MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 plasmid pSotonG1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020961	ATTG	2	8	610	617	25 %	50 %	25 %	0 %	478457633
2	NC_020961	TCTG	2	8	1448	1455	0 %	50 %	25 %	25 %	478457634
3	NC_020961	GAAA	2	8	1474	1481	75 %	0 %	25 %	0 %	478457634
4	NC_020961	AGGA	2	8	1607	1614	50 %	0 %	50 %	0 %	478457634
5	NC_020961	TGTT	2	8	1940	1947	0 %	75 %	25 %	0 %	478457634
6	NC_020961	TTCT	2	8	2786	2793	0 %	75 %	0 %	25 %	478457635
7	NC_020961	GTTT	2	8	3312	3319	0 %	75 %	25 %	0 %	478457635
8	NC_020961	AGGA	2	8	3432	3439	50 %	0 %	50 %	0 %	478457635
9	NC_020961	TTTC	2	8	3692	3699	0 %	75 %	0 %	25 %	478457636
10	NC_020961	GGAT	2	8	3812	3819	25 %	25 %	50 %	0 %	478457636
11	NC_020961	TAAA	2	8	4536	4543	75 %	25 %	0 %	0 %	478457636
12	NC_020961	ATTA	2	8	4598	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	478457636
13	NC_020961	CAAA	2	8	5448	5455	75 %	0 %	0 %	25 %	478457637
14	NC_020961	ATCA	2	8	6080	6087	50 %	25 %	0 %	25 %	478457639
15	NC_020961	AATT	2	8	6295	6302	50 %	50 %	0 %	0 %	478457639
16	NC_020961	TCGG	2	8	6366	6373	0 %	25 %	50 %	25 %	478457639
17	NC_020961	CTTC	2	8	6737	6744	0 %	50 %	0 %	50 %	478457640
18	NC_020961	AGTT	2	8	6996	7003	25 %	50 %	25 %	0 %	478457640
19	NC_020961	CCAA	2	8	7065	7072	50 %	0 %	0 %	50 %	478457640
20	NC_020961	CTTC	2	8	7220	7227	0 %	50 %	0 %	50 %	478457640
21	NC_020961	GATA	2	8	7255	7262	50 %	25 %	25 %	0 %	478457640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.