MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams4 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020978	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478467564
2	NC_020978	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478467565
3	NC_020978	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478467565
4	NC_020978	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478467565
5	NC_020978	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478467565
6	NC_020978	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478467566
7	NC_020978	TGGTA	2	10	8289	8298	20 %	40 %	40 %	0 %	478467568
8	NC_020978	CGAAA	2	10	9697	9706	60 %	0 %	20 %	20 %	478467569
9	NC_020978	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478467570
10	NC_020978	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478467571
11	NC_020978	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478467571
12	NC_020978	AAGAA	2	10	12404	12413	80 %	0 %	20 %	0 %	478467572
13	NC_020978	AAAGA	2	10	13802	13811	80 %	0 %	20 %	0 %	478467573
14	NC_020978	GATTT	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	478467575
15	NC_020978	CGTTC	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	478467576
16	NC_020978	GCTTC	2	10	17133	17142	0 %	40 %	20 %	40 %	478467576
17	NC_020978	GAAGG	2	10	17504	17513	40 %	0 %	60 %	0 %	478467576
18	NC_020978	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478467579
19	NC_020978	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478467580
20	NC_020978	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478467580
21	NC_020978	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478467580
22	NC_020978	AGAGG	2	10	26132	26141	40 %	0 %	60 %	0 %	478467581
23	NC_020978	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478467582
24	NC_020978	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478467582
25	NC_020978	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478467584
26	NC_020978	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478467584
27	NC_020978	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478467585
28	NC_020978	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478467586
29	NC_020978	GAGCT	2	10	32059	32068	20 %	20 %	40 %	20 %	478467587
30	NC_020978	CTATT	2	10	36733	36742	20 %	60 %	0 %	20 %	478467593
31	NC_020978	TCCTA	2	10	36780	36789	20 %	40 %	0 %	40 %	478467593
32	NC_020978	ACGAT	2	10	38695	38704	40 %	20 %	20 %	20 %	478467594
33	NC_020978	AATTT	2	10	39586	39595	40 %	60 %	0 %	0 %	478467595
34	NC_020978	AGCAA	2	10	42710	42719	60 %	0 %	20 %	20 %	478467597
35	NC_020978	CGATG	2	10	42767	42776	20 %	20 %	40 %	20 %	478467597
36	NC_020978	TTTAT	2	10	44770	44779	20 %	80 %	0 %	0 %	478467600
37	NC_020978	CTTTC	2	10	46866	46875	0 %	60 %	0 %	40 %	478467602
38	NC_020978	AGTTT	2	10	47405	47414	20 %	60 %	20 %	0 %	478467602
39	NC_020978	CTTTT	2	10	50570	50579	0 %	80 %	0 %	20 %	478467605
40	NC_020978	CCGTA	2	10	54404	54413	20 %	20 %	20 %	40 %	478467608
41	NC_020978	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478467609
42	NC_020978	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478467610
