MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 plasmid pSotonD5

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020958	A	6	6	110	115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020958	A	6	6	256	261	100 %	0 %	0 %	0 %	478455824
3	NC_020958	T	6	6	521	526	0 %	100 %	0 %	0 %	478455824
4	NC_020958	T	8	8	579	586	0 %	100 %	0 %	0 %	478455824
5	NC_020958	T	6	6	692	697	0 %	100 %	0 %	0 %	478455824
6	NC_020958	A	7	7	725	731	100 %	0 %	0 %	0 %	478455824
7	NC_020958	A	6	6	1116	1121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020958	T	8	8	1611	1618	0 %	100 %	0 %	0 %	478455825
9	NC_020958	A	6	6	1687	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	478455825
10	NC_020958	T	6	6	1837	1842	0 %	100 %	0 %	0 %	478455825
11	NC_020958	A	6	6	1931	1936	100 %	0 %	0 %	0 %	478455825
12	NC_020958	T	7	7	2208	2214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020958	A	8	8	2771	2778	100 %	0 %	0 %	0 %	478455826
14	NC_020958	A	6	6	3564	3569	100 %	0 %	0 %	0 %	478455826
15	NC_020958	A	7	7	4433	4439	100 %	0 %	0 %	0 %	478455827
16	NC_020958	A	6	6	4538	4543	100 %	0 %	0 %	0 %	478455827
17	NC_020958	A	6	6	4673	4678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020958	T	6	6	5450	5455	0 %	100 %	0 %	0 %	478455828
19	NC_020958	A	6	6	5607	5612	100 %	0 %	0 %	0 %	478455829
20	NC_020958	A	6	6	5801	5806	100 %	0 %	0 %	0 %	478455829
21	NC_020958	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	478455830
22	NC_020958	A	6	6	5982	5987	100 %	0 %	0 %	0 %	478455830
23	NC_020958	A	7	7	6119	6125	100 %	0 %	0 %	0 %	478455830
24	NC_020958	T	6	6	6505	6510	0 %	100 %	0 %	0 %	478455830
25	NC_020958	A	7	7	6691	6697	100 %	0 %	0 %	0 %	478455831
26	NC_020958	T	6	6	6710	6715	0 %	100 %	0 %	0 %	478455831
27	NC_020958	A	8	8	6716	6723	100 %	0 %	0 %	0 %	478455831
28	NC_020958	A	6	6	6945	6950	100 %	0 %	0 %	0 %	478455831

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.