MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020975	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478471161
2	NC_020975	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478471161
3	NC_020975	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478471161
4	NC_020975	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478471161
5	NC_020975	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478471161
6	NC_020975	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478471161
7	NC_020975	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478471162
8	NC_020975	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478471163
9	NC_020975	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478471163
10	NC_020975	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478471164
11	NC_020975	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478471164
12	NC_020975	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478471165
13	NC_020975	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478471165
14	NC_020975	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478471165
15	NC_020975	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478471165
16	NC_020975	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478471166
17	NC_020975	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478471166
18	NC_020975	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478471166
19	NC_020975	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478471167
20	NC_020975	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478471167
21	NC_020975	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478471168
22	NC_020975	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478471169
23	NC_020975	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478471169
24	NC_020975	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478471169
25	NC_020975	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478471169
26	NC_020975	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478471170
27	NC_020975	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478471170
28	NC_020975	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478471170
29	NC_020975	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478471171
30	NC_020975	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478471171
31	NC_020975	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478471171
32	NC_020975	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478471171
33	NC_020975	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478471173
34	NC_020975	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478471173
35	NC_020975	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478471174
36	NC_020975	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478471174
37	NC_020975	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478471174
38	NC_020975	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478471175
39	NC_020975	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478471175
40	NC_020975	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478471176
41	NC_020975	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478471176
42	NC_020975	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478471176
43	NC_020975	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478471176
44	NC_020975	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478471176
45	NC_020975	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478471178
46	NC_020975	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478471178
47	NC_020975	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478471180
48	NC_020975	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478471180
49	NC_020975	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478471180
50	NC_020975	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478471180
51	NC_020975	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478471180
52	NC_020975	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478471180
53	NC_020975	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478471180
54	NC_020975	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478471180
55	NC_020975	TTGA	2	8	25654	25661	25 %	50 %	25 %	0 %	478471181
56	NC_020975	TAGG	2	8	25878	25885	25 %	25 %	50 %	0 %	478471181
57	NC_020975	TTCC	2	8	26002	26009	0 %	50 %	0 %	50 %	478471181
58	NC_020975	TAGG	2	8	26116	26123	25 %	25 %	50 %	0 %	478471181
59	NC_020975	GCTT	2	8	26888	26895	0 %	50 %	25 %	25 %	478471181
60	NC_020975	GGAA	2	8	27471	27478	50 %	0 %	50 %	0 %	478471182
61	NC_020975	TTAA	2	8	27544	27551	50 %	50 %	0 %	0 %	478471182
62	NC_020975	AAAG	2	8	27594	27601	75 %	0 %	25 %	0 %	478471182
63	NC_020975	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478471183
64	NC_020975	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478471183
65	NC_020975	CTTT	2	8	30151	30158	0 %	75 %	0 %	25 %	478471185
