MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa1 complete genome

Total Repeats: 2364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020970	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478460355
2	NC_020970	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	478460355
3	NC_020970	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	478460355
4	NC_020970	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020970	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	478460358
6	NC_020970	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	478460358
7	NC_020970	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	478460359
8	NC_020970	TC	3	6	5864	5869	0 %	50 %	0 %	50 %	478460360
9	NC_020970	GA	3	6	5875	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	478460360
10	NC_020970	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	478460360
11	NC_020970	TG	3	6	6132	6137	0 %	50 %	50 %	0 %	478460360
12	NC_020970	AG	3	6	6540	6545	50 %	0 %	50 %	0 %	478460360
13	NC_020970	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020970	AC	3	6	8248	8253	50 %	0 %	0 %	50 %	478460362
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19	NC_020970	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478460365
20	NC_020970	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020970	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478460366
22	NC_020970	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478460366
23	NC_020970	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478460367
24	NC_020970	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478460367
25	NC_020970	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478460367
26	NC_020970	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020970	TA	4	8	14162	14169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40	NC_020970	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	478460372
41	NC_020970	GA	3	6	19363	19368	50 %	0 %	50 %	0 %	478460372
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113	NC_020970	TC	3	6	44406	44411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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