43	NC_020978	GAGCA	2	10	60379	60388	40 %	0 %	40 %	20 %	478467612
44	NC_020978	TGTGA	2	10	62828	62837	20 %	40 %	40 %	0 %	478467614
45	NC_020978	AGTGA	2	10	64349	64358	40 %	20 %	40 %	0 %	478467615
46	NC_020978	CCTTC	2	10	64623	64632	0 %	40 %	0 %	60 %	478467615
47	NC_020978	AGGAG	2	10	66851	66860	40 %	0 %	60 %	0 %	478467617
48	NC_020978	GTTAA	2	10	66981	66990	40 %	40 %	20 %	0 %	478467617
49	NC_020978	CAAGC	2	10	69347	69356	40 %	0 %	20 %	40 %	478467619
50	NC_020978	GGAGC	2	10	70217	70226	20 %	0 %	60 %	20 %	478467620
51	NC_020978	GCGAT	2	10	70407	70416	20 %	20 %	40 %	20 %	478467620
52	NC_020978	CTCTT	2	10	70761	70770	0 %	60 %	0 %	40 %	478467620
53	NC_020978	AGGGG	2	10	71407	71416	20 %	0 %	80 %	0 %	478467620
54	NC_020978	AAGAA	2	10	71449	71458	80 %	0 %	20 %	0 %	478467620
55	NC_020978	ATTGG	2	10	72739	72748	20 %	40 %	40 %	0 %	478467622
56	NC_020978	GAAAA	2	10	73811	73820	80 %	0 %	20 %	0 %	478467622
57	NC_020978	TGGGA	2	10	74228	74237	20 %	20 %	60 %	0 %	478467623
58	NC_020978	TATTT	2	10	76755	76764	20 %	80 %	0 %	0 %	478467624
59	NC_020978	TGTCT	2	10	80550	80559	0 %	60 %	20 %	20 %	478467627
60	NC_020978	TTACT	2	10	81057	81066	20 %	60 %	0 %	20 %	478467627
61	NC_020978	AGAAA	2	10	82447	82456	80 %	0 %	20 %	0 %	478467629
62	NC_020978	GGAAG	2	10	82960	82969	40 %	0 %	60 %	0 %	478467629
63	NC_020978	AGCGA	2	10	85426	85435	40 %	0 %	40 %	20 %	478467631
64	NC_020978	GATCC	2	10	86511	86520	20 %	20 %	20 %	40 %	478467632
65	NC_020978	AGAGC	2	10	87846	87855	40 %	0 %	40 %	20 %	478467633
66	NC_020978	TTTTC	2	10	91578	91587	0 %	80 %	0 %	20 %	478467636
67	NC_020978	GGATG	2	10	91838	91847	20 %	20 %	60 %	0 %	478467637
68	NC_020978	CAACA	2	10	93377	93386	60 %	0 %	0 %	40 %	478467638
69	NC_020978	ACAGC	2	10	94422	94431	40 %	0 %	20 %	40 %	478467639
70	NC_020978	GGAAC	2	10	95134	95143	40 %	0 %	40 %	20 %	478467640
71	NC_020978	GGATT	2	10	96034	96043	20 %	40 %	40 %	0 %	478467640
72	NC_020978	CAATC	2	10	97136	97145	40 %	20 %	0 %	40 %	478467642
73	NC_020978	TTTGC	2	10	97270	97279	0 %	60 %	20 %	20 %	478467642
74	NC_020978	ATTCA	2	10	97534	97543	40 %	40 %	0 %	20 %	478467642
75	NC_020978	GATCC	2	10	97793	97802	20 %	20 %	20 %	40 %	478467642
76	NC_020978	GTTTT	2	10	98214	98223	0 %	80 %	20 %	0 %	478467642
77	NC_020978	AAGCT	2	10	99419	99428	40 %	20 %	20 %	20 %	478467643
78	NC_020978	AGGGG	2	10	99778	99787	20 %	0 %	80 %	0 %	478467643
79	NC_020978	ATAGC	2	10	100471	100480	40 %	20 %	20 %	20 %	478467644
80	NC_020978	TTCCC	2	10	101075	101084	0 %	40 %	0 %	60 %	478467645
81	NC_020978	AGCGA	2	10	103399	103408	40 %	0 %	40 %	20 %	478467647
82	NC_020978	TTTCT	2	10	103757	103766	0 %	80 %	0 %	20 %	478467647
83	NC_020978	CTTCT	2	10	103811	103820	0 %	60 %	0 %	40 %	478467647
84	NC_020978	ATCAT	2	10	104963	104972	40 %	40 %	0 %	20 %	478467648
85	NC_020978	GGCAT	2	10	105671	105680	20 %	20 %	40 %	20 %	478467648
86	NC_020978	AAAGC	2	10	109397	109406	60 %	0 %	20 %	20 %	478467651
87	NC_020978	GCATT	2	10	110557	110566	20 %	40 %	20 %	20 %	478467653
88	NC_020978	TGTTT	2	10	115246	115255	0 %	80 %	20 %	0 %	478467656
89	NC_020978	CATGT	2	10	115624	115633	20 %	40 %	20 %	20 %	478467656
90	NC_020978	TATCG	2	10	116328	116337	20 %	40 %	20 %	20 %	478467656
