MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 2858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020973	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478462165
2	NC_020973	GTTC	2	8	115	122	0 %	50 %	25 %	25 %	478462165
3	NC_020973	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478462165
4	NC_020973	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478462165
5	NC_020973	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478462165
6	NC_020973	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478462165
7	NC_020973	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478462165
8	NC_020973	AAGG	2	8	1906	1913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020973	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478462166
10	NC_020973	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478462167
11	NC_020973	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478462167
12	NC_020973	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478462168
13	NC_020973	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478462168
14	NC_020973	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478462169
15	NC_020973	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478462169
16	NC_020973	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478462169
17	NC_020973	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478462169
18	NC_020973	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478462170
19	NC_020973	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478462170
20	NC_020973	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478462170
21	NC_020973	GGAG	2	8	6903	6910	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020973	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478462171
23	NC_020973	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478462171
24	NC_020973	TATG	2	8	7552	7559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020973	ATTT	2	8	7693	7700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020973	TTTG	2	8	7785	7792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020973	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478462172
28	NC_020973	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478462173
29	NC_020973	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478462173
30	NC_020973	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478462173
31	NC_020973	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478462173
32	NC_020973	TATT	2	8	9908	9915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020973	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478462174
34	NC_020973	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478462174
35	NC_020973	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478462174
36	NC_020973	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478462175
37	NC_020973	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478462175
38	NC_020973	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478462175
39	NC_020973	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478462175
40	NC_020973	AGAA	2	8	11802	11809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020973	AATG	2	8	12141	12148	50 %	25 %	25 %	0 %	478462176
42	NC_020973	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478462177
43	NC_020973	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478462177
44	NC_020973	AAGG	2	8	14038	14045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020973	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478462178
46	NC_020973	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478462178
47	NC_020973	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478462178
48	NC_020973	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478462179
49	NC_020973	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478462179
50	NC_020973	CAAA	2	8	16672	16679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020973	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478462180
52	NC_020973	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478462180
53	NC_020973	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478462180
54	NC_020973	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478462180
55	NC_020973	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478462180
56	NC_020973	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478462182
57	NC_020973	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478462182
58	NC_020973	GCCA	2	8	21620	21627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020973	CGCT	2	8	21868	21875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020973	TTAA	2	8	21889	21896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020973	GTTA	2	8	21926	21933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020973	GATC	2	8	21981	21988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020973	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478462184
64	NC_020973	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478462184
65	NC_020973	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478462184
66	NC_020973	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478462184
