MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 1183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020969	AAG	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020969	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020969	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020969	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020969	GCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020969	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020969	CTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020969	TTA	2	6	7754	7759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020969	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020969	ATG	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020969	TTC	3	9	9776	9784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020969	ATC	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020969	GAA	2	6	9830	9835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020969	CCT	2	6	9931	9936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020969	TAG	2	6	11792	11797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020969	CTT	2	6	11842	11847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020969	TCA	2	6	11879	11884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020969	AAT	2	6	11929	11934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020969	AAT	2	6	13855	13860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020969	ACC	2	6	13866	13871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_020969	ATT	2	6	13963	13968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020969	AAG	2	6	13980	13985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020969	TTA	2	6	14006	14011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020969	AAG	2	6	14040	14045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020969	AAC	2	6	14124	14129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020969	CTT	2	6	15547	15552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020969	GTT	2	6	18220	18225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020969	GAA	2	6	18964	18969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020969	AAT	3	9	19028	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020969	TCT	2	6	19056	19061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020969	CTT	3	9	20482	20490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020969	GAA	2	6	21007	21012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020969	CCT	2	6	21155	21160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020969	GGA	2	6	21201	21206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020969	AGA	3	9	21241	21249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020969	TGG	2	6	21460	21465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020969	AAC	2	6	21499	21504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020969	AGC	2	6	21516	21521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020969	AGG	2	6	21605	21610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020969	TGA	2	6	21717	21722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020969	TCC	2	6	21834	21839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020969	AAT	2	6	22010	22015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020969	TTA	2	6	25163	25168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020969	ACT	2	6	27117	27122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020969	TAA	2	6	28470	28475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020969	AGA	2	6	28582	28587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020969	CTG	2	6	33711	33716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020969	CTT	2	6	37068	37073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020969	TAA	2	6	39406	39411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020969	AAG	2	6	39447	39452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020969	CTC	2	6	40724	40729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020969	AAG	2	6	40809	40814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020969	GAT	2	6	43264	43269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020969	AAG	2	6	43270	43275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020969	GGA	2	6	43322	43327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020969	TAA	2	6	43420	43425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020969	AAG	2	6	44561	44566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020969	GGA	2	6	44605	44610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020969	ACT	2	6	44652	44657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020969	AAG	2	6	46503	46508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020969	TAA	2	6	48576	48581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020969	TGT	2	6	48651	48656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020969	GTC	2	6	49329	49334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020969	AAG	2	6	49351	49356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020969	TAT	2	6	49380	49385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020969	AGA	2	6	50150	50155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020969	AAG	2	6	50212	50217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020969	TCT	2	6	50226	50231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020969	ACT	2	6	50267	50272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020969	AAT	2	6	50302	50307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020969	TGT	2	6	50324	50329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020969	GCC	2	6	50371	50376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020969	ATT	2	6	50420	50425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020969	CAA	2	6	50439	50444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020969	TAA	2	6	51996	52001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020969	AGT	3	9	52064	52072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020969	GAT	2	6	52609	52614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020969	AAG	2	6	52687	52692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020969	AAT	2	6	52714	52719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020969	ATT	2	6	52726	52731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020969	TCC	2	6	57887	57892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_020969	TAA	2	6	61239	61244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020969	AAG	2	6	61301	61306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020969	AGG	2	6	61309	61314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020969	ACA	2	6	69109	69114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020969	TTC	2	6	69616	69621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020969	CTT	3	9	69625	69633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020969	AGA	2	6	72304	72309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020969	CGT	2	6	72352	72357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020969	AAG	2	6	75145	75150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020969	ACT	2	6	75160	75165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020969	AGT	2	6	75196	75201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020969	CTT	2	6	77165	77170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020969	GAG	3	9	78925	78933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020969	AGG	2	6	78956	78961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020969	ACC	2	6	79007	79012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020969	TTA	2	6	79658	79663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020969	CAT	2	6	79859	79864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020969	TAG	2	6	79875	79880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020969	TTC	2	6	79909	79914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020969	GTT	2	6	79927	79932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020969	GTT	2	6	79969	79974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020969	ATT	2	6	79978	79983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020969	AGG	2	6	80108	80113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020969	TAG	2	6	80180	80185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020969	GTG	2	6	85526	85531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020969	GTA	2	6	85550	85555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020969	AGC	2	6	85622	85627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020969	ATT	2	6	88486	88491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020969	AAC	2	6	88577	88582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020969	ATT	2	6	90992	90997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020969	GAA	2	6	91011	91016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020969	AAG	3	9	91051	91059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020969	AGT	2	6	92405	92410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020969	GGA	2	6	92434	92439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020969	GTT	2	6	93351	93356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020969	TGA	2	6	93401	93406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020969	AGA	2	6	93419	93424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020969	GAG	2	6	93444	93449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020969	AGA	2	6	93470	93475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020969	CCA	2	6	93501	93506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020969	AAG	2	6	93529	93534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020969	GAA	2	6	93565	93570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020969	TGA	2	6	93621	93626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020969	TAA	2	6	93651	93656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020969	AGC	2	6	93770	93775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020969	AGT	2	6	93802	93807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020969	GAA	2	6	93916	93921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020969	TGA	2	6	93927	93932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020969	TAA	2	6	94053	94058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020969	TAA	2	6	94475	94480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020969	TAA	2	6	94548	94553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020969	ATT	3	9	94766	94774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020969	GTT	2	6	98128	98133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020969	GAA	2	6	100457	100462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020969	TTA	2	6	102565	102570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020969	TCT	2	6	103851	103856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020969	TAA	3	9	107277	107285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020969	CTT	2	6	107321	107326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020969	CTC	2	6	114389	114394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020969	ATT	2	6	114485	114490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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