MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 2867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020969	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478472965
2	NC_020969	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	478472965
3	NC_020969	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	478472965
4	NC_020969	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	478472965
5	NC_020969	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	478472965
6	NC_020969	AAGG	2	8	1909	1916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020969	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	478472966
8	NC_020969	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	478472967
9	NC_020969	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	478472967
10	NC_020969	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	478472968
11	NC_020969	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	478472968
12	NC_020969	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	478472968
13	NC_020969	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	478472969
14	NC_020969	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	478472969
15	NC_020969	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	478472969
16	NC_020969	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	478472969
17	NC_020969	TGGA	2	8	5923	5930	25 %	25 %	50 %	0 %	478472970
18	NC_020969	CTTT	2	8	6300	6307	0 %	75 %	0 %	25 %	478472970
19	NC_020969	GGGA	2	8	6815	6822	25 %	0 %	75 %	0 %	478472970
20	NC_020969	GGAG	2	8	6906	6913	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020969	GGTG	2	8	7118	7125	0 %	25 %	75 %	0 %	478472971
22	NC_020969	AAAT	2	8	7184	7191	75 %	25 %	0 %	0 %	478472971
23	NC_020969	TATG	2	8	7555	7562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020969	ATTT	2	8	7696	7703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020969	TTTG	2	8	7788	7795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020969	AAGC	2	8	8421	8428	50 %	0 %	25 %	25 %	478472972
27	NC_020969	ATTG	2	8	8819	8826	25 %	50 %	25 %	0 %	478472973
28	NC_020969	AGCG	2	8	9286	9293	25 %	0 %	50 %	25 %	478472973
29	NC_020969	AAAG	2	8	9307	9314	75 %	0 %	25 %	0 %	478472973
30	NC_020969	CTTT	2	8	9647	9654	0 %	75 %	0 %	25 %	478472973
31	NC_020969	TATT	2	8	9910	9917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020969	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478472974
33	NC_020969	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478472974
34	NC_020969	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478472974
35	NC_020969	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478472975
36	NC_020969	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478472975
37	NC_020969	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478472975
38	NC_020969	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478472975
39	NC_020969	AGAA	2	8	11802	11809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020969	AATG	2	8	12131	12138	50 %	25 %	25 %	0 %	478472976
41	NC_020969	ATTT	2	8	12908	12915	25 %	75 %	0 %	0 %	478472976
42	NC_020969	GTTT	2	8	13163	13170	0 %	75 %	25 %	0 %	478472977
43	NC_020969	ATGC	2	8	13593	13600	25 %	25 %	25 %	25 %	478472977
