC_020986	AATT	2	8	6317	6324	50 %	50 %	0 %	0 %	478472962
16	NC_020986	TCGG	2	8	6388	6395	0 %	25 %	50 %	25 %	478472962
17	NC_020986	AGTT	2	8	7018	7025	25 %	50 %	25 %	0 %	478472963
18	NC_020986	CCAA	2	8	7087	7094	50 %	0 %	0 %	50 %	478472963
19	NC_020986	CTTC	2	8	7242	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	478472963
20	NC_020986	GATA	2	8	7277	7284	50 %	25 %	25 %	0 %	478472963

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.