MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 plasmid pAms2

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020948	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478450417
2	NC_020948	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478450418
3	NC_020948	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478450418
4	NC_020948	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478450418
5	NC_020948	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478450418
6	NC_020948	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478450419
7	NC_020948	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478450419
8	NC_020948	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478450419
9	NC_020948	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478450420
10	NC_020948	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478450420
11	NC_020948	TTGG	2	8	4483	4490	0 %	50 %	50 %	0 %	478450420
12	NC_020948	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478450420
13	NC_020948	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478450420
14	NC_020948	ATTT	2	8	4663	4670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020948	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478450421
16	NC_020948	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478450423
17	NC_020948	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478450423
18	NC_020948	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478450423
19	NC_020948	CTTC	2	8	6768	6775	0 %	50 %	0 %	50 %	478450424
20	NC_020948	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478450424
21	NC_020948	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478450424
22	NC_020948	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478450424
23	NC_020948	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478450424

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.