67	NC_020973	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478462184
68	NC_020973	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478462184
69	NC_020973	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478462184
70	NC_020973	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478462184
71	NC_020973	TTGA	2	8	25653	25660	25 %	50 %	25 %	0 %	478462185
72	NC_020973	TAGG	2	8	25877	25884	25 %	25 %	50 %	0 %	478462185
73	NC_020973	TTCC	2	8	26001	26008	0 %	50 %	0 %	50 %	478462185
74	NC_020973	TAGG	2	8	26115	26122	25 %	25 %	50 %	0 %	478462185
75	NC_020973	GCTT	2	8	26887	26894	0 %	50 %	25 %	25 %	478462185
76	NC_020973	GGAA	2	8	27470	27477	50 %	0 %	50 %	0 %	478462186
77	NC_020973	TTAA	2	8	27543	27550	50 %	50 %	0 %	0 %	478462186
78	NC_020973	AAAG	2	8	27593	27600	75 %	0 %	25 %	0 %	478462186
79	NC_020973	GGGC	2	8	27873	27880	0 %	0 %	75 %	25 %	478462186
80	NC_020973	GTTT	2	8	28156	28163	0 %	75 %	25 %	0 %	478462187
81	NC_020973	CAGA	2	8	28178	28185	50 %	0 %	25 %	25 %	478462187
82	NC_020973	ATTG	2	8	28537	28544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020973	CTTT	2	8	30150	30157	0 %	75 %	0 %	25 %	478462189
84	NC_020973	TTTG	2	8	30165	30172	0 %	75 %	25 %	0 %	478462189
85	NC_020973	TTGT	2	8	30200	30207	0 %	75 %	25 %	0 %	478462189
86	NC_020973	TGGC	2	8	30363	30370	0 %	25 %	50 %	25 %	478462189
87	NC_020973	AAAG	2	8	30923	30930	75 %	0 %	25 %	0 %	478462190
88	NC_020973	AAAC	2	8	30993	31000	75 %	0 %	0 %	25 %	478462190
89	NC_020973	GATG	2	8	31136	31143	25 %	25 %	50 %	0 %	478462190
90	NC_020973	GATA	2	8	32245	32252	50 %	25 %	25 %	0 %	478462192
91	NC_020973	TGAT	2	8	34740	34747	25 %	50 %	25 %	0 %	478462195
92	NC_020973	AAGA	3	12	34868	34879	75 %	0 %	25 %	0 %	478462195
93	NC_020973	AAGC	2	8	35088	35095	50 %	0 %	25 %	25 %	478462196
94	NC_020973	GTTC	2	8	35121	35128	0 %	50 %	25 %	25 %	478462196
95	NC_020973	GGCA	2	8	35500	35507	25 %	0 %	50 %	25 %	478462197
96	NC_020973	TGCT	2	8	35910	35917	0 %	50 %	25 %	25 %	478462197
97	NC_020973	TTGG	2	8	36142	36149	0 %	50 %	50 %	0 %	478462197
98	NC_020973	AGAT	2	8	36862	36869	50 %	25 %	25 %	0 %	478462197
99	NC_020973	CTTT	2	8	37234	37241	0 %	75 %	0 %	25 %	478462198
100	NC_020973	ATGA	2	8	37724	37731	50 %	25 %	25 %	0 %	478462198
101	NC_020973	TAGG	2	8	37883	37890	25 %	25 %	50 %	0 %	478462198
102	NC_020973	CAAT	2	8	38067	38074	50 %	25 %	0 %	25 %	478462198
103	NC_020973	AATG	2	8	38854	38861	50 %	25 %	25 %	0 %	478462198
104	NC_020973	AGAA	2	8	39691	39698	75 %	0 %	25 %	0 %	478462199
105	NC_020973	AAGA	2	8	39743	39750	75 %	0 %	25 %	0 %	478462199
106	NC_020973	ATCC	2	8	39751	39758	25 %	25 %	0 %	50 %	478462199
107	NC_020973	TAAT	2	8	39962	39969	50 %	50 %	0 %	0 %	478462199
108	NC_020973	GTGC	2	8	42050	42057	0 %	25 %	50 %	25 %	478462201
109	NC_020973	AGAA	2	8	42469	42476	75 %	0 %	25 %	0 %	478462201
110	NC_020973	GGAT	2	8	42621	42628	25 %	25 %	50 %	0 %	478462201
111	NC_020973	AAAC	2	8	43760	43767	75 %	0 %	0 %	25 %	478462203
112	NC_020973	CAAT	2	8	43964	43971	50 %	25 %	0 %	25 %	478462203
113	NC_020973	TGTT	2	8	44344	44351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020973	AATA	2	8	44582	44589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020973	ATTT	2	8	44720	44727	25 %	75 %	0 %	0 %	478462204
116	NC_020973	GCTC	2	8	45028	45035	0 %	25 %	25 %	50 %	478462204
117	NC_020973	TTCT	2	8	45170	45177	0 %	75 %	0 %	25 %	478462204
118	NC_020973	TTGA	2	8	45770	45777	25 %	50 %	25 %	0 %	478462205
119	NC_020973	TGTT	2	8	45942	45949	0 %	75 %	25 %	0 %	478462205
120	NC_020973	CTAT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	0 %	25 %	478462205
121	NC_020973	TGTT	2	8	46001	46008	0 %	75 %	25 %	0 %	478462205
122	NC_020973	CTAT	2	8	46297	46304	25 %	50 %	0 %	25 %	478462205
123	NC_020973	AAGA	2	8	46792	46799	75 %	0 %	25 %	0 %	478462206
124	NC_020973	AAGA	2	8	46849	46856	75 %	0 %	25 %	0 %	478462206
125	NC_020973	AAAG	2	8	46889	46896	75 %	0 %	25 %	0 %	478462206
126	NC_020973	AAGA	2	8	47004	47011	75 %	0 %	25 %	0 %	478462206
127	NC_020973	ACTT	2	8	47265	47272	25 %	50 %	0 %	25 %	478462206
128	NC_020973	ATGG	2	8	47891	47898	25 %	25 %	50 %	0 %	478462206
129	NC_020973	AGGA	2	8	47922	47929	50 %	0 %	50 %	0 %	478462206
130	NC_020973	GAAC	2	8	48469	48476	50 %	0 %	25 %	25 %	478462206
131	NC_020973	AAGT	2	8	48504	48511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020973	AACA	2	8	48714	48721	75 %	0 %	0 %	25 %	478462207
133	NC_020973	CTTT	2	8	48910	48917	0 %	75 %	0 %	25 %	478462207
134	NC_020973	CTTT	2	8	49795	49802	0 %	75 %	0 %	25 %	478462208
135	NC_020973	GTAG	2	8	49813	49820	25 %	25 %	50 %	0 %	478462208
136	NC_020973	GAAG	2	8	51243	51250	50 %	0 %	50 %	0 %	478462209
137	NC_020973	TTCA	2	8	51665	51672	25 %	50 %	0 %	25 %	478462209
138	NC_020973	TCTA	2	8	51882	51889	25 %	50 %	0 %	25 %	478462209
139	NC_020973	TATT	2	8	52768	52775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020973	GGAA	2	8	52999	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	478462211
141	NC_020973	TTAA	2	8	53740	53747	50 %	50 %	0 %	0 %	478462211
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143	NC_020973	TTTA	2	8	54114	54121	25 %	75 %	0 %	0 %	478462212
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