44	NC_020969	AAGG	2	8	14028	14035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020969	TTGT	2	8	14629	14636	0 %	75 %	25 %	0 %	478472978
46	NC_020969	TTCT	2	8	14800	14807	0 %	75 %	0 %	25 %	478472978
47	NC_020969	ATTT	2	8	15006	15013	25 %	75 %	0 %	0 %	478472978
48	NC_020969	TTTC	2	8	15668	15675	0 %	75 %	0 %	25 %	478472979
49	NC_020969	AAAT	2	8	16150	16157	75 %	25 %	0 %	0 %	478472979
50	NC_020969	CAAA	2	8	16662	16669	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020969	GTAA	2	8	16992	16999	50 %	25 %	25 %	0 %	478472980
52	NC_020969	CTAA	2	8	17185	17192	50 %	25 %	0 %	25 %	478472980
53	NC_020969	AGAA	2	8	17448	17455	75 %	0 %	25 %	0 %	478472980
54	NC_020969	ATTT	2	8	17594	17601	25 %	75 %	0 %	0 %	478472980
55	NC_020969	TGCG	2	8	19116	19123	0 %	25 %	50 %	25 %	478472982
56	NC_020969	CTTT	2	8	19155	19162	0 %	75 %	0 %	25 %	478472982
57	NC_020969	GAAG	2	8	20100	20107	50 %	0 %	50 %	0 %	478472982
58	NC_020969	TTTG	2	8	20126	20133	0 %	75 %	25 %	0 %	478472982
59	NC_020969	TGTA	2	8	20818	20825	25 %	50 %	25 %	0 %	478472983
60	NC_020969	CGCT	2	8	21858	21865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020969	TTAA	2	8	21879	21886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020969	GTTA	2	8	21916	21923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020969	GATC	2	8	21971	21978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020969	TGGG	2	8	22236	22243	0 %	25 %	75 %	0 %	478472984
65	NC_020969	CATT	2	8	23293	23300	25 %	50 %	0 %	25 %	478472984
66	NC_020969	GCTT	2	8	23636	23643	0 %	50 %	25 %	25 %	478472984
67	NC_020969	GGTT	2	8	23684	23691	0 %	50 %	50 %	0 %	478472984
68	NC_020969	TTCT	2	8	24054	24061	0 %	75 %	0 %	25 %	478472984
69	NC_020969	TAAC	2	8	24156	24163	50 %	25 %	0 %	25 %	478472984
70	NC_020969	CATT	2	8	24279	24286	25 %	50 %	0 %	25 %	478472984
71	NC_020969	GGTA	2	8	24649	24656	25 %	25 %	50 %	0 %	478472984
72	NC_020969	TTGA	2	8	25644	25651	25 %	50 %	25 %	0 %	478472985
73	NC_020969	TTCG	2	8	25789	25796	0 %	50 %	25 %	25 %	478472985
74	NC_020969	TAGG	2	8	25868	25875	25 %	25 %	50 %	0 %	478472985
75	NC_020969	TTCC	2	8	25992	25999	0 %	50 %	0 %	50 %	478472985
76	NC_020969	TAGG	2	8	26106	26113	25 %	25 %	50 %	0 %	478472985
77	NC_020969	TTTC	2	8	26541	26548	0 %	75 %	0 %	25 %	478472985
78	NC_020969	GCTT	2	8	26878	26885	0 %	50 %	25 %	25 %	478472985
79	NC_020969	GGAA	2	8	27461	27468	50 %	0 %	50 %	0 %	478472986
80	NC_020969	TTAA	2	8	27534	27541	50 %	50 %	0 %	0 %	478472986
81	NC_020969	AAAG	2	8	27584	27591	75 %	0 %	25 %	0 %	478472986
82	NC_020969	GGGC	2	8	27864	27871	0 %	0 %	75 %	25 %	478472986
83	NC_020969	GTTT	2	8	28147	28154	0 %	75 %	25 %	0 %	478472987
84	NC_020969	CAGA	2	8	28169	28176	50 %	0 %	25 %	25 %	478472987
85	NC_020969	ATTG	2	8	28528	28535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020969	CTTT	2	8	30141	30148	0 %	75 %	0 %	25 %	478472989
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90	NC_020969	AAAG	2	8	30914	30921	75 %	0 %	25 %	0 %	478472990
91	NC_020969	AAAC	2	8	30984	30991	75 %	0 %	0 %	25 %	478472990
92	NC_020969	GATG	2	8	31127	31134	25 %	25 %	50 %	0 %	478472990
93	NC_020969	GATA	2	8	32236	32243	50 %	25 %	25 %	0 %	478472992
94	NC_020969	TGAT	2	8	34731	34738	25 %	50 %	25 %	0 %	478472995
