MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020969	TGTGA	2	10	3881	3890	20 %	40 %	40 %	0 %	478472968
2	NC_020969	TTGAA	2	10	4237	4246	40 %	40 %	20 %	0 %	478472969
3	NC_020969	GAGAA	2	10	4531	4540	60 %	0 %	40 %	0 %	478472969
4	NC_020969	GAAAA	2	10	4968	4977	80 %	0 %	20 %	0 %	478472969
5	NC_020969	TTACA	2	10	5123	5132	40 %	40 %	0 %	20 %	478472969
6	NC_020969	GTCTT	2	10	5819	5828	0 %	60 %	20 %	20 %	478472970
7	NC_020969	TGGTA	2	10	8291	8300	20 %	40 %	40 %	0 %	478472972
8	NC_020969	CGAAA	2	10	9699	9708	60 %	0 %	20 %	20 %	478472973
9	NC_020969	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478472974
10	NC_020969	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478472975
11	NC_020969	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478472975
12	NC_020969	AAGAA	2	10	12394	12403	80 %	0 %	20 %	0 %	478472976
13	NC_020969	AAAGA	2	10	13792	13801	80 %	0 %	20 %	0 %	478472977
14	NC_020969	GATTT	2	10	15639	15648	20 %	60 %	20 %	0 %	478472979
15	NC_020969	CGTTC	2	10	16750	16759	0 %	40 %	20 %	40 %	478472980
16	NC_020969	GCTTC	2	10	17123	17132	0 %	40 %	20 %	40 %	478472980
17	NC_020969	GAAGG	2	10	17494	17503	40 %	0 %	60 %	0 %	478472980
18	NC_020969	GTTGT	2	10	20920	20929	0 %	60 %	40 %	0 %	478472983
19	NC_020969	AAGAT	2	10	22032	22041	60 %	20 %	20 %	0 %	478472984
20	NC_020969	TTTGC	2	10	22643	22652	0 %	60 %	20 %	20 %	478472984
21	NC_020969	GGAAA	2	10	24397	24406	60 %	0 %	40 %	0 %	478472984
22	NC_020969	AGAGG	2	10	26122	26131	40 %	0 %	60 %	0 %	478472985
23	NC_020969	GGAGA	2	10	27901	27910	40 %	0 %	60 %	0 %	478472986
24	NC_020969	ATCCG	2	10	28652	28661	20 %	20 %	20 %	40 %	478472988
25	NC_020969	AGGGT	2	10	29170	29179	20 %	20 %	60 %	0 %	478472988
26	NC_020969	CCTAT	2	10	30210	30219	20 %	40 %	0 %	40 %	478472989
27	NC_020969	AAGGA	2	10	31010	31019	60 %	0 %	40 %	0 %	478472990
28	NC_020969	GAGCT	2	10	32049	32058	20 %	20 %	40 %	20 %	478472991
29	NC_020969	TCAGT	2	10	36289	36298	20 %	40 %	20 %	20 %	478472997
30	NC_020969	CTATT	2	10	36723	36732	20 %	60 %	0 %	20 %	478472997
31	NC_020969	TCCTA	2	10	36770	36779	20 %	40 %	0 %	40 %	478472997
32	NC_020969	ACGAT	2	10	38686	38695	40 %	20 %	20 %	20 %	478472998
33	NC_020969	TTTGA	2	10	39051	39060	20 %	60 %	20 %	0 %	478472998
34	NC_020969	AGCAA	2	10	42701	42710	60 %	0 %	20 %	20 %	478473001
35	NC_020969	CGATG	2	10	42758	42767	20 %	20 %	40 %	20 %	478473001
36	NC_020969	TTTAT	2	10	44831	44840	20 %	80 %	0 %	0 %	478473005
37	NC_020969	CTTTC	2	10	46928	46937	0 %	60 %	0 %	40 %	478473007
38	NC_020969	AGTTT	2	10	47467	47476	20 %	60 %	20 %	0 %	478473007
39	NC_020969	CTTTT	2	10	50630	50639	0 %	80 %	0 %	20 %	478473010
40	NC_020969	CCGTA	2	10	54296	54305	20 %	20 %	20 %	40 %	478473013
41	NC_020969	TTATC	2	10	55699	55708	20 %	60 %	0 %	20 %	478473014
42	NC_020969	GTTGT	2	10	56767	56776	0 %	60 %	40 %	0 %	478473015
43	NC_020969	GAGCA	2	10	60212	60221	40 %	0 %	40 %	20 %	478473017
44	NC_020969	TGTGA	2	10	62661	62670	20 %	40 %	40 %	0 %	478473019
45	NC_020969	AGTGA	2	10	64182	64191	40 %	20 %	40 %	0 %	478473020
