MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 2509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020974	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478463064
2	NC_020974	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478463064
3	NC_020974	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478463064
4	NC_020974	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478463064
5	NC_020974	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478463064
6	NC_020974	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478463064
7	NC_020974	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478463065
8	NC_020974	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478463066
9	NC_020974	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478463066
10	NC_020974	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478463067
11	NC_020974	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478463067
12	NC_020974	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478463068
13	NC_020974	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478463068
14	NC_020974	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478463068
15	NC_020974	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478463068
16	NC_020974	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478463069
17	NC_020974	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478463069
18	NC_020974	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478463069
19	NC_020974	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478463070
20	NC_020974	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478463070
21	NC_020974	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478463071
22	NC_020974	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478463072
23	NC_020974	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478463072
24	NC_020974	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478463072
25	NC_020974	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478463072
26	NC_020974	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478463073
27	NC_020974	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478463073
28	NC_020974	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478463073
29	NC_020974	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478463074
30	NC_020974	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478463074
31	NC_020974	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478463074
32	NC_020974	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478463074
33	NC_020974	AATG	2	8	12141	12148	50 %	25 %	25 %	0 %	478463075
34	NC_020974	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478463076
35	NC_020974	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478463076
36	NC_020974	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478463077
37	NC_020974	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478463077
38	NC_020974	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478463077
39	NC_020974	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478463078
40	NC_020974	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478463078
41	NC_020974	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478463079
42	NC_020974	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478463079
43	NC_020974	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478463079
44	NC_020974	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478463079
45	NC_020974	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478463079
46	NC_020974	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478463081
47	NC_020974	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478463081
48	NC_020974	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478463083
49	NC_020974	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478463083
50	NC_020974	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478463083
51	NC_020974	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478463083
52	NC_020974	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478463083
53	NC_020974	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478463083
54	NC_020974	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478463083
55	NC_020974	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478463083
56	NC_020974	TTGA	2	8	25654	25661	25 %	50 %	25 %	0 %	478463084
57	NC_020974	TAGG	2	8	25878	25885	25 %	25 %	50 %	0 %	478463084
58	NC_020974	TTCC	2	8	26002	26009	0 %	50 %	0 %	50 %	478463084
59	NC_020974	TAGG	2	8	26116	26123	25 %	25 %	50 %	0 %	478463084
60	NC_020974	GCTT	2	8	26888	26895	0 %	50 %	25 %	25 %	478463084
61	NC_020974	GGAA	2	8	27471	27478	50 %	0 %	50 %	0 %	478463085
62	NC_020974	TTAA	2	8	27544	27551	50 %	50 %	0 %	0 %	478463085
63	NC_020974	AAAG	2	8	27594	27601	75 %	0 %	25 %	0 %	478463085
64	NC_020974	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478463086
