MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 plasmid pSotonD6

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020959	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	478459445
2	NC_020959	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	478459445
3	NC_020959	T	8	8	580	587	0 %	100 %	0 %	0 %	478459445
4	NC_020959	T	6	6	693	698	0 %	100 %	0 %	0 %	478459445
5	NC_020959	A	7	7	726	732	100 %	0 %	0 %	0 %	478459445
6	NC_020959	T	8	8	1612	1619	0 %	100 %	0 %	0 %	478459446
7	NC_020959	A	6	6	1688	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	478459446
8	NC_020959	T	6	6	1838	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	478459446
9	NC_020959	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	478459446
10	NC_020959	A	8	8	2772	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	478459447
11	NC_020959	A	6	6	3565	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	478459447
12	NC_020959	A	7	7	4434	4440	100 %	0 %	0 %	0 %	478459448
13	NC_020959	A	6	6	4539	4544	100 %	0 %	0 %	0 %	478459448
14	NC_020959	T	6	6	5451	5456	0 %	100 %	0 %	0 %	478459449
15	NC_020959	A	6	6	5608	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	478459450
16	NC_020959	A	6	6	5802	5807	100 %	0 %	0 %	0 %	478459450
17	NC_020959	T	6	6	5903	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	478459451
18	NC_020959	A	6	6	5983	5988	100 %	0 %	0 %	0 %	478459451
19	NC_020959	A	7	7	6120	6126	100 %	0 %	0 %	0 %	478459451
20	NC_020959	T	6	6	6506	6511	0 %	100 %	0 %	0 %	478459451
21	NC_020959	A	7	7	6692	6698	100 %	0 %	0 %	0 %	478459452
22	NC_020959	T	6	6	6711	6716	0 %	100 %	0 %	0 %	478459452
23	NC_020959	A	8	8	6717	6724	100 %	0 %	0 %	0 %	478459452
24	NC_020959	A	6	6	6946	6951	100 %	0 %	0 %	0 %	478459452

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.