MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020975	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478471161
2	NC_020975	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478471161
3	NC_020975	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020975	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020975	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478471164
6	NC_020975	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478471164
7	NC_020975	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478471164
8	NC_020975	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478471165
9	NC_020975	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478471166
10	NC_020975	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478471166
11	NC_020975	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478471166
12	NC_020975	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478471166
13	NC_020975	AG	3	6	6537	6542	50 %	0 %	50 %	0 %	478471166
14	NC_020975	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020975	AC	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	478471168
16	NC_020975	AG	3	6	8989	8994	50 %	0 %	50 %	0 %	478471169
17	NC_020975	CT	4	8	9108	9115	0 %	50 %	0 %	50 %	478471169
18	NC_020975	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	478471169
19	NC_020975	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020975	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478471171
21	NC_020975	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478471171
22	NC_020975	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020975	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478471172
24	NC_020975	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478471172
25	NC_020975	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478471173
26	NC_020975	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478471173
27	NC_020975	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478471173
28	NC_020975	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020975	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020975	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478471174
31	NC_020975	CT	3	6	15295	15300	0 %	50 %	0 %	50 %	478471174
32	NC_020975	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478471175
33	NC_020975	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478471175
34	NC_020975	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478471176
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36	NC_020975	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478471176
37	NC_020975	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020975	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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41	NC_020975	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020975	TC	3	6	19250	19255	0 %	50 %	0 %	50 %	478471178
43	NC_020975	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478471178
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45	NC_020975	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478471178
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50	NC_020975	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020975	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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64	NC_020975	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020975	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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70	NC_020975	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	478471184
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108	NC_020975	GA	3	6	41626	41631	50 %	0 %	50 %	0 %	478471196
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111	NC_020975	GA	4	8	42612	42619	50 %	0 %	50 %	0 %	478471197
112	NC_020975	AG	3	6	42848	42853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020975	CT	3	6	42914	42919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020975	AG	3	6	43244	43249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020975	TG	3	6	43607	43612	0 %	50 %	50 %	0 %	478471198
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119	NC_020975	TA	3	6	44488	44493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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126	NC_020975	TG	3	6	46945	46950	0 %	50 %	50 %	0 %	478471202
127	NC_020975	AG	3	6	46998	47003	50 %	0 %	50 %	0 %	478471202
128	NC_020975	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020975	AG	3	6	49922	49927	50 %	0 %	50 %	0 %	478471204
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