MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 plasmid pAms1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020980	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	478467552
2	NC_020980	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	478467552
3	NC_020980	T	8	8	580	587	0 %	100 %	0 %	0 %	478467552
4	NC_020980	T	6	6	693	698	0 %	100 %	0 %	0 %	478467552
5	NC_020980	A	7	7	726	732	100 %	0 %	0 %	0 %	478467552
6	NC_020980	A	6	6	1117	1122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020980	T	8	8	1612	1619	0 %	100 %	0 %	0 %	478467553
8	NC_020980	A	6	6	1688	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	478467553
9	NC_020980	T	6	6	1838	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	478467553
10	NC_020980	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	478467553
11	NC_020980	T	7	7	2209	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020980	A	8	8	2772	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	478467554
13	NC_020980	A	6	6	3565	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	478467554
14	NC_020980	A	7	7	4434	4440	100 %	0 %	0 %	0 %	478467555
15	NC_020980	A	6	6	4539	4544	100 %	0 %	0 %	0 %	478467555
16	NC_020980	A	6	6	4683	4688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020980	T	6	6	5460	5465	0 %	100 %	0 %	0 %	478467556
18	NC_020980	A	6	6	5536	5541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020980	A	6	6	5617	5622	100 %	0 %	0 %	0 %	478467557
20	NC_020980	A	6	6	5811	5816	100 %	0 %	0 %	0 %	478467557
21	NC_020980	T	6	6	5912	5917	0 %	100 %	0 %	0 %	478467558
22	NC_020980	A	6	6	5992	5997	100 %	0 %	0 %	0 %	478467558
23	NC_020980	A	7	7	6129	6135	100 %	0 %	0 %	0 %	478467558
24	NC_020980	T	6	6	6515	6520	0 %	100 %	0 %	0 %	478467558
25	NC_020980	A	7	7	6701	6707	100 %	0 %	0 %	0 %	478467559
26	NC_020980	T	6	6	6720	6725	0 %	100 %	0 %	0 %	478467559
27	NC_020980	A	8	8	6726	6733	100 %	0 %	0 %	0 %	478467559
28	NC_020980	A	6	6	6955	6960	100 %	0 %	0 %	0 %	478467559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.