MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 1228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020974	AAG	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020974	TGG	2	6	1833	1838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020974	CTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020974	TAA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020974	GCA	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020974	AGA	2	6	5679	5684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020974	CTT	2	6	6959	6964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020974	GAA	2	6	7674	7679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020974	TTA	2	6	7751	7756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020974	GAA	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020974	ATG	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020974	TTC	3	9	9774	9782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020974	ATC	2	6	9790	9795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020974	GAA	2	6	9828	9833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020974	CCT	2	6	9929	9934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020974	TAG	2	6	11792	11797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020974	CTT	2	6	11842	11847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020974	TCA	2	6	11879	11884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020974	AAT	2	6	13865	13870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020974	ACC	2	6	13876	13881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_020974	ATT	2	6	13973	13978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020974	AAG	2	6	13990	13995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020974	TTA	2	6	14016	14021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020974	AAG	2	6	14050	14055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020974	AAC	2	6	14134	14139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020974	CTT	2	6	15557	15562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020974	GTT	2	6	18230	18235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020974	AGA	2	6	18976	18981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020974	AAT	3	9	19038	19046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020974	TCT	2	6	19066	19071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020974	CTT	3	9	20492	20500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020974	GAA	2	6	21017	21022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020974	GGA	2	6	21211	21216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020974	AGA	3	9	21251	21259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020974	TGG	2	6	21470	21475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020974	AAC	2	6	21509	21514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020974	AGC	2	6	21526	21531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020974	TGA	2	6	21727	21732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020974	TCC	2	6	21844	21849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020974	AAT	2	6	22020	22025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020974	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020974	ACT	2	6	27127	27132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020974	TAA	2	6	28480	28485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020974	AGA	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020974	CTG	2	6	33721	33726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020974	CTT	2	6	37077	37082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020974	TAA	2	6	39415	39420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020974	AAG	2	6	39456	39461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020974	CTC	2	6	40733	40738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020974	AAG	2	6	40818	40823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020974	GTT	2	6	42825	42830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020974	AAG	2	6	42865	42870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020974	ATG	2	6	42975	42980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020974	GAG	2	6	42989	42994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020974	ACC	2	6	43133	43138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020974	GAT	2	6	43204	43209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020974	AAG	2	6	43210	43215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020974	GGA	2	6	43262	43267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020974	TAA	2	6	43360	43365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020974	AAG	2	6	44500	44505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020974	GGA	2	6	44544	44549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020974	ACT	2	6	44591	44596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020974	AAG	2	6	46442	46447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020974	TAA	2	6	48514	48519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020974	GAA	2	6	48530	48535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020974	TGT	2	6	48591	48596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020974	GTC	2	6	49269	49274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020974	AAG	2	6	49291	49296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020974	TAT	2	6	49320	49325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020974	AGA	2	6	50092	50097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020974	AAG	2	6	50154	50159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020974	TCT	2	6	50168	50173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020974	ACT	2	6	50209	50214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020974	AAT	2	6	50244	50249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020974	GCC	2	6	50313	50318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_020974	ATT	2	6	50362	50367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020974	CAA	2	6	50381	50386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020974	ATA	2	6	51917	51922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020974	TAA	2	6	51938	51943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020974	AGT	3	9	52007	52015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020974	GAT	2	6	52720	52725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020974	AAG	2	6	52798	52803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020974	AAT	2	6	52825	52830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020974	ATT	2	6	52837	52842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020974	AAG	2	6	61483	61488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020974	AGG	2	6	61491	61496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020974	ACA	2	6	69279	69284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020974	AGA	2	6	72474	72479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020974	CGT	2	6	72522	72527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020974	AAG	2	6	75315	75320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020974	ACT	2	6	75330	75335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020974	AGT	2	6	75366	75371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020974	CTT	2	6	77335	77340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020974	GAG	3	9	79095	79103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020974	AGG	2	6	79126	79131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020974	ACC	2	6	79177	79182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020974	TTA	2	6	79829	79834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020974	CAT	2	6	80029	80034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020974	TAG	2	6	80047	80052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020974	TTC	2	6	80081	80086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020974	GTT	2	6	80099	80104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020974	GTT	2	6	80141	80146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020974	ATT	2	6	80150	80155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020974	AGG	2	6	80280	80285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020974	TAG	2	6	80352	80357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020974	GTG	2	6	85698	85703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020974	GTA	2	6	85722	85727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020974	AGC	2	6	85794	85799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020974	ATT	2	6	88658	88663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020974	AAC	2	6	88749	88754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020974	ATT	2	6	91164	91169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020974	GAA	2	6	91183	91188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020974	AAG	3	9	91223	91231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020974	AGT	2	6	92577	92582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020974	GGA	2	6	92606	92611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020974	GTT	2	6	93523	93528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020974	TGA	2	6	93573	93578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020974	AGA	2	6	93591	93596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020974	GAG	2	6	93616	93621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020974	AGA	2	6	93642	93647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020974	CCA	2	6	93673	93678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020974	AAG	2	6	93701	93706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020974	GAA	2	6	93737	93742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020974	TGA	2	6	93793	93798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020974	TAA	2	6	93823	93828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020974	AGC	2	6	93942	93947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020974	AGT	2	6	93974	93979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020974	TGA	2	6	94099	94104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020974	TAA	2	6	94225	94230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020974	TAA	2	6	94648	94653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020974	TAA	2	6	94721	94726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020974	ATT	3	9	94938	94946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020974	GAA	2	6	100631	100636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020974	TTA	2	6	102739	102744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020974	TCT	2	6	104025	104030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020974	TAA	3	9	107451	107459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020974	CTT	2	6	107495	107500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020974	CTC	2	6	114575	114580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_020974	ATT	2	6	114671	114676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020974	ATG	2	6	116400	116405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020974	AGT	2	6	116434	116439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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