65	NC_020974	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478463086
66	NC_020974	CTTT	2	8	30151	30158	0 %	75 %	0 %	25 %	478463088
67	NC_020974	TTTG	2	8	30166	30173	0 %	75 %	25 %	0 %	478463088
68	NC_020974	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478463088
69	NC_020974	TGGC	2	8	30364	30371	0 %	25 %	50 %	25 %	478463088
70	NC_020974	AAAG	2	8	30924	30931	75 %	0 %	25 %	0 %	478463089
71	NC_020974	AAAC	2	8	30994	31001	75 %	0 %	0 %	25 %	478463089
72	NC_020974	GATG	2	8	31137	31144	25 %	25 %	50 %	0 %	478463089
73	NC_020974	GATA	2	8	32246	32253	50 %	25 %	25 %	0 %	478463091
74	NC_020974	TGAT	2	8	34741	34748	25 %	50 %	25 %	0 %	478463094
75	NC_020974	AAGA	3	12	34869	34880	75 %	0 %	25 %	0 %	478463094
76	NC_020974	AAGC	2	8	35089	35096	50 %	0 %	25 %	25 %	478463095
77	NC_020974	GTTC	2	8	35122	35129	0 %	50 %	25 %	25 %	478463095
78	NC_020974	GGCA	2	8	35501	35508	25 %	0 %	50 %	25 %	478463096
79	NC_020974	TGCT	2	8	35911	35918	0 %	50 %	25 %	25 %	478463096
80	NC_020974	TTGG	2	8	36143	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	478463096
81	NC_020974	AGAT	2	8	36863	36870	50 %	25 %	25 %	0 %	478463096
82	NC_020974	CTTT	2	8	37235	37242	0 %	75 %	0 %	25 %	478463097
83	NC_020974	ATGA	2	8	37725	37732	50 %	25 %	25 %	0 %	478463097
84	NC_020974	TAGG	2	8	37884	37891	25 %	25 %	50 %	0 %	478463097
85	NC_020974	CAAT	2	8	38068	38075	50 %	25 %	0 %	25 %	478463097
86	NC_020974	AATG	2	8	38855	38862	50 %	25 %	25 %	0 %	478463097
87	NC_020974	AGAA	2	8	39692	39699	75 %	0 %	25 %	0 %	478463098
88	NC_020974	AAGA	2	8	39744	39751	75 %	0 %	25 %	0 %	478463098
89	NC_020974	ATCC	2	8	39752	39759	25 %	25 %	0 %	50 %	478463098
90	NC_020974	TAAT	2	8	39963	39970	50 %	50 %	0 %	0 %	478463098
91	NC_020974	GTGC	2	8	42051	42058	0 %	25 %	50 %	25 %	478463100
92	NC_020974	AGAA	2	8	42470	42477	75 %	0 %	25 %	0 %	478463100
93	NC_020974	GGAT	2	8	42622	42629	25 %	25 %	50 %	0 %	478463100
94	NC_020974	AAAC	2	8	43761	43768	75 %	0 %	0 %	25 %	478463102
95	NC_020974	CAAT	2	8	43965	43972	50 %	25 %	0 %	25 %	478463102
96	NC_020974	ATTT	2	8	44721	44728	25 %	75 %	0 %	0 %	478463103
97	NC_020974	GCTC	2	8	45029	45036	0 %	25 %	25 %	50 %	478463103
98	NC_020974	TTCT	2	8	45171	45178	0 %	75 %	0 %	25 %	478463103
99	NC_020974	TTGA	2	8	45771	45778	25 %	50 %	25 %	0 %	478463104
100	NC_020974	TGTT	2	8	45943	45950	0 %	75 %	25 %	0 %	478463104
101	NC_020974	CTAT	2	8	45973	45980	25 %	50 %	0 %	25 %	478463104
102	NC_020974	TGTT	2	8	46002	46009	0 %	75 %	25 %	0 %	478463104
103	NC_020974	CTAT	2	8	46298	46305	25 %	50 %	0 %	25 %	478463104
104	NC_020974	AAGA	2	8	46793	46800	75 %	0 %	25 %	0 %	478463105
105	NC_020974	AAGA	2	8	46850	46857	75 %	0 %	25 %	0 %	478463105
106	NC_020974	AAAG	2	8	46890	46897	75 %	0 %	25 %	0 %	478463105
107	NC_020974	AAGA	2	8	47005	47012	75 %	0 %	25 %	0 %	478463105
108	NC_020974	ACTT	2	8	47266	47273	25 %	50 %	0 %	25 %	478463105
109	NC_020974	ATGG	2	8	47892	47899	25 %	25 %	50 %	0 %	478463105
110	NC_020974	AGGA	2	8	47923	47930	50 %	0 %	50 %	0 %	478463105
111	NC_020974	GAAC	2	8	48470	48477	50 %	0 %	25 %	25 %	478463105
112	NC_020974	AACA	2	8	48716	48723	75 %	0 %	0 %	25 %	478463106
113	NC_020974	CTTT	2	8	48912	48919	0 %	75 %	0 %	25 %	478463106
114	NC_020974	CTTT	2	8	49797	49804	0 %	75 %	0 %	25 %	478463107
115	NC_020974	GTAG	2	8	49815	49822	25 %	25 %	50 %	0 %	478463107
116	NC_020974	GAAG	2	8	51245	51252	50 %	0 %	50 %	0 %	478463108
117	NC_020974	TTCA	2	8	51667	51674	25 %	50 %	0 %	25 %	478463108
118	NC_020974	TCTA	2	8	51884	51891	25 %	50 %	0 %	25 %	478463108
119	NC_020974	GGAA	2	8	53002	53009	50 %	0 %	50 %	0 %	478463110
120	NC_020974	TTAA	2	8	53743	53750	50 %	50 %	0 %	0 %	478463110
121	NC_020974	CCTT	2	8	53950	53957	0 %	50 %	0 %	50 %	478463111
122	NC_020974	TTTA	2	8	54117	54124	25 %	75 %	0 %	0 %	478463111
123	NC_020974	AAAG	2	8	54341	54348	75 %	0 %	25 %	0 %	478463111
124	NC_020974	GATT	2	8	54478	54485	25 %	50 %	25 %	0 %	478463111
125	NC_020974	AATC	2	8	54533	54540	50 %	25 %	0 %	25 %	478463111
126	NC_020974	TATT	2	8	54594	54601	25 %	75 %	0 %	0 %	478463111
127	NC_020974	TCGA	2	8	54982	54989	25 %	25 %	25 %	25 %	478463112
128	NC_020974	CTTC	2	8	55076	55083	0 %	50 %	0 %	50 %	478463112
129	NC_020974	GAAT	2	8	55111	55118	50 %	25 %	25 %	0 %	478463112
130	NC_020974	TTGA	2	8	55181	55188	25 %	50 %	25 %	0 %	478463112
131	NC_020974	GGAA	2	8	55537	55544	50 %	0 %	50 %	0 %	478463112
132	NC_020974	AGAA	2	8	55883	55890	75 %	0 %	25 %	0 %	478463112
133	NC_020974	CTGG	3	12	56448	56459	0 %	25 %	50 %	25 %	478463113
134	NC_020974	TTGC	2	8	56582	56589	0 %	50 %	25 %	25 %	478463113
135	NC_020974	AGCG	2	8	56622	56629	25 %	0 %	50 %	25 %	478463113
136	NC_020974	AGCT	2	8	57081	57088	25 %	25 %	25 %	25 %	478463113
137	NC_020974	TTTG	2	8	57327	57334	0 %	75 %	25 %	0 %	478463113
138	NC_020974	GGTT	2	8	57787	57794	0 %	50 %	50 %	0 %	478463113
139	NC_020974	AGAA	2	8	58721	58728	75 %	0 %	25 %	0 %	478463114
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