MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa1 plasmid pSotonIa1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020962	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478460346
2	NC_020962	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478460347
3	NC_020962	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478460347
4	NC_020962	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478460347
5	NC_020962	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478460347
6	NC_020962	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478460348
7	NC_020962	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478460348
8	NC_020962	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478460348
9	NC_020962	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478460349
10	NC_020962	ACTG	2	8	3758	3765	25 %	25 %	25 %	25 %	478460349
11	NC_020962	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478460349
12	NC_020962	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478460349
13	NC_020962	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478460350
14	NC_020962	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478460352
15	NC_020962	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478460352
16	NC_020962	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478460352
17	NC_020962	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478460353
18	NC_020962	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478460353
19	NC_020962	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478460353
20	NC_020962	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478460353
21	NC_020962	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478460353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.