MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 plasmid pSotonK1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020963	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478457642
2	NC_020963	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478457643
3	NC_020963	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478457643
4	NC_020963	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478457643
5	NC_020963	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478457643
6	NC_020963	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478457644
7	NC_020963	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478457644
8	NC_020963	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478457644
9	NC_020963	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478457645
10	NC_020963	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478457645
11	NC_020963	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478457645
12	NC_020963	ATTA	2	8	4620	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	478457645
13	NC_020963	CAAA	2	8	5470	5477	75 %	0 %	0 %	25 %	478457646
14	NC_020963	ATCA	2	8	6102	6109	50 %	25 %	0 %	25 %	478457648
15	NC_020963	AATT	2	8	6317	6324	50 %	50 %	0 %	0 %	478457648
16	NC_020963	TCGG	2	8	6388	6395	0 %	25 %	50 %	25 %	478457648
17	NC_020963	CTTC	2	8	6759	6766	0 %	50 %	0 %	50 %	478457649
18	NC_020963	AGTT	2	8	7018	7025	25 %	50 %	25 %	0 %	478457649
19	NC_020963	CCAA	2	8	7087	7094	50 %	0 %	0 %	50 %	478457649
20	NC_020963	CTTC	2	8	7242	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	478457649
21	NC_020963	GATA	2	8	7277	7284	50 %	25 %	25 %	0 %	478457649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.