MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 plasmid pAms1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020980	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478467552
2	NC_020980	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478467553
3	NC_020980	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478467553
4	NC_020980	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478467553
5	NC_020980	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478467553
6	NC_020980	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478467554
7	NC_020980	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478467554
8	NC_020980	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478467554
9	NC_020980	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478467555
10	NC_020980	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478467555
11	NC_020980	TTGG	2	8	4483	4490	0 %	50 %	50 %	0 %	478467555
12	NC_020980	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478467555
13	NC_020980	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478467555
14	NC_020980	ATTT	2	8	4663	4670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020980	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478467556
16	NC_020980	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478467558
17	NC_020980	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478467558
18	NC_020980	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478467558
19	NC_020980	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478467559
20	NC_020980	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478467559
21	NC_020980	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478467559
22	NC_020980	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478467559
23	NC_020980	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478467559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.