MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams3 plasmid pAms3

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020949	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478464853
2	NC_020949	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478464854
3	NC_020949	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478464854
4	NC_020949	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478464854
5	NC_020949	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478464854
6	NC_020949	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478464855
7	NC_020949	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478464855
8	NC_020949	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478464855
9	NC_020949	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478464856
10	NC_020949	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478464856
11	NC_020949	TTGG	2	8	4483	4490	0 %	50 %	50 %	0 %	478464856
12	NC_020949	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478464856
13	NC_020949	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478464856
14	NC_020949	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478464857
15	NC_020949	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478464859
16	NC_020949	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478464859
17	NC_020949	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478464859
18	NC_020949	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478464860
19	NC_020949	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478464860
20	NC_020949	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478464860
21	NC_020949	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478464860
22	NC_020949	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478464860

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.