MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 plasmid pSotonD6

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020959	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478459445
2	NC_020959	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478459446
3	NC_020959	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478459446
4	NC_020959	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478459446
5	NC_020959	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478459446
6	NC_020959	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478459447
7	NC_020959	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478459447
8	NC_020959	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478459447
9	NC_020959	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478459448
10	NC_020959	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478459448
11	NC_020959	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478459448
12	NC_020959	ATTA	2	8	4620	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	478459448
13	NC_020959	ATTT	2	8	4654	4661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020959	CAAA	2	8	5470	5477	75 %	0 %	0 %	25 %	478459449
15	NC_020959	ATCA	2	8	6102	6109	50 %	25 %	0 %	25 %	478459451
16	NC_020959	AATT	2	8	6317	6324	50 %	50 %	0 %	0 %	478459451
17	NC_020959	TCGG	2	8	6388	6395	0 %	25 %	50 %	25 %	478459451
18	NC_020959	CTTC	2	8	6759	6766	0 %	50 %	0 %	50 %	478459452
19	NC_020959	AGTT	2	8	7018	7025	25 %	50 %	25 %	0 %	478459452
20	NC_020959	CCAA	2	8	7087	7094	50 %	0 %	0 %	50 %	478459452
21	NC_020959	CTTC	2	8	7242	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	478459452
22	NC_020959	GATA	2	8	7277	7284	50 %	25 %	25 %	0 %	478459452
23	NC_020959	TTTA	2	8	7463	7470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.