MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 plasmid pA7249

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020979	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478465753
2	NC_020979	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478465754
3	NC_020979	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478465754
4	NC_020979	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478465754
5	NC_020979	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478465754
6	NC_020979	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478465755
7	NC_020979	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478465755
8	NC_020979	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478465755
9	NC_020979	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478465756
10	NC_020979	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478465756
11	NC_020979	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478465756
12	NC_020979	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478465756
13	NC_020979	ATTT	2	8	4663	4670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020979	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478465757
15	NC_020979	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478465759
16	NC_020979	TTGT	2	8	6332	6339	0 %	75 %	25 %	0 %	478465759
17	NC_020979	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478465759
18	NC_020979	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478465760
19	NC_020979	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478465760
20	NC_020979	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478465760
21	NC_020979	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478465760
22	NC_020979	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478465760
23	NC_020979	TTTA	2	8	7472	7479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.