66	NC_020975	TTTG	2	8	30166	30173	0 %	75 %	25 %	0 %	478471185
67	NC_020975	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478471185
68	NC_020975	TGGC	2	8	30364	30371	0 %	25 %	50 %	25 %	478471185
69	NC_020975	AAAG	2	8	30924	30931	75 %	0 %	25 %	0 %	478471186
70	NC_020975	AAAC	2	8	30994	31001	75 %	0 %	0 %	25 %	478471186
71	NC_020975	GATG	2	8	31137	31144	25 %	25 %	50 %	0 %	478471186
72	NC_020975	GATA	2	8	32246	32253	50 %	25 %	25 %	0 %	478471188
73	NC_020975	TGAT	2	8	34741	34748	25 %	50 %	25 %	0 %	478471191
74	NC_020975	AAGA	3	12	34869	34880	75 %	0 %	25 %	0 %	478471191
75	NC_020975	AAGC	2	8	35089	35096	50 %	0 %	25 %	25 %	478471192
76	NC_020975	GTTC	2	8	35122	35129	0 %	50 %	25 %	25 %	478471192
77	NC_020975	GGCA	2	8	35501	35508	25 %	0 %	50 %	25 %	478471193
78	NC_020975	TGCT	2	8	35911	35918	0 %	50 %	25 %	25 %	478471193
79	NC_020975	TTGG	2	8	36143	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	478471193
80	NC_020975	AGAT	2	8	36863	36870	50 %	25 %	25 %	0 %	478471193
81	NC_020975	CTTT	2	8	37235	37242	0 %	75 %	0 %	25 %	478471194
82	NC_020975	ATGA	2	8	37725	37732	50 %	25 %	25 %	0 %	478471194
83	NC_020975	TAGG	2	8	37884	37891	25 %	25 %	50 %	0 %	478471194
84	NC_020975	CAAT	2	8	38068	38075	50 %	25 %	0 %	25 %	478471194
85	NC_020975	AATG	2	8	38855	38862	50 %	25 %	25 %	0 %	478471194
86	NC_020975	AGAA	2	8	39692	39699	75 %	0 %	25 %	0 %	478471195
87	NC_020975	AAGA	2	8	39744	39751	75 %	0 %	25 %	0 %	478471195
88	NC_020975	ATCC	2	8	39752	39759	25 %	25 %	0 %	50 %	478471195
89	NC_020975	TAAT	2	8	39963	39970	50 %	50 %	0 %	0 %	478471195
90	NC_020975	GTGC	2	8	42051	42058	0 %	25 %	50 %	25 %	478471197
91	NC_020975	AGAA	2	8	42470	42477	75 %	0 %	25 %	0 %	478471197
92	NC_020975	GGAT	2	8	42622	42629	25 %	25 %	50 %	0 %	478471197
93	NC_020975	AAAC	2	8	43761	43768	75 %	0 %	0 %	25 %	478471199
94	NC_020975	CAAT	2	8	43965	43972	50 %	25 %	0 %	25 %	478471199
95	NC_020975	ATTT	2	8	44721	44728	25 %	75 %	0 %	0 %	478471200
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98	NC_020975	TTGA	2	8	45771	45778	25 %	50 %	25 %	0 %	478471201
99	NC_020975	TGTT	2	8	45943	45950	0 %	75 %	25 %	0 %	478471201
100	NC_020975	CTAT	2	8	45973	45980	25 %	50 %	0 %	25 %	478471201
101	NC_020975	TGTT	2	8	46002	46009	0 %	75 %	25 %	0 %	478471201
102	NC_020975	CTAT	2	8	46298	46305	25 %	50 %	0 %	25 %	478471201
103	NC_020975	AAGA	2	8	46793	46800	75 %	0 %	25 %	0 %	478471202
104	NC_020975	AAGA	2	8	46850	46857	75 %	0 %	25 %	0 %	478471202
105	NC_020975	AAAG	2	8	46890	46897	75 %	0 %	25 %	0 %	478471202
106	NC_020975	AAGA	2	8	47005	47012	75 %	0 %	25 %	0 %	478471202
107	NC_020975	ACTT	2	8	47266	47273	25 %	50 %	0 %	25 %	478471202
108	NC_020975	ATGG	2	8	47892	47899	25 %	25 %	50 %	0 %	478471202
109	NC_020975	AGGA	2	8	47923	47930	50 %	0 %	50 %	0 %	478471202
110	NC_020975	GAAC	2	8	48470	48477	50 %	0 %	25 %	25 %	478471202
111	NC_020975	AACA	2	8	48714	48721	75 %	0 %	0 %	25 %	478471203
112	NC_020975	CTTT	2	8	48910	48917	0 %	75 %	0 %	25 %	478471203
113	NC_020975	CTTT	2	8	49795	49802	0 %	75 %	0 %	25 %	478471204
114	NC_020975	GTAG	2	8	49813	49820	25 %	25 %	50 %	0 %	478471204
115	NC_020975	GAAG	2	8	51243	51250	50 %	0 %	50 %	0 %	478471205
116	NC_020975	TTCA	2	8	51665	51672	25 %	50 %	0 %	25 %	478471205
117	NC_020975	TCTA	2	8	51882	51889	25 %	50 %	0 %	25 %	478471205
118	NC_020975	GGAA	2	8	52999	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	478471207
119	NC_020975	TTAA	2	8	53740	53747	50 %	50 %	0 %	0 %	478471207
120	NC_020975	CCTT	2	8	53947	53954	0 %	50 %	0 %	50 %	478471208
121	NC_020975	TTTA	2	8	54114	54121	25 %	75 %	0 %	0 %	478471208
122	NC_020975	AAAG	2	8	54338	54345	75 %	0 %	25 %	0 %	478471208
123	NC_020975	GATT	2	8	54475	54482	25 %	50 %	25 %	0 %	478471208
124	NC_020975	AATC	2	8	54530	54537	50 %	25 %	0 %	25 %	478471208
125	NC_020975	TATT	2	8	54591	54598	25 %	75 %	0 %	0 %	478471208
126	NC_020975	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478471209
127	NC_020975	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478471209
128	NC_020975	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478471209
129	NC_020975	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478471209
130	NC_020975	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478471209
131	NC_020975	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478471209
132	NC_020975	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478471210
133	NC_020975	TTGC	2	8	56579	56586	0 %	50 %	25 %	25 %	478471210
134	NC_020975	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478471210
135	NC_020975	AGCT	2	8	57078	57085	25 %	25 %	25 %	25 %	478471210
136	NC_020975	TTTG	2	8	57312	57319	0 %	75 %	25 %	0 %	478471210
137	NC_020975	GGTT	2	8	57772	57779	0 %	50 %	50 %	0 %	478471210
138	NC_020975	GAAA	2	8	58710	58717	75 %	0 %	25 %	0 %	478471211
139	NC_020975	AGGT	2	8	58749	58756	25 %	25 %	50 %	0 %	478471211
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