MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 plasmid pL2bUCH2

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020956	TGG	2	6	7	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020956	TGG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020956	TGG	2	6	51	56	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020956	TTG	2	6	79	84	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020956	GTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454923
6	NC_020956	GGA	2	6	755	760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454923
7	NC_020956	AAC	2	6	824	829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454923
8	NC_020956	TCT	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454924
9	NC_020956	TCT	2	6	1137	1142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454924
10	NC_020956	ATC	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454924
11	NC_020956	CCA	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454924
12	NC_020956	TAA	2	6	1429	1434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454924
13	NC_020956	TTG	2	6	1484	1489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454924
14	NC_020956	CCT	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454924
15	NC_020956	TGC	2	6	1757	1762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454924
16	NC_020956	AAG	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454924
17	NC_020956	ATA	2	6	1962	1967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454924
18	NC_020956	TGC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454924
19	NC_020956	AAT	2	6	2146	2151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020956	GTT	2	6	2155	2160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020956	GTT	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454925
22	NC_020956	TCA	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454925
23	NC_020956	GCG	2	6	2415	2420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478454925
24	NC_020956	ATG	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454925
25	NC_020956	GAT	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454925
26	NC_020956	GAA	2	6	2542	2547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454925
27	NC_020956	TGA	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454925
28	NC_020956	AGC	2	6	2865	2870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454925
29	NC_020956	TTG	2	6	2981	2986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454925
30	NC_020956	ATT	2	6	2992	2997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454925
31	NC_020956	AGA	2	6	3051	3056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454925
32	NC_020956	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454925
33	NC_020956	AGA	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454925
34	NC_020956	AGA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454925
35	NC_020956	TCT	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454925
36	NC_020956	TCA	2	6	3571	3576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454926
37	NC_020956	GAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454926
38	NC_020956	AGC	2	6	3713	3718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454926
39	NC_020956	GTT	2	6	3768	3773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454926
40	NC_020956	AAG	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454926
41	NC_020956	TAG	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454926
42	NC_020956	GAA	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454926
43	NC_020956	CAG	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454926
44	NC_020956	AGA	2	6	4470	4475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454926
45	NC_020956	TTC	2	6	4496	4501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454926
46	NC_020956	GAA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454926
47	NC_020956	ATA	2	6	4724	4729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454927
48	NC_020956	AAT	2	6	4770	4775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454927
49	NC_020956	ACA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454927
50	NC_020956	AAT	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454927
51	NC_020956	TGG	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454927
52	NC_020956	TTG	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454927
53	NC_020956	TTG	2	6	5017	5022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454927
54	NC_020956	AAC	2	6	5032	5037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454927
55	NC_020956	TAA	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454927
56	NC_020956	AGG	2	6	5103	5108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454927
57	NC_020956	CAG	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454927
58	NC_020956	ATT	2	6	5176	5181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454927
59	NC_020956	GGC	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478454927
60	NC_020956	GTT	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454927
61	NC_020956	TCA	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454927
62	NC_020956	ATT	2	6	5302	5307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454927
63	NC_020956	TTA	2	6	5567	5572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454928
64	NC_020956	CAA	2	6	5707	5712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454928
65	NC_020956	ATT	2	6	5730	5735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454928
66	NC_020956	GGA	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454929
67	NC_020956	ACA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454929
68	NC_020956	TCT	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454929
69	NC_020956	CAT	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454929
70	NC_020956	AAC	2	6	6184	6189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454929
71	NC_020956	ATA	2	6	6238	6243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454929
72	NC_020956	AAG	2	6	6275	6280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454929
73	NC_020956	TTG	2	6	6284	6289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454929
74	NC_020956	GAA	3	9	6385	6393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454929
75	NC_020956	GAT	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454929
76	NC_020956	CAA	2	6	6494	6499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454929
77	NC_020956	TCG	2	6	6504	6509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454929
78	NC_020956	TCT	2	6	6531	6536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454929
79	NC_020956	AGA	2	6	6540	6545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454929
80	NC_020956	AGA	2	6	6582	6587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454929
81	NC_020956	CTT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454930
82	NC_020956	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454930
83	NC_020956	ATT	2	6	6803	6808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454930
84	NC_020956	GAA	2	6	6837	6842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454930
85	NC_020956	AAG	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454930
86	NC_020956	CTT	2	6	6915	6920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454930
87	NC_020956	CAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454930
88	NC_020956	TCT	2	6	7020	7025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454930
89	NC_020956	AGA	2	6	7279	7284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454930
90	NC_020956	CAT	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454930
91	NC_020956	TCC	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454930
92	NC_020956	TCT	2	6	7364	7369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454930
93	NC_020956	ACA	2	6	7370	7375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454930
94	NC_020956	TCC	2	6	7407	7412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_020956	TAT	2	6	7432	7437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.