MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST plasmid pL2bLST

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020985	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478472052
2	NC_020985	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478472053
3	NC_020985	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478472053
4	NC_020985	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478472053
5	NC_020985	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478472053
6	NC_020985	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478472054
7	NC_020985	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478472054
8	NC_020985	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478472054
9	NC_020985	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478472055
10	NC_020985	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478472055
11	NC_020985	TTGG	2	8	4483	4490	0 %	50 %	50 %	0 %	478472055
12	NC_020985	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478472055
13	NC_020985	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478472055
14	NC_020985	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478472056
15	NC_020985	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478472058
16	NC_020985	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478472058
17	NC_020985	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478472058
18	NC_020985	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478472059
19	NC_020985	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478472059
20	NC_020985	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478472059
21	NC_020985	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478472059
22	NC_020985	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478472059

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.