MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 1225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020973	AAG	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020973	TGG	2	6	1833	1838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020973	CTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020973	TAA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020973	GCA	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020973	AGA	2	6	5679	5684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020973	CTT	2	6	6959	6964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020973	GAA	2	6	7674	7679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020973	TTA	2	6	7751	7756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020973	GAA	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020973	ATG	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020973	TTC	3	9	9774	9782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020973	ATC	2	6	9790	9795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020973	GAA	2	6	9828	9833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020973	CCT	2	6	9929	9934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020973	TAG	2	6	11792	11797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020973	CTT	2	6	11842	11847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020973	TCA	2	6	11879	11884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020973	AAT	2	6	13865	13870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020973	ACC	2	6	13876	13881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_020973	ATT	2	6	13973	13978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020973	AAG	2	6	13990	13995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020973	TTA	2	6	14016	14021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020973	AAG	2	6	14050	14055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020973	AAC	2	6	14134	14139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020973	CTT	2	6	15557	15562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020973	GTT	2	6	18230	18235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020973	AGA	2	6	18976	18981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020973	AAT	3	9	19038	19046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020973	TCT	2	6	19066	19071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020973	CTT	3	9	20492	20500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020973	GAA	2	6	21017	21022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020973	GGA	2	6	21211	21216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020973	AGA	3	9	21251	21259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020973	TGG	2	6	21470	21475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020973	AAC	2	6	21509	21514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020973	AGC	2	6	21526	21531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020973	TGA	2	6	21727	21732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020973	TCC	2	6	21844	21849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020973	AAT	2	6	22020	22025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020973	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020973	ACT	2	6	27126	27131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020973	TAA	2	6	28479	28484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020973	AGA	2	6	28591	28596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020973	CTG	2	6	33720	33725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020973	CTT	2	6	37076	37081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020973	TAA	2	6	39414	39419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020973	AAG	2	6	39455	39460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020973	CTC	2	6	40732	40737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020973	AAG	2	6	40817	40822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020973	GTT	2	6	42824	42829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020973	AAG	2	6	42864	42869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020973	ATG	2	6	42974	42979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020973	GAG	2	6	42988	42993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020973	ACC	2	6	43132	43137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020973	GAT	2	6	43203	43208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020973	AAG	2	6	43209	43214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020973	GGA	2	6	43261	43266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020973	TAA	2	6	43359	43364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020973	AAG	2	6	44499	44504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020973	GGA	2	6	44543	44548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020973	ACT	2	6	44590	44595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020973	AAG	2	6	46441	46446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020973	TAA	2	6	48513	48518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020973	GAA	2	6	48529	48534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020973	TGT	2	6	48589	48594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020973	GTC	2	6	49267	49272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020973	AAG	2	6	49289	49294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020973	TAT	2	6	49318	49323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020973	AGA	2	6	50090	50095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020973	AAG	2	6	50152	50157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020973	TCT	2	6	50166	50171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020973	ACT	2	6	50207	50212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020973	AAT	2	6	50242	50247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020973	GTT	2	6	50265	50270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020973	GCC	2	6	50311	50316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020973	ATT	2	6	50360	50365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020973	CAA	2	6	50379	50384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020973	ATA	2	6	51915	51920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020973	TAA	2	6	51936	51941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020973	AGT	3	9	52004	52012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020973	GAT	2	6	52717	52722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020973	AAG	2	6	52795	52800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020973	AAT	2	6	52822	52827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020973	ATT	2	6	52834	52839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020973	AAG	2	6	61324	61329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020973	AGG	2	6	61332	61337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020973	ACA	2	6	69120	69125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020973	AGA	2	6	72315	72320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020973	CGT	2	6	72363	72368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020973	AAG	2	6	75156	75161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020973	ACT	2	6	75171	75176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020973	AGT	2	6	75207	75212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020973	CTT	2	6	77176	77181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020973	GAG	3	9	78936	78944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020973	AGG	2	6	78967	78972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020973	ACC	2	6	79018	79023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_020973	TTA	2	6	79670	79675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020973	CAT	2	6	79870	79875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020973	TAG	2	6	79888	79893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020973	TTC	2	6	79922	79927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020973	GTT	2	6	79940	79945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020973	GTT	2	6	79982	79987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020973	ATT	2	6	79991	79996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020973	AGG	2	6	80121	80126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020973	TAG	2	6	80193	80198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020973	GTG	2	6	85539	85544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020973	GTA	2	6	85563	85568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020973	AGC	2	6	85635	85640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020973	ATT	2	6	88499	88504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020973	AAC	2	6	88590	88595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020973	ATT	2	6	91005	91010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020973	GAA	2	6	91024	91029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020973	AAG	3	9	91064	91072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020973	AGT	2	6	92418	92423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020973	GGA	2	6	92447	92452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020973	GTT	2	6	93364	93369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020973	TGA	2	6	93414	93419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020973	AGA	2	6	93432	93437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020973	GAG	2	6	93457	93462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020973	AGA	2	6	93483	93488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020973	CCA	2	6	93514	93519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020973	AAG	2	6	93542	93547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020973	GAA	2	6	93578	93583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020973	TGA	2	6	93634	93639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020973	TAA	2	6	93664	93669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020973	AGC	2	6	93783	93788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020973	AGT	2	6	93815	93820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020973	TGA	2	6	93940	93945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020973	TAA	2	6	94066	94071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020973	TAA	2	6	94489	94494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020973	TAA	2	6	94562	94567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020973	ATT	3	9	94779	94787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020973	GAA	2	6	100471	100476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020973	TTA	2	6	102579	102584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020973	TCT	2	6	103865	103870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020973	TAA	3	9	107291	107299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020973	CTT	2	6	107335	107340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020973	CTC	2	6	114415	114420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_020973	ATT	2	6	114511	114516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020973	ATG	2	6	116240	116245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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