MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/363 complete genome

Total Repeats: 12953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020966	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458544
2	NC_020966	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458544
3	NC_020966	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458544
4	NC_020966	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458544
5	NC_020966	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458544
6	NC_020966	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458544
7	NC_020966	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458544
8	NC_020966	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458544
9	NC_020966	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458544
10	NC_020966	GCC	2	6	598	603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478458544
11	NC_020966	TGC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458544
12	NC_020966	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458544
13	NC_020966	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458544
14	NC_020966	TAT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458544
15	NC_020966	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458544
16	NC_020966	AGA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458544
17	NC_020966	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458544
18	NC_020966	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458544
19	NC_020966	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458544
20	NC_020966	CTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458544
21	NC_020966	GAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458544
22	NC_020966	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458544
23	NC_020966	ATG	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458544
24	NC_020966	CCT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458544
25	NC_020966	CTT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458544
26	NC_020966	CAG	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458544
27	NC_020966	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458544
28	NC_020966	ATG	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458545
29	NC_020966	GTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458545
30	NC_020966	TCC	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458545
31	NC_020966	AGC	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458545
32	NC_020966	AGC	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458545
33	NC_020966	AAG	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458545
34	NC_020966	TAC	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458545
35	NC_020966	GCT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458545
36	NC_020966	AAC	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458545
37	NC_020966	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458545
38	NC_020966	AGA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458546
39	NC_020966	ATC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458546
40	NC_020966	TGC	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458546
41	NC_020966	CAT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458546
42	NC_020966	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458546
43	NC_020966	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458546
44	NC_020966	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458546
45	NC_020966	ATC	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458547
46	NC_020966	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458547
47	NC_020966	AAC	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458547
48	NC_020966	GGT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458547
49	NC_020966	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458547
50	NC_020966	TTC	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458547
51	NC_020966	GCA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458547
52	NC_020966	GGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458547
53	NC_020966	CAG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458547
54	NC_020966	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458547
55	NC_020966	GGT	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458547
56	NC_020966	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458547
57	NC_020966	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458547
58	NC_020966	TTG	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458547
59	NC_020966	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458547
60	NC_020966	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458547
61	NC_020966	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458547
62	NC_020966	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458547
63	NC_020966	AAG	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458547
64	NC_020966	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458547
65	NC_020966	GGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458547
66	NC_020966	AAT	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458547
67	NC_020966	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458548
68	NC_020966	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458548
69	NC_020966	GTA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458548
70	NC_020966	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458548
71	NC_020966	GAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458548
72	NC_020966	CGT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458548
73	NC_020966	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458548
74	NC_020966	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458548
75	NC_020966	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458548
76	NC_020966	TTC	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458548
77	NC_020966	TCT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458548
78	NC_020966	AGA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458548
79	NC_020966	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458548
80	NC_020966	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458548
81	NC_020966	CTC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458548
82	NC_020966	AGC	2	6	5624	5629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458548
83	NC_020966	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458549
84	NC_020966	TCT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458549
85	NC_020966	GCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458549
86	NC_020966	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458549
87	NC_020966	ACG	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458549
88	NC_020966	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458549
89	NC_020966	AGA	3	9	5981	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458549
90	NC_020966	GCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458549
91	NC_020966	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458549
92	NC_020966	TGG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458549
93	NC_020966	AGA	3	9	6053	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458549
94	NC_020966	GGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458549
95	NC_020966	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458549
96	NC_020966	GGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458549
97	NC_020966	CTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458549
98	NC_020966	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458549
99	NC_020966	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458549
100	NC_020966	AGG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458550
101	NC_020966	GAA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458550
102	NC_020966	GCA	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458550
103	NC_020966	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458550
104	NC_020966	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458550
105	NC_020966	TCC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458551
106	NC_020966	GTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458551
107	NC_020966	TTA	2	6	8431	8436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458551
108	NC_020966	TTC	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458551
109	NC_020966	GAA	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458552
110	NC_020966	ACC	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458552
111	NC_020966	CTT	2	6	9079	9084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458552
112	NC_020966	GAG	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458552
113	NC_020966	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458552
114	NC_020966	AGG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458552
115	NC_020966	GAA	2	6	9380	9385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458552
116	NC_020966	CAG	2	6	9396	9401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458552
117	NC_020966	TGT	2	6	9467	9472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458552
118	NC_020966	GAG	2	6	9482	9487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458552
119	NC_020966	TAC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458552
120	NC_020966	GTT	2	6	9654	9659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458552
121	NC_020966	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458552
122	NC_020966	GAG	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458552
123	NC_020966	TTA	2	6	9991	9996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458553
124	NC_020966	AGA	2	6	10026	10031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458553
125	NC_020966	TGC	2	6	10256	10261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458553
126	NC_020966	GAA	2	6	10283	10288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458553
127	NC_020966	TCG	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458553
128	NC_020966	TGG	2	6	10366	10371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458553
129	NC_020966	GTA	2	6	10417	10422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458554
130	NC_020966	AGC	2	6	10577	10582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458554
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