MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020974	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020974	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020974	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020974	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020974	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020974	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020974	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020974	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020974	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020974	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020974	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020974	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020974	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020974	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020974	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020974	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020974	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020974	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020974	GA	3	6	36984	36989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020974	AT	3	6	37085	37090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020974	CT	3	6	39352	39357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020974	CT	3	6	40722	40727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020974	AG	3	6	42848	42853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020974	CT	3	6	42914	42919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020974	AG	3	6	43244	43249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020974	TC	3	6	44336	44341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020974	TA	3	6	44488	44493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020974	AG	3	6	48572	48577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020974	TG	3	6	51923	51928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020974	GA	3	6	56192	56197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020974	GA	3	6	61408	61413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020974	AG	4	8	65427	65434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020974	TA	3	6	69746	69751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020974	CT	3	6	72482	72487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020974	TA	3	6	85846	85851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020974	TC	3	6	91067	91072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020974	GA	3	6	91199	91204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020974	CT	3	6	93549	93554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020974	TA	3	6	93715	93720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020974	AG	3	6	93758	93763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020974	AG	3	6	93855	93860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020974	GA	3	6	94077	94082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020974	TA	3	6	94694	94699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020974	TC	3	6	100571	100576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020974	AT	3	6	100622	100627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020974	GC	3	6	102728	102733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020974	TA	3	6	107298	107303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020974	TG	3	6	116552	116557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020974	AG	4	8	119140	119147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020974	GA	3	6	120962	120967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020974	TA	3	6	123270	123275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020974	GT	3	6	124260	124265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020974	CT	3	6	128796	128801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020974	TC	3	6	131118	131123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020974	AG	3	6	131195	131200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020974	AG	3	6	131220	131225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020974	TG	3	6	137633	137638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020974	AG	3	6	138878	138883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020974	AG	3	6	157978	157983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020974	TC	3	6	172450	172455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020974	AG	3	6	172582	172587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020974	CT	3	6	172600	172605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020974	TG	3	6	179089	179094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020974	TA	3	6	184236	184241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020974	GA	3	6	184452	184457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020974	GA	3	6	185092	185097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020974	GA	3	6	185124	185129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020974	AG	3	6	189178	189183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020974	AT	3	6	189680	189685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020974	AG	3	6	193467	193472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020974	TC	3	6	196459	196464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020974	CT	3	6	200217	200222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020974	GA	4	8	203276	203283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020974	CT	4	8	203324	203331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020974	TA	3	6	204905	204910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020974	AG	3	6	214596	214601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020974	TA	3	6	216150	216155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020974	CT	3	6	217793	217798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020974	TC	3	6	220794	220799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020974	AG	3	6	220825	220830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020974	TC	3	6	235024	235029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020974	AG	3	6	235050	235055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020974	AC	3	6	239973	239978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020974	GA	3	6	247059	247064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020974	TG	3	6	247169	247174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020974	AG	3	6	247969	247974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020974	GA	3	6	248848	248853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020974	AG	3	6	248973	248978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020974	TA	3	6	250794	250799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020974	AG	3	6	253085	253090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020974	TC	3	6	253111	253116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020974	TA	3	6	260952	260957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020974	AG	3	6	261032	261037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020974	CA	3	6	262759	262764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020974	TC	3	6	264658	264663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020974	CA	3	6	270007	270012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020974	TA	3	6	270209	270214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020974	AT	4	8	280769	280776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020974	CT	3	6	281621	281626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020974	TC	4	8	281712	281719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020974	TC	3	6	283403	283408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020974	TC	3	6	283460	283465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020974	CT	3	6	283933	283938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020974	AT	3	6	295947	295952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020974	CA	3	6	298276	298281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020974	GA	3	6	303007	303012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020974	AG	3	6	312225	312230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020974	CT	3	6	344187	344192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020974	CT	3	6	347258	347263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020974	TC	3	6	351484	351489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020974	CT	3	6	355400	355405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020974	AC	3	6	358733	358738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020974	GA	3	6	360643	360648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020974	TC	3	6	360721	360726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020974	TA	3	6	360922	360927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020974	GC	3	6	362451	362456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020974	TC	3	6	362754	362759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020974	CT	4	8	378021	378028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020974	CG	3	6	387860	387865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020974	CA	3	6	388910	388915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020974	TC	3	6	391457	391462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020974	CT	3	6	391947	391952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020974	GA	3	6	392077	392082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020974	GA	3	6	392201	392206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020974	CT	3	6	406309	406314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020974	CT	3	6	407294	407299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020974	CT	3	6	426029	426034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020974	CT	3	6	427052	427057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020974	AG	3	6	427398	427403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020974	GA	3	6	429093	429098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020974	AC	3	6	433091	433096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020974	CT	3	6	437362	437367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020974	AC	3	6	437400	437405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020974	CA	3	6	439869	439874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020974	CT	3	6	441273	441278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020974	CT	3	6	450555	450560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020974	AG	3	6	456696	456701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020974	TC	3	6	463234	463239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020974	AT	3	6	463303	463308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020974	GA	4	8	464677	464684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020974	TA	3	6	464720	464725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020974	TC	3	6	476545	476550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020974	AC	3	6	482087	482092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020974	GA	4	8	482132	482139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020974	CA	3	6	482169	482174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020974	TC	3	6	482210	482215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020974	AC	3	6	486645	486650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020974	AG	3	6	486807	486812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020974	CT	3	6	486826	486831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020974	AG	3	6	487119	487124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020974	CT	3	6	490105	490110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020974	CT	3	6	490623	490628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020974	TG	3	6	490656	490661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020974	TA	3	6	490769	490774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.