MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/795 plasmid pL2b795

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020983	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478469361
2	NC_020983	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478469362
3	NC_020983	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478469362
4	NC_020983	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478469362
5	NC_020983	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478469362
6	NC_020983	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478469363
7	NC_020983	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478469363
8	NC_020983	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478469363
9	NC_020983	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478469364
10	NC_020983	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478469364
11	NC_020983	TTGG	2	8	4483	4490	0 %	50 %	50 %	0 %	478469364
12	NC_020983	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478469364
13	NC_020983	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478469364
14	NC_020983	ATTT	2	8	4663	4670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020983	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478469365
16	NC_020983	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478469367
17	NC_020983	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478469367
18	NC_020983	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478469367
19	NC_020983	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478469368
20	NC_020983	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478469368
21	NC_020983	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478469368
22	NC_020983	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478469368
23	NC_020983	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478469368

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.