MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 plasmid pSotonD1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020986	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	478472956
2	NC_020986	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	478472956
3	NC_020986	T	8	8	580	587	0 %	100 %	0 %	0 %	478472956
4	NC_020986	T	6	6	693	698	0 %	100 %	0 %	0 %	478472956
5	NC_020986	A	7	7	726	732	100 %	0 %	0 %	0 %	478472956
6	NC_020986	T	8	8	1612	1619	0 %	100 %	0 %	0 %	478472957
7	NC_020986	A	6	6	1688	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	478472957
8	NC_020986	T	6	6	1838	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	478472957
9	NC_020986	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	478472957
10	NC_020986	A	8	8	2772	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	478472958
11	NC_020986	A	6	6	3565	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	478472958
12	NC_020986	A	7	7	4434	4440	100 %	0 %	0 %	0 %	478472959
13	NC_020986	A	6	6	4539	4544	100 %	0 %	0 %	0 %	478472959
14	NC_020986	T	6	6	5451	5456	0 %	100 %	0 %	0 %	478472960
15	NC_020986	A	6	6	5608	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	478472961
16	NC_020986	A	6	6	5802	5807	100 %	0 %	0 %	0 %	478472961
17	NC_020986	T	6	6	5903	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	478472962
18	NC_020986	A	6	6	5983	5988	100 %	0 %	0 %	0 %	478472962
19	NC_020986	A	7	7	6120	6126	100 %	0 %	0 %	0 %	478472962
20	NC_020986	T	6	6	6506	6511	0 %	100 %	0 %	0 %	478472962
21	NC_020986	A	7	7	6692	6698	100 %	0 %	0 %	0 %	478472963
22	NC_020986	T	6	6	6711	6716	0 %	100 %	0 %	0 %	478472963
23	NC_020986	A	8	8	6717	6724	100 %	0 %	0 %	0 %	478472963
24	NC_020986	A	6	6	6946	6951	100 %	0 %	0 %	0 %	478472963

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.