MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020965	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020965	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020965	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020965	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020965	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020965	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020965	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020965	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020965	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020965	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020965	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020965	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020965	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020965	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020965	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020965	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020965	GA	3	6	36984	36989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020965	AT	3	6	37086	37091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020965	CT	3	6	39353	39358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020965	CT	3	6	40724	40729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020965	CT	3	6	42916	42921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020965	GA	5	10	43192	43201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020965	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020965	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020965	AG	3	6	48643	48648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020965	TG	4	8	51991	51998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020965	GA	3	6	56108	56113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020965	GA	3	6	61324	61329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020965	AG	4	8	65349	65356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020965	TA	3	6	69680	69685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020965	CT	3	6	72416	72421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020965	TA	3	6	85777	85782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020965	TC	3	6	90998	91003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020965	GA	3	6	91130	91135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020965	CT	3	6	93480	93485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020965	GA	3	6	94008	94013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020965	TA	3	6	94625	94630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020965	TC	3	6	100506	100511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020965	AT	3	6	100557	100562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020965	TA	3	6	107233	107238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020965	TG	3	6	116475	116480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020965	AG	4	8	119061	119068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020965	GA	3	6	120883	120888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020965	TA	3	6	123118	123123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020965	GT	3	6	124107	124112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020965	CT	3	6	128640	128645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020965	TC	3	6	130962	130967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020965	AG	3	6	131039	131044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020965	AG	3	6	131064	131069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020965	GA	3	6	138788	138793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020965	AT	3	6	143020	143025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020965	GA	3	6	152258	152263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020965	AG	3	6	157823	157828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020965	TC	3	6	172287	172292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020965	AG	3	6	172419	172424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020965	CT	3	6	172437	172442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020965	TG	3	6	178928	178933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020965	GA	3	6	184414	184419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020965	TC	3	6	192529	192534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020965	AT	3	6	192871	192876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020965	AG	3	6	197343	197348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020965	TC	3	6	200334	200339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020965	CT	3	6	204092	204097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020965	GA	4	8	207151	207158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020965	CT	4	8	207199	207206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020965	AG	4	8	218471	218478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020965	TA	3	6	220025	220030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020965	CT	3	6	221665	221670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020965	TC	3	6	224666	224671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020965	AG	3	6	224697	224702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020965	TC	3	6	238897	238902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020965	AG	3	6	238923	238928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020965	CA	3	6	243847	243852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020965	GT	3	6	244064	244069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020965	GA	3	6	250932	250937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020965	TG	3	6	251042	251047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020965	AG	3	6	251844	251849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020965	AG	3	6	252853	252858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020965	TA	3	6	254659	254664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020965	AG	3	6	256940	256945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020965	TC	3	6	256966	256971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020965	AG	3	6	258444	258449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020965	TA	3	6	264807	264812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020965	CA	3	6	266614	266619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020965	CA	3	6	273865	273870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020965	CT	3	6	273928	273933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020965	TA	3	6	274067	274072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020965	AT	4	8	284627	284634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020965	CT	3	6	285479	285484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020965	TC	4	8	285570	285577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020965	TC	3	6	287261	287266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020965	TC	3	6	287318	287323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020965	CT	3	6	287791	287796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020965	AT	3	6	299808	299813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020965	CA	3	6	302137	302142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020965	GA	3	6	306868	306873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020965	AG	3	6	316074	316079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020965	CT	3	6	348032	348037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020965	CT	3	6	351103	351108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020965	TC	3	6	355329	355334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020965	TC	3	6	359159	359164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020965	CT	3	6	359245	359250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020965	AC	3	6	362578	362583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020965	GA	3	6	364488	364493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020965	TC	3	6	364566	364571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020965	TA	3	6	364767	364772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020965	CT	4	8	381795	381802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020965	CG	3	6	391633	391638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020965	CA	3	6	392683	392688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020965	TC	3	6	395230	395235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020965	CT	3	6	395720	395725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020965	GA	3	6	395850	395855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020965	GA	3	6	395981	395986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020965	CT	3	6	410077	410082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020965	CT	3	6	411064	411069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020965	CT	3	6	429794	429799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020965	CT	3	6	430817	430822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020965	AG	3	6	431164	431169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020965	GA	3	6	432859	432864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020965	AC	3	6	436857	436862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020965	CT	3	6	441128	441133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020965	AC	3	6	441166	441171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020965	CA	3	6	443635	443640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020965	CT	3	6	445039	445044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020965	CT	3	6	454321	454326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020965	AG	3	6	460462	460467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020965	TC	3	6	467000	467005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020965	AT	3	6	467069	467074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020965	GA	4	8	468443	468450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020965	TA	3	6	468486	468491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020965	GA	3	6	468584	468589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020965	TC	3	6	480316	480321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020965	AC	3	6	485847	485852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020965	GA	4	8	485892	485899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020965	CA	3	6	485929	485934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020965	TC	3	6	485970	485975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020965	AC	3	6	490405	490410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020965	AG	3	6	490567	490572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020965	CT	3	6	490586	490591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020965	AG	3	6	490879	490884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020965	CT	3	6	493865	493870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020965	CT	3	6	494383	494388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020965	TG	3	6	494416	494421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020965	TA	3	6	494529	494534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020965	CT	4	8	500186	500193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020965	CA	3	6	508256	508261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020965	CT	3	6	509194	509199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020965	TA	3	6	514997	515002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020965	AG	3	6	516895	516900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020965	TC	3	6	517741	517746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020965	GA	3	6	517896	517901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020965	AG	3	6	517932	517937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020965	AT	3	6	524164	524169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020965	GA	3	6	531735	531740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.