MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 2383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020974	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478463064
2	NC_020974	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478463064
3	NC_020974	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020974	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020974	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478463067
6	NC_020974	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478463067
7	NC_020974	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478463067
8	NC_020974	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478463068
9	NC_020974	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478463069
10	NC_020974	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478463069
11	NC_020974	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478463069
12	NC_020974	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478463069
13	NC_020974	TA	3	6	6200	6205	50 %	50 %	0 %	0 %	478463069
14	NC_020974	AG	3	6	6537	6542	50 %	0 %	50 %	0 %	478463069
15	NC_020974	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020974	AC	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	478463071
17	NC_020974	AG	3	6	8989	8994	50 %	0 %	50 %	0 %	478463072
18	NC_020974	CT	4	8	9108	9115	0 %	50 %	0 %	50 %	478463072
19	NC_020974	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	478463072
20	NC_020974	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020974	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478463074
22	NC_020974	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478463074
23	NC_020974	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020974	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478463075
25	NC_020974	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478463075
26	NC_020974	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478463076
27	NC_020974	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478463076
28	NC_020974	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478463076
29	NC_020974	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020974	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020974	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478463077
32	NC_020974	CT	3	6	15295	15300	0 %	50 %	0 %	50 %	478463077
33	NC_020974	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478463078
34	NC_020974	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478463078
35	NC_020974	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478463079
36	NC_020974	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478463079
37	NC_020974	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478463079
38	NC_020974	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020974	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020974	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478463080
41	NC_020974	TC	3	6	18822	18827	0 %	50 %	0 %	50 %	478463080
42	NC_020974	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020974	TC	3	6	19250	19255	0 %	50 %	0 %	50 %	478463081
44	NC_020974	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478463081
45	NC_020974	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478463081
46	NC_020974	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478463081
47	NC_020974	AG	4	8	20116	20123	50 %	0 %	50 %	0 %	478463081
48	NC_020974	GT	3	6	20379	20384	0 %	50 %	50 %	0 %	478463081
49	NC_020974	AG	3	6	20607	20612	50 %	0 %	50 %	0 %	478463082
50	NC_020974	TG	3	6	20720	20725	0 %	50 %	50 %	0 %	478463082
51	NC_020974	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020974	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020974	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020974	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020974	CT	4	8	22517	22524	0 %	50 %	0 %	50 %	478463083
56	NC_020974	AT	3	6	22787	22792	50 %	50 %	0 %	0 %	478463083
57	NC_020974	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	478463083
58	NC_020974	GA	3	6	24430	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	478463083
59	NC_020974	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478463083
60	NC_020974	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	478463083
61	NC_020974	GA	3	6	26320	26325	50 %	0 %	50 %	0 %	478463084
62	NC_020974	GT	3	6	26340	26345	0 %	50 %	50 %	0 %	478463084
63	NC_020974	TA	3	6	26542	26547	50 %	50 %	0 %	0 %	478463084