46	NC_020969	CCTTC	2	10	64456	64465	0 %	40 %	0 %	60 %	478473020
47	NC_020969	AGGAG	2	10	66684	66693	40 %	0 %	60 %	0 %	478473022
48	NC_020969	GTTAA	2	10	66814	66823	40 %	40 %	20 %	0 %	478473022
49	NC_020969	GGAGC	2	10	70062	70071	20 %	0 %	60 %	20 %	478473025
50	NC_020969	GCGAT	2	10	70252	70261	20 %	20 %	40 %	20 %	478473025
51	NC_020969	CTCTT	2	10	70606	70615	0 %	60 %	0 %	40 %	478473025
52	NC_020969	AGGGG	2	10	71252	71261	20 %	0 %	80 %	0 %	478473025
53	NC_020969	AAGAA	2	10	71294	71303	80 %	0 %	20 %	0 %	478473025
54	NC_020969	ATTGG	2	10	72584	72593	20 %	40 %	40 %	0 %	478473027
55	NC_020969	GAAAA	2	10	73656	73665	80 %	0 %	20 %	0 %	478473027
56	NC_020969	TGGGA	2	10	74073	74082	20 %	20 %	60 %	0 %	478473028
57	NC_020969	TATTT	2	10	76600	76609	20 %	80 %	0 %	0 %	478473029
58	NC_020969	TGTCT	2	10	80393	80402	0 %	60 %	20 %	20 %	478473032
59	NC_020969	TTACT	2	10	80900	80909	20 %	60 %	0 %	20 %	478473032
60	NC_020969	AGAAA	2	10	82290	82299	80 %	0 %	20 %	0 %	478473034
61	NC_020969	GGAAG	2	10	82803	82812	40 %	0 %	60 %	0 %	478473034
62	NC_020969	AGCGA	2	10	85269	85278	40 %	0 %	40 %	20 %	478473036
63	NC_020969	GATCC	2	10	86354	86363	20 %	20 %	20 %	40 %	478473037
64	NC_020969	AGAGC	2	10	87689	87698	40 %	0 %	40 %	20 %	478473038
65	NC_020969	TTTTC	2	10	91421	91430	0 %	80 %	0 %	20 %	478473041
66	NC_020969	GGATG	2	10	91681	91690	20 %	20 %	60 %	0 %	478473042
67	NC_020969	CAACA	2	10	93220	93229	60 %	0 %	0 %	40 %	478473043
68	NC_020969	ACAGC	2	10	94264	94273	40 %	0 %	20 %	40 %	478473044
69	NC_020969	GGAAC	2	10	94977	94986	40 %	0 %	40 %	20 %	478473045
70	NC_020969	GGATT	2	10	95877	95886	20 %	40 %	40 %	0 %	478473045
71	NC_020969	CAATC	2	10	96973	96982	40 %	20 %	0 %	40 %	478473047
72	NC_020969	TTTGC	2	10	97107	97116	0 %	60 %	20 %	20 %	478473047
73	NC_020969	ATTCA	2	10	97371	97380	40 %	40 %	0 %	20 %	478473047
74	NC_020969	GATCC	2	10	97630	97639	20 %	20 %	20 %	40 %	478473047
75	NC_020969	AAGCT	2	10	99254	99263	40 %	20 %	20 %	20 %	478473048
76	NC_020969	AGGGG	2	10	99613	99622	20 %	0 %	80 %	0 %	478473048
77	NC_020969	ATAGC	2	10	100312	100321	40 %	20 %	20 %	20 %	478473049
78	NC_020969	TTCCC	2	10	100916	100925	0 %	40 %	0 %	60 %	478473050
79	NC_020969	AGCGA	2	10	103240	103249	40 %	0 %	40 %	20 %	478473052
80	NC_020969	TTTCT	2	10	103598	103607	0 %	80 %	0 %	20 %	478473052
81	NC_020969	CTTCT	2	10	103652	103661	0 %	60 %	0 %	40 %	478473052
82	NC_020969	ATCAT	2	10	104804	104813	40 %	40 %	0 %	20 %	478473053
83	NC_020969	GGCAT	2	10	105512	105521	20 %	20 %	40 %	20 %	478473053
84	NC_020969	AAAGC	2	10	109238	109247	60 %	0 %	20 %	20 %	478473056
85	NC_020969	GCATT	2	10	110398	110407	20 %	40 %	20 %	20 %	478473058
86	NC_020969	TGTTT	2	10	115075	115084	0 %	80 %	20 %	0 %	478473061
87	NC_020969	CATGT	2	10	115453	115462	20 %	40 %	20 %	20 %	478473061
88	NC_020969	TATCG	2	10	116157	116166	20 %	40 %	20 %	20 %	478473061
89	NC_020969	TTTCT	2	10	116673	116682	0 %	80 %	0 %	20 %	478473062
90	NC_020969	AAAGA	2	10	118918	118927	80 %	0 %	20 %	0 %	478473065
91	NC_020969	GCTTC	2	10	122908	122917	0 %	40 %	20 %	40 %	478473068