91	NC_020978	TTTCT	2	10	116844	116853	0 %	80 %	0 %	20 %	478467657
92	NC_020978	GGAGA	2	10	117040	117049	40 %	0 %	60 %	0 %	478467657
93	NC_020978	AAAGA	2	10	119091	119100	80 %	0 %	20 %	0 %	478467660
94	NC_020978	CCAAT	2	10	122054	122063	40 %	20 %	0 %	40 %	478467663
95	NC_020978	GCTTC	2	10	123155	123164	0 %	40 %	20 %	40 %	478467663
96	NC_020978	TACAA	2	10	126944	126953	60 %	20 %	0 %	20 %	478467667
97	NC_020978	ATCCA	2	10	129351	129360	40 %	20 %	0 %	40 %	478467671
98	NC_020978	GAAGA	2	10	130901	130910	60 %	0 %	40 %	0 %	478467671
99	NC_020978	AAAAG	2	10	132813	132822	80 %	0 %	20 %	0 %	478467672
100	NC_020978	GATTC	2	10	133144	133153	20 %	40 %	20 %	20 %	478467672
101	NC_020978	GGATA	2	10	135762	135771	40 %	20 %	40 %	0 %	478467674
102	NC_020978	ATTGT	2	10	136459	136468	20 %	60 %	20 %	0 %	478467675
103	NC_020978	TCCAG	2	10	140631	140640	20 %	20 %	20 %	40 %	478467682
104	NC_020978	GTACA	2	10	141362	141371	40 %	20 %	20 %	20 %	478467683
105	NC_020978	TAGAT	2	10	141735	141744	40 %	40 %	20 %	0 %	478467683
106	NC_020978	AAAAC	2	10	142627	142636	80 %	0 %	0 %	20 %	478467684
107	NC_020978	TGCTA	2	10	143713	143722	20 %	40 %	20 %	20 %	478467686
108	NC_020978	GGAGC	2	10	143760	143769	20 %	0 %	60 %	20 %	478467686
109	NC_020978	CTGGG	2	10	145175	145184	0 %	20 %	60 %	20 %	478467688
110	NC_020978	GTTTT	2	10	145922	145931	0 %	80 %	20 %	0 %	478467689
111	NC_020978	GAACC	2	10	149656	149665	40 %	0 %	20 %	40 %	478467690
112	NC_020978	ATTCT	2	10	153153	153162	20 %	60 %	0 %	20 %	478467694
113	NC_020978	CTGTG	2	10	153357	153366	0 %	40 %	40 %	20 %	478467694
114	NC_020978	TTCTT	2	10	155830	155839	0 %	80 %	0 %	20 %	478467697
115	NC_020978	AGGAA	2	10	160389	160398	60 %	0 %	40 %	0 %	478467701
116	NC_020978	AGAGA	2	10	163629	163638	60 %	0 %	40 %	0 %	478467704
117	NC_020978	AGCAA	2	10	164064	164073	60 %	0 %	20 %	20 %	478467704
118	NC_020978	TATGA	2	10	164488	164497	40 %	40 %	20 %	0 %	478467705
119	NC_020978	CAAAA	2	10	167567	167576	80 %	0 %	0 %	20 %	478467706
120	NC_020978	AAGAG	2	10	168400	168409	60 %	0 %	40 %	0 %	478467706
121	NC_020978	GATTG	2	10	168745	168754	20 %	40 %	40 %	0 %	478467706
122	NC_020978	GTTTT	2	10	175224	175233	0 %	80 %	20 %	0 %	478467710
123	NC_020978	TATTG	2	10	175247	175256	20 %	60 %	20 %	0 %	478467710
124	NC_020978	CAGCA	2	10	175606	175615	40 %	0 %	20 %	40 %	478467710
125	NC_020978	TAGGA	2	10	175911	175920	40 %	20 %	40 %	0 %	478467711
126	NC_020978	TGATT	2	10	177838	177847	20 %	60 %	20 %	0 %	478467712
127	NC_020978	TCAAT	2	10	178479	178488	40 %	40 %	0 %	20 %	478467712
128	NC_020978	TTTTC	2	10	178518	178527	0 %	80 %	0 %	20 %	478467712
129	NC_020978	GGAAT	2	10	180077	180086	40 %	20 %	40 %	0 %	478467714
130	NC_020978	AGAGT	2	10	181464	181473	40 %	20 %	40 %	0 %	478467716
131	NC_020978	TTGAA	2	10	182154	182163	40 %	40 %	20 %	0 %	478467717
132	NC_020978	TGAGT	2	10	182968	182977	20 %	40 %	40 %	0 %	478467717
133	NC_020978	AGGGG	2	10	183165	183174	20 %	0 %	80 %	0 %	478467717
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135	NC_020978	ATAGA	2	10	183737	183746	60 %	20 %	20 %	0 %	478467718
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