MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/363 complete genome

Total Repeats: 2381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020966	GA	3	6	206	211	50 %	0 %	50 %	0 %	478458544
2	NC_020966	TC	3	6	819	824	0 %	50 %	0 %	50 %	478458544
3	NC_020966	AG	3	6	841	846	50 %	0 %	50 %	0 %	478458544
4	NC_020966	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020966	AG	3	6	2747	2752	50 %	0 %	50 %	0 %	478458547
6	NC_020966	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	478458547
7	NC_020966	TC	3	6	5858	5863	0 %	50 %	0 %	50 %	478458549
8	NC_020966	GA	3	6	5869	5874	50 %	0 %	50 %	0 %	478458549
9	NC_020966	AT	3	6	5973	5978	50 %	50 %	0 %	0 %	478458549
10	NC_020966	TG	3	6	6126	6131	0 %	50 %	50 %	0 %	478458549
11	NC_020966	AG	3	6	6534	6539	50 %	0 %	50 %	0 %	478458549
12	NC_020966	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020966	AC	3	6	8243	8248	50 %	0 %	0 %	50 %	478458551
14	NC_020966	AG	3	6	8986	8991	50 %	0 %	50 %	0 %	478458552
15	NC_020966	CT	4	8	9105	9112	0 %	50 %	0 %	50 %	478458552
16	NC_020966	GT	3	6	9187	9192	0 %	50 %	50 %	0 %	478458552
17	NC_020966	GT	3	6	9614	9619	0 %	50 %	50 %	0 %	478458552
18	NC_020966	GA	3	6	10460	10465	50 %	0 %	50 %	0 %	478458554
19	NC_020966	AG	3	6	10677	10682	50 %	0 %	50 %	0 %	478458554
20	NC_020966	TA	3	6	11842	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020966	AG	3	6	11902	11907	50 %	0 %	50 %	0 %	478458555
22	NC_020966	TA	3	6	12462	12467	50 %	50 %	0 %	0 %	478458555
23	NC_020966	TG	3	6	13365	13370	0 %	50 %	50 %	0 %	478458556
24	NC_020966	AG	3	6	13514	13519	50 %	0 %	50 %	0 %	478458556
25	NC_020966	TC	3	6	13648	13653	0 %	50 %	0 %	50 %	478458556
26	NC_020966	AG	4	8	13670	13677	50 %	0 %	50 %	0 %	478458556
27	NC_020966	TA	3	6	13932	13937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020966	TA	4	8	14156	14163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020966	AC	3	6	14999	15004	50 %	0 %	0 %	50 %	478458557
30	NC_020966	AG	3	6	16338	16343	50 %	0 %	50 %	0 %	478458558
31	NC_020966	TC	3	6	16378	16383	0 %	50 %	0 %	50 %	478458558
32	NC_020966	GA	3	6	16907	16912	50 %	0 %	50 %	0 %	478458559
33	NC_020966	AG	3	6	16978	16983	50 %	0 %	50 %	0 %	478458559
34	NC_020966	GA	3	6	17762	17767	50 %	0 %	50 %	0 %	478458559
35	NC_020966	AG	3	6	18108	18113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020966	GA	3	6	18121	18126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020966	GA	3	6	18365	18370	50 %	0 %	50 %	0 %	478458560
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39	NC_020966	CT	3	6	19043	19048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020966	TC	3	6	19243	19248	0 %	50 %	0 %	50 %	478458561
41	NC_020966	GA	3	6	19258	19263	50 %	0 %	50 %	0 %	478458561
42	NC_020966	GA	3	6	19357	19362	50 %	0 %	50 %	0 %	478458561
43	NC_020966	AG	3	6	19823	19828	50 %	0 %	50 %	0 %	478458561
44	NC_020966	AG	4	8	20109	20116	50 %	0 %	50 %	0 %	478458561
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48	NC_020966	AG	3	6	21109	21114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020966	GA	3	6	21267	21272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020966	AG	3	6	21784	21789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020966	CT	3	6	21853	21858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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55	NC_020966	GA	3	6	24423	24428	50 %	0 %	50 %	0 %	478458563
56	NC_020966	GA	3	6	24515	24520	50 %	0 %	50 %	0 %	478458563
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61	NC_020966	GA	3	6	26981	26986	50 %	0 %	50 %	0 %	478458564
62	NC_020966	GA	3	6	27105	27110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020966	CT	3	6	27112	27117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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72	NC_020966	GA	3	6	30526	30531	50 %	0 %	50 %	0 %	478458568
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76	NC_020966	GA	3	6	31822	31827	50 %	0 %	50 %	0 %	478458569
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91	NC_020966	AG	3	6	38121	38126	50 %	0 %	50 %	0 %	478458577
92	NC_020966	AG	3	6	38667	38672	50 %	0 %	50 %	0 %	478458577
93	NC_020966	AG	3	6	39194	39199	50 %	0 %	50 %	0 %	478458577
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103	NC_020966	GC	3	6	41480	41485	0 %	0 %	50 %	50 %	478458579
104	NC_020966	GA	3	6	41620	41625	50 %	0 %	50 %	0 %	478458579
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107	NC_020966	GA	4	8	42606	42613	50 %	0 %	50 %	0 %	478458580
108	NC_020966	AG	3	6	42842	42847	50 %	0 %	50 %	0 %	478458580
109	NC_020966	CT	3	6	42908	42913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020966	GA	5	10	43183	43192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_020966	TC	3	6	44234	44239	0 %	50 %	0 %	50 %	478458582
113	NC_020966	TC	3	6	44399	44404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020966	TA	3	6	44552	44557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020966	TC	3	6	45464	45469	0 %	50 %	0 %	50 %	478458583
116	NC_020966	GA	3	6	45947	45952	50 %	0 %	50 %	0 %	478458584
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118	NC_020966	AG	3	6	46176	46181	50 %	0 %	50 %	0 %	478458584
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122	NC_020966	AG	3	6	47062	47067	50 %	0 %	50 %	0 %	478458585
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126	NC_020966	TG	4	8	51981	51988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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