MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN plasmid pL3404

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020957	ATTG	2	8	547	554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020957	TCTG	2	8	1385	1392	0 %	50 %	25 %	25 %	478463056
3	NC_020957	GAAA	2	8	1411	1418	75 %	0 %	25 %	0 %	478463056
4	NC_020957	AGGA	2	8	1544	1551	50 %	0 %	50 %	0 %	478463056
5	NC_020957	TGTT	2	8	1877	1884	0 %	75 %	25 %	0 %	478463056
6	NC_020957	TTCT	2	8	2723	2730	0 %	75 %	0 %	25 %	478463057
7	NC_020957	AGGA	2	8	3369	3376	50 %	0 %	50 %	0 %	478463057
8	NC_020957	TTTC	2	8	3629	3636	0 %	75 %	0 %	25 %	478463058
9	NC_020957	GGAT	2	8	3749	3756	25 %	25 %	50 %	0 %	478463058
10	NC_020957	TTGG	2	8	4398	4405	0 %	50 %	50 %	0 %	478463058
11	NC_020957	TAAA	2	8	4473	4480	75 %	25 %	0 %	0 %	478463058
12	NC_020957	ATTA	2	8	4544	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	478463058
13	NC_020957	ATTT	2	8	4578	4585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020957	CAAA	2	8	5394	5401	75 %	0 %	0 %	25 %	478463059
15	NC_020957	ATCA	2	8	6026	6033	50 %	25 %	0 %	25 %	478463061
16	NC_020957	AATT	2	8	6241	6248	50 %	50 %	0 %	0 %	478463061
17	NC_020957	TCGG	2	8	6312	6319	0 %	25 %	50 %	25 %	478463061
18	NC_020957	CTTC	2	8	6683	6690	0 %	50 %	0 %	50 %	478463062
19	NC_020957	AGTT	2	8	6942	6949	25 %	50 %	25 %	0 %	478463062
20	NC_020957	CCAA	2	8	7011	7018	50 %	0 %	0 %	50 %	478463062
21	NC_020957	CTTC	2	8	7166	7173	0 %	50 %	0 %	50 %	478463062
22	NC_020957	GATA	2	8	7201	7208	50 %	25 %	25 %	0 %	478463062

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.