MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 plasmid pSotonG1

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020961	TGG	2	6	12	17	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020961	TGG	2	6	34	39	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020961	TGG	2	6	56	61	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020961	AAC	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457633
5	NC_020961	TCT	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457634
6	NC_020961	TCT	2	6	1142	1147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457634
7	NC_020961	ATC	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457634
8	NC_020961	CCA	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457634
9	NC_020961	TAA	2	6	1434	1439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457634
10	NC_020961	TTG	2	6	1489	1494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457634
11	NC_020961	CCT	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457634
12	NC_020961	TGC	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457634
13	NC_020961	AAG	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457634
14	NC_020961	ATA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457634
15	NC_020961	TGC	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457634
16	NC_020961	AAT	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020961	GTT	2	6	2160	2165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020961	GTT	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457635
19	NC_020961	CAT	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457635
20	NC_020961	GCG	2	6	2420	2425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478457635
21	NC_020961	ATG	2	6	2470	2475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457635
22	NC_020961	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457635
23	NC_020961	GAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457635
24	NC_020961	AGC	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457635
25	NC_020961	TGA	2	6	2825	2830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457635
26	NC_020961	AGC	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457635
27	NC_020961	TTG	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457635
28	NC_020961	TTG	2	6	2998	3003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457635
29	NC_020961	AGA	2	6	3056	3061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457635
30	NC_020961	ATT	2	6	3062	3067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457635
31	NC_020961	GAA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457635
32	NC_020961	AGA	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457635
33	NC_020961	TCT	2	6	3444	3449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457635
34	NC_020961	TCA	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457636
35	NC_020961	GAA	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457636
36	NC_020961	AGC	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457636
37	NC_020961	GTT	2	6	3773	3778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457636
38	NC_020961	AAG	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457636
39	NC_020961	TAG	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457636
40	NC_020961	GAA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457636
41	NC_020961	CAG	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457636
42	NC_020961	TTA	2	6	4340	4345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457636
43	NC_020961	AGA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457636
44	NC_020961	TTC	2	6	4501	4506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457636
45	NC_020961	GAA	2	6	4553	4558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457636
46	NC_020961	ATA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457637
47	NC_020961	AAT	2	6	4766	4771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457637
48	NC_020961	AAT	2	6	4842	4847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457637
49	NC_020961	TCA	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457637
50	NC_020961	TTG	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457637
51	NC_020961	TTG	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457637
52	NC_020961	AAC	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457637
53	NC_020961	TAA	2	6	5045	5050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457637
54	NC_020961	AGG	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457637
55	NC_020961	CAG	2	6	5164	5169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457637
56	NC_020961	ATT	2	6	5172	5177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457637
57	NC_020961	GGC	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478457637
58	NC_020961	GTT	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457637
59	NC_020961	TCA	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457637
60	NC_020961	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457637
61	NC_020961	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457638
62	NC_020961	CAA	2	6	5703	5708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457638
63	NC_020961	ATT	2	6	5726	5731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457638
64	NC_020961	GGA	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457639
65	NC_020961	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457639
66	NC_020961	TCT	2	6	6003	6008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457639
67	NC_020961	CAT	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457639
68	NC_020961	AAC	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457639
69	NC_020961	ATA	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457639
70	NC_020961	AAG	2	6	6271	6276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457639
71	NC_020961	TTG	2	6	6280	6285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457639
72	NC_020961	GAA	3	9	6381	6389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457639
73	NC_020961	GAT	2	6	6420	6425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457639
74	NC_020961	CAA	2	6	6490	6495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457639
75	NC_020961	TCG	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457639
76	NC_020961	TCT	2	6	6527	6532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457639
77	NC_020961	AGA	2	6	6536	6541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457639
78	NC_020961	AGA	2	6	6578	6583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457639
79	NC_020961	AAG	2	6	6728	6733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457640
80	NC_020961	ATT	2	6	6799	6804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457640
81	NC_020961	GAA	2	6	6833	6838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457640
82	NC_020961	AAG	2	6	6846	6851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457640
83	NC_020961	CTT	2	6	6911	6916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457640
84	NC_020961	CAA	2	6	6972	6977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457640
85	NC_020961	TCT	2	6	7016	7021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457640
86	NC_020961	AGA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457640
87	NC_020961	CAT	2	6	7318	7323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457640
88	NC_020961	TCC	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457640
89	NC_020961	TCT	2	6	7360	7365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457640
90	NC_020961	ACA	2	6	7366	7371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457640
91	NC_020961	TCC	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_020961	TTA	2	6	7427	7432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.