MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/363 complete genome

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020966	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020966	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020966	TA	3	6	11842	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020966	TA	3	6	13932	13937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020966	TA	4	8	14156	14163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020966	AG	3	6	18108	18113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020966	GA	3	6	18121	18126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020966	CT	3	6	19043	19048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020966	AG	3	6	21109	21114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020966	GA	3	6	21267	21272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020966	AG	3	6	21784	21789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020966	CT	3	6	21853	21858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020966	GA	3	6	27105	27110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020966	CT	3	6	27112	27117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020966	TC	3	6	28480	28485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020966	AG	3	6	28563	28568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020966	GA	3	6	36976	36981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020966	AT	3	6	37078	37083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020966	CT	3	6	39345	39350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020966	CT	3	6	40716	40721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020966	CT	3	6	42908	42913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020966	GA	5	10	43183	43192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020966	TC	3	6	44399	44404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020966	TA	3	6	44552	44557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020966	AG	3	6	48634	48639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020966	TG	4	8	51981	51988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020966	GA	3	6	56082	56087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020966	GA	3	6	61298	61303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020966	AG	4	8	65317	65324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020966	TA	3	6	69648	69653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020966	CT	3	6	72384	72389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020966	TA	3	6	85740	85745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020966	TC	3	6	90961	90966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020966	GA	3	6	91093	91098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020966	CT	3	6	93443	93448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020966	GA	3	6	93929	93934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020966	GA	3	6	93971	93976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020966	TA	3	6	94587	94592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020966	TC	3	6	100467	100472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020966	AT	3	6	100518	100523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020966	TA	3	6	107194	107199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020966	TG	3	6	116436	116441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020966	AG	4	8	119023	119030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020966	GA	3	6	120845	120850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020966	TA	3	6	123079	123084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020966	GT	3	6	124069	124074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020966	CT	3	6	128603	128608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020966	TC	3	6	130925	130930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020966	AG	3	6	131002	131007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020966	AG	3	6	131027	131032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020966	AG	4	8	135561	135568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020966	AG	3	6	138673	138678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020966	GA	3	6	138736	138741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020966	AT	3	6	142968	142973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020966	AG	3	6	157774	157779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020966	TC	3	6	172238	172243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020966	AG	3	6	172370	172375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020966	CT	3	6	172388	172393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020966	TG	3	6	178877	178882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020966	GA	3	6	184947	184952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020966	AT	3	6	194362	194367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020966	AG	3	6	198832	198837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020966	TC	3	6	201822	201827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020966	CT	3	6	205580	205585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020966	GA	4	8	208639	208646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020966	CT	4	8	208687	208694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020966	AG	4	8	219957	219964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020966	TA	3	6	221511	221516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020966	CT	3	6	223152	223157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020966	TC	3	6	226153	226158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020966	AG	3	6	226184	226189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020966	TC	3	6	240384	240389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020966	AG	3	6	240410	240415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020966	GT	3	6	245553	245558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020966	GA	3	6	252421	252426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020966	TG	3	6	252531	252536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020966	AG	3	6	253333	253338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020966	TA	3	6	256142	256147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020966	AG	3	6	258423	258428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020966	TC	3	6	258449	258454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020966	AG	3	6	259927	259932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020966	TA	3	6	266290	266295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020966	CA	3	6	268097	268102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020966	TC	3	6	269997	270002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020966	CA	3	6	275348	275353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020966	CT	3	6	275411	275416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020966	TA	3	6	275550	275555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020966	AT	4	8	286110	286117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020966	CT	3	6	286962	286967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020966	TC	4	8	287053	287060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020966	TC	3	6	288744	288749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020966	TC	3	6	288801	288806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020966	CT	3	6	289274	289279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020966	AT	3	6	301289	301294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020966	CA	3	6	303618	303623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020966	GA	3	6	308349	308354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020966	AG	3	6	317555	317560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020966	CT	3	6	349505	349510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020966	CT	3	6	352576	352581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020966	TC	3	6	356802	356807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020966	TC	3	6	360632	360637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020966	CT	3	6	360718	360723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020966	AC	3	6	364051	364056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020966	GA	3	6	365961	365966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020966	TC	3	6	366039	366044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020966	TA	3	6	366240	366245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020966	GT	3	6	369612	369617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020966	CT	4	8	383379	383386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020966	CG	3	6	393217	393222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020966	CA	3	6	394267	394272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020966	TC	3	6	396814	396819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020966	CT	3	6	397304	397309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020966	GA	3	6	397434	397439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020966	GA	3	6	397565	397570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020966	CT	3	6	411662	411667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020966	CT	3	6	412649	412654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020966	CT	3	6	431376	431381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020966	CT	3	6	432399	432404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020966	AG	3	6	432746	432751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020966	GA	3	6	434441	434446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020966	AC	3	6	438439	438444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020966	CT	3	6	442710	442715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020966	AC	3	6	442748	442753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020966	CA	3	6	445217	445222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020966	CT	3	6	446621	446626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020966	TC	3	6	455901	455906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020966	AG	3	6	462043	462048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020966	TC	3	6	468581	468586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020966	AT	3	6	468650	468655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020966	GA	4	8	470024	470031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020966	TA	3	6	470067	470072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020966	GA	3	6	470165	470170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020966	TC	3	6	481898	481903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020966	AC	3	6	487470	487475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020966	GA	4	8	487515	487522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020966	CA	3	6	487552	487557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020966	TC	3	6	487593	487598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020966	AC	3	6	492028	492033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020966	AG	3	6	492190	492195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020966	CT	3	6	492209	492214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020966	AG	3	6	492502	492507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020966	CT	3	6	495488	495493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020966	CT	3	6	496006	496011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020966	TG	3	6	496039	496044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020966	TA	3	6	496152	496157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020966	CT	4	8	501809	501816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020966	CA	3	6	509879	509884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020966	CT	3	6	510817	510822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020966	TA	3	6	516624	516629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020966	AG	3	6	518522	518527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020966	TC	3	6	519368	519373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020966	GA	3	6	519523	519528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020966	AG	3	6	519559	519564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020966	AT	3	6	525790	525795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.