MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour plasmid pBour

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020947	ATTG	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	478462147
2	NC_020947	TCTG	2	8	1470	1477	0 %	50 %	25 %	25 %	478462148
3	NC_020947	GAAA	2	8	1496	1503	75 %	0 %	25 %	0 %	478462148
4	NC_020947	AGGA	2	8	1629	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	478462148
5	NC_020947	TGTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	25 %	0 %	478462148
6	NC_020947	TTCT	2	8	2808	2815	0 %	75 %	0 %	25 %	478462149
7	NC_020947	GTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	25 %	0 %	478462149
8	NC_020947	AGGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	50 %	0 %	478462149
9	NC_020947	TTTC	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	478462150
10	NC_020947	GGAT	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	478462150
11	NC_020947	TAAA	2	8	4558	4565	75 %	25 %	0 %	0 %	478462150
12	NC_020947	ATTA	2	8	4629	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	478462150
13	NC_020947	ATTT	2	8	4663	4670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020947	CAAA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	478462151
15	NC_020947	ATCA	2	8	6111	6118	50 %	25 %	0 %	25 %	478462153
16	NC_020947	AATT	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	478462153
17	NC_020947	TCGG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	50 %	25 %	478462153
18	NC_020947	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	478462154
19	NC_020947	CCAA	2	8	7096	7103	50 %	0 %	0 %	50 %	478462154
20	NC_020947	CTTC	2	8	7251	7258	0 %	50 %	0 %	50 %	478462154
21	NC_020947	GATA	2	8	7286	7293	50 %	25 %	25 %	0 %	478462154

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.