MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa1 plasmid pSotonIa1

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020962	A	6	6	111	116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020962	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	478460346
3	NC_020962	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	478460346
4	NC_020962	T	8	8	580	587	0 %	100 %	0 %	0 %	478460346
5	NC_020962	T	6	6	693	698	0 %	100 %	0 %	0 %	478460346
6	NC_020962	A	7	7	726	732	100 %	0 %	0 %	0 %	478460346
7	NC_020962	A	6	6	1117	1122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020962	T	8	8	1612	1619	0 %	100 %	0 %	0 %	478460347
9	NC_020962	A	6	6	1688	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	478460347
10	NC_020962	T	6	6	1838	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	478460347
11	NC_020962	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	478460347
12	NC_020962	T	7	7	2209	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020962	A	8	8	2772	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	478460348
14	NC_020962	A	6	6	3565	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	478460348
15	NC_020962	A	7	7	4434	4440	100 %	0 %	0 %	0 %	478460349
16	NC_020962	A	6	6	4539	4544	100 %	0 %	0 %	0 %	478460349
17	NC_020962	A	6	6	4683	4688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020962	T	6	6	5460	5465	0 %	100 %	0 %	0 %	478460350
19	NC_020962	A	6	6	5617	5622	100 %	0 %	0 %	0 %	478460351
20	NC_020962	A	6	6	5811	5816	100 %	0 %	0 %	0 %	478460351
21	NC_020962	T	6	6	5912	5917	0 %	100 %	0 %	0 %	478460352
22	NC_020962	G	6	6	5928	5933	0 %	0 %	100 %	0 %	478460352
23	NC_020962	A	6	6	5992	5997	100 %	0 %	0 %	0 %	478460352
24	NC_020962	A	7	7	6129	6135	100 %	0 %	0 %	0 %	478460352
25	NC_020962	T	6	6	6515	6520	0 %	100 %	0 %	0 %	478460352
26	NC_020962	A	7	7	6701	6707	100 %	0 %	0 %	0 %	478460353
27	NC_020962	T	8	8	6718	6725	0 %	100 %	0 %	0 %	478460353
28	NC_020962	A	8	8	6726	6733	100 %	0 %	0 %	0 %	478460353
29	NC_020962	A	6	6	6955	6960	100 %	0 %	0 %	0 %	478460353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.