MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/8200/07 complete genome

Total Repeats: 2381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020945	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478470270
2	NC_020945	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478470270
3	NC_020945	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020945	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020945	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478470273
6	NC_020945	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478470273
7	NC_020945	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478470273
8	NC_020945	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478470274
9	NC_020945	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478470275
10	NC_020945	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478470275
11	NC_020945	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478470275
12	NC_020945	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478470275
13	NC_020945	AG	3	6	6537	6542	50 %	0 %	50 %	0 %	478470275
14	NC_020945	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020945	AC	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	478470277
16	NC_020945	AG	3	6	8989	8994	50 %	0 %	50 %	0 %	478470278
17	NC_020945	CT	4	8	9108	9115	0 %	50 %	0 %	50 %	478470278
18	NC_020945	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	478470278
19	NC_020945	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020945	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478470280
21	NC_020945	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478470280
22	NC_020945	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020945	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478470281
24	NC_020945	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478470281
25	NC_020945	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478470282
26	NC_020945	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478470282
27	NC_020945	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478470282
28	NC_020945	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020945	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020945	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478470283
31	NC_020945	CT	3	6	15295	15300	0 %	50 %	0 %	50 %	478470283
32	NC_020945	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478470284
33	NC_020945	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478470284
34	NC_020945	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478470285
35	NC_020945	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478470285
36	NC_020945	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478470285
37	NC_020945	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020945	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020945	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478470286
40	NC_020945	TC	3	6	18822	18827	0 %	50 %	0 %	50 %	478470286
41	NC_020945	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020945	TC	3	6	19250	19255	0 %	50 %	0 %	50 %	478470287
43	NC_020945	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478470287
44	NC_020945	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478470287
45	NC_020945	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478470287
46	NC_020945	AG	4	8	20116	20123	50 %	0 %	50 %	0 %	478470287
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48	NC_020945	AG	3	6	20607	20612	50 %	0 %	50 %	0 %	478470288
49	NC_020945	TG	3	6	20720	20725	0 %	50 %	50 %	0 %	478470288
50	NC_020945	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020945	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020945	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020945	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020945	CT	4	8	22517	22524	0 %	50 %	0 %	50 %	478470289
55	NC_020945	AT	3	6	22787	22792	50 %	50 %	0 %	0 %	478470289
56	NC_020945	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	478470289
57	NC_020945	GA	3	6	24430	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	478470289
58	NC_020945	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478470289
59	NC_020945	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	478470289
60	NC_020945	GA	3	6	26320	26325	50 %	0 %	50 %	0 %	478470290
61	NC_020945	GT	3	6	26340	26345	0 %	50 %	50 %	0 %	478470290
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63	NC_020945	GA	3	6	26988	26993	50 %	0 %	50 %	0 %	478470290
64	NC_020945	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020945	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020945	AT	3	6	27405	27410	50 %	50 %	0 %	0 %	478470291
67	NC_020945	GA	3	6	27619	27624	50 %	0 %	50 %	0 %	478470291
68	NC_020945	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020945	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020945	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	478470293
71	NC_020945	TC	3	6	29046	29051	0 %	50 %	0 %	50 %	478470293
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74	NC_020945	GA	3	6	30533	30538	50 %	0 %	50 %	0 %	478470294
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90	NC_020945	GA	3	6	36984	36989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_020945	CT	3	6	37617	37622	0 %	50 %	0 %	50 %	478470303
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95	NC_020945	AG	3	6	38674	38679	50 %	0 %	50 %	0 %	478470303
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99	NC_020945	AG	3	6	40122	40127	50 %	0 %	50 %	0 %	478470304
100	NC_020945	AG	3	6	40222	40227	50 %	0 %	50 %	0 %	478470304
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103	NC_020945	GC	3	6	41247	41252	0 %	0 %	50 %	50 %	478470305
104	NC_020945	GA	3	6	41412	41417	50 %	0 %	50 %	0 %	478470305
105	NC_020945	TC	3	6	41421	41426	0 %	50 %	0 %	50 %	478470305
106	NC_020945	GC	3	6	41486	41491	0 %	0 %	50 %	50 %	478470305
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108	NC_020945	GA	3	6	41626	41631	50 %	0 %	50 %	0 %	478470305
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110	NC_020945	GA	3	6	42602	42607	50 %	0 %	50 %	0 %	478470306
111	NC_020945	GA	4	8	42612	42619	50 %	0 %	50 %	0 %	478470306
112	NC_020945	AG	3	6	42848	42853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020945	CT	3	6	42914	42919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020945	AG	3	6	43244	43249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020945	TG	3	6	43607	43612	0 %	50 %	50 %	0 %	478470307
116	NC_020945	AC	3	6	44002	44007	50 %	0 %	0 %	50 %	478470308
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118	NC_020945	TC	3	6	44336	44341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020945	TA	3	6	44488	44493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020945	TC	3	6	45400	45405	0 %	50 %	0 %	50 %	478470309
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123	NC_020945	AG	3	6	46112	46117	50 %	0 %	50 %	0 %	478470310
124	NC_020945	AG	4	8	46553	46560	50 %	0 %	50 %	0 %	478470311
125	NC_020945	CT	3	6	46744	46749	0 %	50 %	0 %	50 %	478470311
126	NC_020945	TG	3	6	46945	46950	0 %	50 %	50 %	0 %	478470311
127	NC_020945	AG	3	6	46998	47003	50 %	0 %	50 %	0 %	478470311
128	NC_020945	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020945	AG	3	6	49922	49927	50 %	0 %	50 %	0 %	478470313
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131	NC_020945	TG	4	8	51919	51926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_020945	GA	3	6	53964	53969	50 %	0 %	50 %	0 %	478470317
135	NC_020945	CT	3	6	54281	54286	0 %	50 %	0 %	50 %	478470317
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