MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 plasmid pL2bUCH2

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020956	ATTG	2	8	605	612	25 %	50 %	25 %	0 %	478454923
2	NC_020956	TCTG	2	8	1443	1450	0 %	50 %	25 %	25 %	478454924
3	NC_020956	GAAA	2	8	1469	1476	75 %	0 %	25 %	0 %	478454924
4	NC_020956	AGGA	2	8	1602	1609	50 %	0 %	50 %	0 %	478454924
5	NC_020956	TGTT	2	8	1935	1942	0 %	75 %	25 %	0 %	478454924
6	NC_020956	TTCT	2	8	2781	2788	0 %	75 %	0 %	25 %	478454925
7	NC_020956	GTTT	2	8	3307	3314	0 %	75 %	25 %	0 %	478454925
8	NC_020956	AGGA	2	8	3427	3434	50 %	0 %	50 %	0 %	478454925
9	NC_020956	TTTC	2	8	3687	3694	0 %	75 %	0 %	25 %	478454926
10	NC_020956	GGAT	2	8	3807	3814	25 %	25 %	50 %	0 %	478454926
11	NC_020956	TTGG	2	8	4456	4463	0 %	50 %	50 %	0 %	478454926
12	NC_020956	TAAA	2	8	4531	4538	75 %	25 %	0 %	0 %	478454926
13	NC_020956	ATTA	2	8	4602	4609	50 %	50 %	0 %	0 %	478454926
14	NC_020956	CAAA	2	8	5452	5459	75 %	0 %	0 %	25 %	478454927
15	NC_020956	ATCA	2	8	6084	6091	50 %	25 %	0 %	25 %	478454929
16	NC_020956	AATT	2	8	6299	6306	50 %	50 %	0 %	0 %	478454929
17	NC_020956	TCGG	2	8	6370	6377	0 %	25 %	50 %	25 %	478454929
18	NC_020956	CTTC	2	8	6741	6748	0 %	50 %	0 %	50 %	478454930
19	NC_020956	AGTT	2	8	7000	7007	25 %	50 %	25 %	0 %	478454930
20	NC_020956	CCAA	2	8	7069	7076	50 %	0 %	0 %	50 %	478454930
21	NC_020956	CTTC	2	8	7224	7231	0 %	50 %	0 %	50 %	478454930
22	NC_020956	GATA	2	8	7259	7266	50 %	25 %	25 %	0 %	478454930

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.