64	NC_020974	GA	3	6	26988	26993	50 %	0 %	50 %	0 %	478463084
65	NC_020974	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020974	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020974	AT	3	6	27405	27410	50 %	50 %	0 %	0 %	478463085
68	NC_020974	GA	3	6	27619	27624	50 %	0 %	50 %	0 %	478463085
69	NC_020974	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020974	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020974	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	478463087
72	NC_020974	TC	3	6	29046	29051	0 %	50 %	0 %	50 %	478463087
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75	NC_020974	GA	3	6	30533	30538	50 %	0 %	50 %	0 %	478463088
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79	NC_020974	GA	3	6	31829	31834	50 %	0 %	50 %	0 %	478463089
80	NC_020974	AT	3	6	31970	31975	50 %	50 %	0 %	0 %	478463090
81	NC_020974	TC	3	6	32255	32260	0 %	50 %	0 %	50 %	478463091
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83	NC_020974	AG	3	6	32867	32872	50 %	0 %	50 %	0 %	478463091
84	NC_020974	TC	3	6	34364	34369	0 %	50 %	0 %	50 %	478463093
85	NC_020974	AG	3	6	34377	34382	50 %	0 %	50 %	0 %	478463093
86	NC_020974	AG	3	6	34515	34520	50 %	0 %	50 %	0 %	478463094
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88	NC_020974	GA	4	8	35231	35238	50 %	0 %	50 %	0 %	478463095
89	NC_020974	TG	3	6	36056	36061	0 %	50 %	50 %	0 %	478463096
90	NC_020974	CT	3	6	36875	36880	0 %	50 %	0 %	50 %	478463096
91	NC_020974	GA	3	6	36984	36989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020974	AT	3	6	37085	37090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020974	GA	3	6	37133	37138	50 %	0 %	50 %	0 %	478463097
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95	NC_020974	AG	3	6	38128	38133	50 %	0 %	50 %	0 %	478463097
96	NC_020974	AG	3	6	38674	38679	50 %	0 %	50 %	0 %	478463097
97	NC_020974	AG	3	6	39201	39206	50 %	0 %	50 %	0 %	478463097
98	NC_020974	CT	3	6	39352	39357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020974	GA	3	6	39985	39990	50 %	0 %	50 %	0 %	478463098
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101	NC_020974	AG	3	6	40222	40227	50 %	0 %	50 %	0 %	478463098
102	NC_020974	CT	3	6	40722	40727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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104	NC_020974	GC	3	6	41247	41252	0 %	0 %	50 %	50 %	478463099
105	NC_020974	GA	3	6	41412	41417	50 %	0 %	50 %	0 %	478463099
106	NC_020974	TC	3	6	41421	41426	0 %	50 %	0 %	50 %	478463099
107	NC_020974	GC	3	6	41486	41491	0 %	0 %	50 %	50 %	478463099
108	NC_020974	TC	3	6	41524	41529	0 %	50 %	0 %	50 %	478463099
109	NC_020974	GA	3	6	41626	41631	50 %	0 %	50 %	0 %	478463099
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111	NC_020974	GA	3	6	42602	42607	50 %	0 %	50 %	0 %	478463100
112	NC_020974	GA	4	8	42612	42619	50 %	0 %	50 %	0 %	478463100
113	NC_020974	AG	3	6	42848	42853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020974	CT	3	6	42914	42919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020974	AG	3	6	43244	43249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020974	TG	3	6	43607	43612	0 %	50 %	50 %	0 %	478463101
117	NC_020974	AC	3	6	44002	44007	50 %	0 %	0 %	50 %	478463102
118	NC_020974	TC	3	6	44171	44176	0 %	50 %	0 %	50 %	478463102
119	NC_020974	TC	3	6	44336	44341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020974	TA	3	6	44488	44493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020974	TC	3	6	45400	45405	0 %	50 %	0 %	50 %	478463103
122	NC_020974	GA	3	6	45883	45888	50 %	0 %	50 %	0 %	478463104
123	NC_020974	TG	3	6	46101	46106	0 %	50 %	50 %	0 %	478463104
124	NC_020974	AG	3	6	46112	46117	50 %	0 %	50 %	0 %	478463104
125	NC_020974	AG	4	8	46553	46560	50 %	0 %	50 %	0 %	478463105
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128	NC_020974	AG	3	6	46998	47003	50 %	0 %	50 %	0 %	478463105
129	NC_020974	AG	3	6	48572	48577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_020974	TG	3	6	51923	51928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_020974	GA	3	6	53967	53972	50 %	0 %	50 %	0 %	478463111
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138	NC_020974	AT	3	6	56155	56160	50 %	50 %	0 %	0 %	478463112
139	NC_020974	GA	3	6	56192	56197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_020974	GT	3	6	57137	57142	0 %	50 %	50 %	0 %	478463113
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143	NC_020974	CT	3	6	58732	58737	0 %	50 %	0 %	50 %	478463114
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