MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams4 plasmid pAms4

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020981	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478468452
2	NC_020981	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478468453
3	NC_020981	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478468453
4	NC_020981	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478468453
5	NC_020981	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478468453
6	NC_020981	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478468454
7	NC_020981	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478468454
8	NC_020981	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478468454
9	NC_020981	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478468455
10	NC_020981	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478468455
11	NC_020981	TTGG	2	8	4483	4490	0 %	50 %	50 %	0 %	478468455
12	NC_020981	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478468455
13	NC_020981	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478468455
14	NC_020981	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478468456
15	NC_020981	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478468458
16	NC_020981	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478468458
17	NC_020981	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478468458
18	NC_020981	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478468459
19	NC_020981	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478468459
20	NC_020981	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478468459
21	NC_020981	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478468459
22	NC_020981	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478468459

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.