95	NC_020969	AAGA	3	12	34859	34870	75 %	0 %	25 %	0 %	478472995
96	NC_020969	AAGC	2	8	35079	35086	50 %	0 %	25 %	25 %	478472996
97	NC_020969	GTTC	2	8	35112	35119	0 %	50 %	25 %	25 %	478472996
98	NC_020969	GGCA	2	8	35491	35498	25 %	0 %	50 %	25 %	478472997
99	NC_020969	TCGA	2	8	35748	35755	25 %	25 %	25 %	25 %	478472997
100	NC_020969	TGCT	2	8	35901	35908	0 %	50 %	25 %	25 %	478472997
101	NC_020969	TTGG	2	8	36133	36140	0 %	50 %	50 %	0 %	478472997
102	NC_020969	AGAT	2	8	36853	36860	50 %	25 %	25 %	0 %	478472997
103	NC_020969	CTTT	2	8	37226	37233	0 %	75 %	0 %	25 %	478472998
104	NC_020969	ATGA	2	8	37716	37723	50 %	25 %	25 %	0 %	478472998
105	NC_020969	TAGG	2	8	37875	37882	25 %	25 %	50 %	0 %	478472998
106	NC_020969	CAAT	2	8	38059	38066	50 %	25 %	0 %	25 %	478472998
107	NC_020969	AATG	2	8	38846	38853	50 %	25 %	25 %	0 %	478472998
108	NC_020969	AGAA	2	8	39683	39690	75 %	0 %	25 %	0 %	478472999
109	NC_020969	AAGA	2	8	39735	39742	75 %	0 %	25 %	0 %	478472999
110	NC_020969	ATCC	2	8	39743	39750	25 %	25 %	0 %	50 %	478472999
111	NC_020969	TAAT	2	8	39954	39961	50 %	50 %	0 %	0 %	478472999
112	NC_020969	GTGC	2	8	42042	42049	0 %	25 %	50 %	25 %	478473001
113	NC_020969	AGAA	2	8	42461	42468	75 %	0 %	25 %	0 %	478473001
114	NC_020969	GGAT	2	8	42613	42620	25 %	25 %	50 %	0 %	478473001
115	NC_020969	AAAC	2	8	43821	43828	75 %	0 %	0 %	25 %	478473004
116	NC_020969	CAAT	2	8	44025	44032	50 %	25 %	0 %	25 %	478473004
117	NC_020969	TGTT	2	8	44405	44412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020969	AATA	2	8	44644	44651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020969	ATTT	2	8	44782	44789	25 %	75 %	0 %	0 %	478473005
120	NC_020969	GCTC	2	8	45090	45097	0 %	25 %	25 %	50 %	478473005
121	NC_020969	TTCT	2	8	45232	45239	0 %	75 %	0 %	25 %	478473005
122	NC_020969	TTGA	2	8	45832	45839	25 %	50 %	25 %	0 %	478473006
123	NC_020969	TGTT	2	8	46004	46011	0 %	75 %	25 %	0 %	478473006
124	NC_020969	CTAT	2	8	46034	46041	25 %	50 %	0 %	25 %	478473006
125	NC_020969	TGTT	2	8	46063	46070	0 %	75 %	25 %	0 %	478473006
126	NC_020969	CTAT	2	8	46359	46366	25 %	50 %	0 %	25 %	478473006
127	NC_020969	AAGA	2	8	46855	46862	75 %	0 %	25 %	0 %	478473007
128	NC_020969	AAGA	2	8	46912	46919	75 %	0 %	25 %	0 %	478473007
129	NC_020969	AAAG	2	8	46952	46959	75 %	0 %	25 %	0 %	478473007
130	NC_020969	AAGA	2	8	47067	47074	75 %	0 %	25 %	0 %	478473007
131	NC_020969	ACTT	2	8	47328	47335	25 %	50 %	0 %	25 %	478473007
132	NC_020969	ATGG	2	8	47954	47961	25 %	25 %	50 %	0 %	478473007
133	NC_020969	AGGA	2	8	47985	47992	50 %	0 %	50 %	0 %	478473007
134	NC_020969	GAAC	2	8	48532	48539	50 %	0 %	25 %	25 %	478473007
135	NC_020969	AAGT	2	8	48567	48574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020969	AACA	2	8	48776	48783	75 %	0 %	0 %	25 %	478473008
137	NC_020969	CTTT	2	8	48972	48979	0 %	75 %	0 %	25 %	478473008
138	NC_020969	CTTT	2	8	49857	49864	0 %	75 %	0 %	25 %	478473009
139	NC_020969	GTAG	2	8	49875	49882	25 %	25 %	50 %	0 %	478473009
140	NC_020969	GAAG	2	8	51303	51310	50 %	0 %	50 %	0 %	478473010
141	NC_020969	TTCA	2	8	51725	51732	25 %	50 %	0 %	25 %	478473010
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143	NC_020969	TATT	2	8	52660	52667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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