MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 plasmid pSotonE8

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020960	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478455833
2	NC_020960	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478455834
3	NC_020960	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478455834
4	NC_020960	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478455834
5	NC_020960	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478455834
6	NC_020960	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478455835
7	NC_020960	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478455835
8	NC_020960	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478455835
9	NC_020960	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478455836
10	NC_020960	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478455836
11	NC_020960	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478455836
12	NC_020960	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478455836
13	NC_020960	ATTT	2	8	4663	4670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020960	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478455837
15	NC_020960	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478455839
16	NC_020960	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478455839
17	NC_020960	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478455839
18	NC_020960	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478455840
19	NC_020960	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478455840
20	NC_020960	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478455840
21	NC_020960	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478455840

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.