92	NC_020969	TACAA	2	10	126697	126706	60 %	20 %	0 %	20 %	478473072
93	NC_020969	ATCCA	2	10	129105	129114	40 %	20 %	0 %	40 %	478473075
94	NC_020969	GAAGA	2	10	130655	130664	60 %	0 %	40 %	0 %	478473075
95	NC_020969	AAAAG	2	10	132568	132577	80 %	0 %	20 %	0 %	478473076
96	NC_020969	GATTC	2	10	132899	132908	20 %	40 %	20 %	20 %	478473076
97	NC_020969	ATTGG	2	10	136184	136193	20 %	40 %	40 %	0 %	478473079
98	NC_020969	TGTTT	2	10	136643	136652	0 %	80 %	20 %	0 %	478473080
99	NC_020969	TCCAG	2	10	140389	140398	20 %	20 %	20 %	40 %	478473086
100	NC_020969	GTACA	2	10	141120	141129	40 %	20 %	20 %	20 %	478473087
101	NC_020969	TAGAT	2	10	141493	141502	40 %	40 %	20 %	0 %	478473087
102	NC_020969	AAAAC	2	10	142385	142394	80 %	0 %	0 %	20 %	478473088
103	NC_020969	TGCTA	2	10	143471	143480	20 %	40 %	20 %	20 %	478473090
104	NC_020969	GGAGC	2	10	143518	143527	20 %	0 %	60 %	20 %	478473090
105	NC_020969	CTGGG	2	10	144932	144941	0 %	20 %	60 %	20 %	478473092
106	NC_020969	GTTTT	2	10	145679	145688	0 %	80 %	20 %	0 %	478473093
107	NC_020969	GAACC	2	10	149413	149422	40 %	0 %	20 %	40 %	478473094
108	NC_020969	ATTCT	2	10	152909	152918	20 %	60 %	0 %	20 %	478473098
109	NC_020969	CTGTG	2	10	153113	153122	0 %	40 %	40 %	20 %	478473098
110	NC_020969	TTCTT	2	10	155586	155595	0 %	80 %	0 %	20 %	478473101
111	NC_020969	AGGAA	2	10	160144	160153	60 %	0 %	40 %	0 %	478473105
112	NC_020969	AGAGA	2	10	163375	163384	60 %	0 %	40 %	0 %	478473108
113	NC_020969	AGCAA	2	10	163810	163819	60 %	0 %	20 %	20 %	478473108
114	NC_020969	CAAAA	2	10	167313	167322	80 %	0 %	0 %	20 %	478473110
115	NC_020969	AAGAG	2	10	168146	168155	60 %	0 %	40 %	0 %	478473110
116	NC_020969	GATTG	2	10	168491	168500	20 %	40 %	40 %	0 %	478473110
117	NC_020969	GTTTT	2	10	174973	174982	0 %	80 %	20 %	0 %	478473114
118	NC_020969	TATTG	2	10	174996	175005	20 %	60 %	20 %	0 %	478473114
119	NC_020969	CAGCA	2	10	175355	175364	40 %	0 %	20 %	40 %	478473114
120	NC_020969	TAGGA	2	10	175660	175669	40 %	20 %	40 %	0 %	478473115
121	NC_020969	TGATT	2	10	177587	177596	20 %	60 %	20 %	0 %	478473116
122	NC_020969	TCAAT	2	10	178228	178237	40 %	40 %	0 %	20 %	478473116
123	NC_020969	TTTTC	2	10	178267	178276	0 %	80 %	0 %	20 %	478473116
124	NC_020969	GGAAT	2	10	179833	179842	40 %	20 %	40 %	0 %	478473117
125	NC_020969	AGAGT	2	10	180791	180800	40 %	20 %	40 %	0 %	478473118
126	NC_020969	TTGAA	2	10	181324	181333	40 %	40 %	20 %	0 %	478473119
127	NC_020969	TTGAG	2	10	182884	182893	20 %	40 %	40 %	0 %	478473120
128	NC_020969	GAATG	2	10	182909	182918	40 %	20 %	40 %	0 %	478473120
129	NC_020969	AGAGA	2	10	184952	184961	60 %	0 %	40 %	0 %	478473123
130	NC_020969	ACGAT	2	10	187025	187034	40 %	20 %	20 %	20 %	478473125
131	NC_020969	GGATC	2	10	190116	190125	20 %	20 %	40 %	20 %	478473127
132	NC_020969	CAGAT	2	10	190231	190240	40 %	20 %	20 %	20 %	478473127
133	NC_020969	ACGAT	2	10	191150	191159	40 %	20 %	20 %	20 %	478473128
134	NC_020969	TTGTA	2	10	192128	192137	20 %	60 %	20 %	0 %	478473128
135	NC_020969	TATGC	2	10	192533	192542	20 %	40 %	20 %	20 %	478473129
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