MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 plasmid pA5291

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020946	TGG	2	6	12	17	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020946	TGG	2	6	34	39	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020946	TGG	2	6	56	61	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020946	TGG	2	6	78	83	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020946	AAC	2	6	851	856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449517
6	NC_020946	TCT	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449518
7	NC_020946	TCT	2	6	1164	1169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449518
8	NC_020946	ATC	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449518
9	NC_020946	CCA	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478449518
10	NC_020946	TAA	2	6	1456	1461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449518
11	NC_020946	TTG	2	6	1511	1516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449518
12	NC_020946	CCT	2	6	1566	1571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449518
13	NC_020946	TGC	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449518
14	NC_020946	AAG	2	6	1816	1821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449518
15	NC_020946	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449518
16	NC_020946	TGC	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449518
17	NC_020946	AAT	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020946	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020946	GTT	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449519
20	NC_020946	CAT	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449519
21	NC_020946	GCG	2	6	2442	2447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478449519
22	NC_020946	ATG	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449519
23	NC_020946	GAT	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449519
24	NC_020946	GAA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449519
25	NC_020946	AGC	2	6	2784	2789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449519
26	NC_020946	TGA	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449519
27	NC_020946	AGC	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449519
28	NC_020946	TTG	2	6	3008	3013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449519
29	NC_020946	ATT	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449519
30	NC_020946	AGA	2	6	3078	3083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449519
31	NC_020946	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449519
32	NC_020946	AGA	2	6	3096	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449519
33	NC_020946	AGA	2	6	3198	3203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449519
34	NC_020946	TCT	2	6	3466	3471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449519
35	NC_020946	TCA	2	6	3598	3603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449520
36	NC_020946	GAA	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449520
37	NC_020946	AGC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449520
38	NC_020946	AAG	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449520
39	NC_020946	TAG	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449520
40	NC_020946	GAA	2	6	4098	4103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449520
41	NC_020946	CAG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449520
42	NC_020946	TTA	2	6	4362	4367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449520
43	NC_020946	AGA	2	6	4497	4502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449520
44	NC_020946	TTC	2	6	4523	4528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449520
45	NC_020946	GAA	2	6	4575	4580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449520
46	NC_020946	ATA	2	6	4751	4756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449521
47	NC_020946	AAT	2	6	4797	4802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449521
48	NC_020946	ACA	2	6	4810	4815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449521
49	NC_020946	AAT	2	6	4873	4878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449521
50	NC_020946	TCA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449521
51	NC_020946	TTG	2	6	4985	4990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449521
52	NC_020946	ATA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449521
53	NC_020946	TTG	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449521
54	NC_020946	AAC	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449521
55	NC_020946	TAA	2	6	5076	5081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449521
56	NC_020946	AGG	2	6	5130	5135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449521
57	NC_020946	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449521
58	NC_020946	ATT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449521
59	NC_020946	GGC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478449521
60	NC_020946	GTT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449521
61	NC_020946	TCA	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449521
62	NC_020946	CAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449521
63	NC_020946	TTA	2	6	5594	5599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449522
64	NC_020946	CAA	2	6	5734	5739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449522
65	NC_020946	ATT	2	6	5757	5762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449522
66	NC_020946	GGA	2	6	5929	5934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449523
67	NC_020946	ACA	2	6	5944	5949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449523
68	NC_020946	TCT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449523
69	NC_020946	CAT	2	6	6158	6163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449523
70	NC_020946	AAC	2	6	6211	6216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449523
71	NC_020946	ATA	2	6	6265	6270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449523
72	NC_020946	AAG	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449523
73	NC_020946	TTG	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449523
74	NC_020946	GAA	3	9	6412	6420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449523
75	NC_020946	GAT	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449523
76	NC_020946	CAA	2	6	6521	6526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449523
77	NC_020946	TCG	2	6	6531	6536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449523
78	NC_020946	TCT	2	6	6558	6563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449523
79	NC_020946	AGA	2	6	6567	6572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449523
80	NC_020946	AGA	2	6	6609	6614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449523
81	NC_020946	AAG	2	6	6759	6764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449524
82	NC_020946	ATT	2	6	6830	6835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449524
83	NC_020946	GAA	2	6	6864	6869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449524
84	NC_020946	AAG	2	6	6877	6882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449524
85	NC_020946	CTT	2	6	6942	6947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449524
86	NC_020946	CAA	2	6	7003	7008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449524
87	NC_020946	TCT	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449524
88	NC_020946	AGA	2	6	7306	7311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449524
89	NC_020946	CAT	2	6	7349	7354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449524
90	NC_020946	TCC	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449524
91	NC_020946	TCT	2	6	7391	7396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449524
92	NC_020946	ACA	2	6	7397	7402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449524
93	NC_020946	TCC	2	6	7434	7439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_020946	TTA	2	6	7458	7463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.